曹红艳
- 作品数：23 被引量：106H指数：7
- 供职机构：山西医科大学公共卫生学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金山西省自然科学基金山西省科技攻关计划项目更多>>
- 相关领域：医药卫生理学文化科学生物学更多>>
- 基于多组学数据的透明细胞肾细胞癌预后分子分型研究被引量：2
- 2022年
- 目的探讨关联-信号-注释增强的相似网络融合(association-signal-annotation boosted similarity network fusion,ab-SNF)方法在透明细胞肾细胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)多组学数据整合分子分型中的应用,识别ccRCC不良预后患者,研究不同分型患者的潜在致病基因、通路活性及相关免疫浸润细胞。方法从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据库中下载ccRCC的miRNA、mRNA表达数据及DNA甲基化数据。利用ab-SNF对ccRCC患者多组学数据进行整合分型;采用Cox回归分析模型研究不同分型患者的预后风险;针对不同分型,筛选差异表达mRNA(DEmRNAs)、miRNA(DEmiRNAs)及差异甲基化基因(differentially methylated genes,DMGs),并对重合基因进行相关分析与基因本体(gene ontology,GO)富集分析;最后对不同分型患者进行免疫细胞浸润和通路活性分析。结果ab-SNF将ccRCC患者分为低危组和高危组,其中高危组患者的死亡风险是低危组的1.903倍;筛选出5218个DEmRNAs,107个DEmiRNAs及2625个DMGs。其中,20个差异表达基因受到DEmiRNA调控,567个基因差异表达的同时伴有异常甲基化;588个重合基因富集于有统计学意义的10个GO生物项。此外,筛选出有统计学意义的6种免疫浸润细胞和9条通路。结论ab-SNF能够有效地识别ccRCC亚型,筛选出的ccRCC潜在致病基因、重要通路及相关免疫浸润细胞,可为ccRCC靶向治疗提供新的参考。
- 魏亿芳李灵梅李治房瑞玲曹红艳曹红艳
- 关键词：分子亚型
- 重复测量计数资料的随机效应ZIP模型被引量：1
- 2009年
- 目的探索重复测量0过多计数资料的统计模型。方法将重复测量中的个体当作随机效应引进ZIP模型,建立随机效应ZIP模型。结果模拟研究和实例分析表明,由于随机效应ZIP模型既考虑了个体不同测量值的相关性,又考虑了0过多的问题,结果优于随机效应Poisson回归和固定效应ZIP模型。结论在重复测量计数资料0过多时,宜采用随机效应ZIP模型。
- 曾平曹红艳刘桂芬
- 关键词：计数资料心律不齐
- 潜在类别分析在出生缺陷高危人群识别中的应用被引量：11
- 2016年
- 目的 应用潜在类别分析（latent class analysis,LCA）对具有不同出生缺陷相关因素分布特征的人群进行分类,识别出出生缺陷高危人群,为采取有重点、有针对性的干预措施提供依据。方法 选取近亲结婚、亲属缺陷儿、自然流产史、既往缺陷儿、孕期发热、孕期感冒、居住地存在污染源、孕期用药、育龄9个出生缺陷相关因素作为显变量,进行潜在类别分析,识别出潜在类别,进而对人群进行分类。结果 当潜在类别数目为4时模型拟合最佳,依据各因素在4个潜在类别中的条件概率的分布特征,将类别1~类别4分别命名为：一般人群组、家族缺陷史组、孕期感冒发热组、单纯用药组。对个体进行聚类后,4类人群的出生缺陷率比较,χ~2值为3099.254,P〈0.001。不同潜在类别人群缺陷率有差别。家族缺陷史组（73.7%）,感冒发热组（3.8%）,单纯用药组（2.5%）,一般人群组（1.0%）缺陷率依次降低,其中家族缺陷史组缺陷率最高,提示家族缺陷史组人群为出生缺陷高危人群,应该有重点有针对地进行干预。结论 潜在类别分析可以应用于出生缺陷高危人群识别中。依据各因素在潜在类别中的条件概率的分布特征进行人群的分型,通过比较不同类别人群的缺陷率的差异,识别出生缺陷高危人群,揭示出生缺陷预防的重点人群和内容,为制定出生缺陷预防措施提供依据。
- 李金刘小琴曹红艳张岩波
- 潜在特质模型在疾病易感性评价中的应用被引量：1
- 2017年
- 目的介绍潜在特质模型的原理、方法和技术,探讨潜在特质模型在疾病易感性评价中的应用。方法以出生缺陷数据为实例,采用R 2.5.1软件的Ltm包例证潜在特质模型的构建和分析原理。结果通过对出生缺陷数据进行潜在特质模型拟合,潜在特质得分能够很好地预测评估其发病危险。结论潜在特质模型用于疾病患病风险评价有很好的效果。
- 刘娜石志红曹红艳郭兴萍张岩波
- 卫生统计学贯通式教学方法的应用被引量：2
- 2017年
- 卫生统计学是开展生物医学实验、临床试验、流行病学调查和卫生管理医学研究的重要方法支撑。如何针对不同的资料类型，灵活地采用适宜的统计分析方法，挖掘出有意义的影响因素尤为重要。在卫生统计学习过程中，医学生普遍反映统计方法种类繁多，
- 曹红艳罗艳虹张岩波
- 关键词：卫生统计学教学方法流行病学调查
- 先天性心脏病与孕妇患病史的Poisson回归模型分析被引量：2
- 2015年
- 目的：探讨孕妇既往病史和孕期患病及用药对先天性心脏病发病的影响,为制定有效干预措施提供依据。方法：选取山西省6个县（市）2006-2008年所有出生儿母亲或一级亲属,存活婴儿36 716名为研究对象。问卷调查,采用多因素Poisson回归模型分析母亲既往病史、孕期患病及用药情况对先天性心脏病的影响。结果：Poisson回归分析表明,母亲患心脏病（OR=8.587,90%CI：1.749-42.165）、感冒或发热（OR=2.599,90%CI：1.548-4.363）、先兆流产（OR=6.242,90%CI：2.618-14.881）、生殖系统感染（OR=4.245,90%CI：1.728-10.425）及服用抗生素（OR=2.943,90%CI：1.248-6.940）增加子代先天性心脏病的发病风险。结论：先天性心脏病的发病与母亲既往病史和孕期所患疾病及用药有关,应重视孕期疾病的防治,谨慎用药,预防先天性心脏病的发生。
- 罗艳虹郭兴萍宋春英李红霞张雪娟曹红艳武姣张岩波
- 关键词：先天性心脏病孕期用药POISSON回归
- 基于健康行为过程取向的大学生体育锻炼行为比较被引量：4
- 2017年
- 目的比较不同类型高校大学生体育锻炼行为,为促进大学生体育锻炼行为改善提供参考。方法采用随机整群抽样的方法,抽取山西省理工类、医科类、综合类及财经类4所高校的873名大学生进行体育锻炼情况的问卷调查。结果不同体育锻炼阶段的人数分布整体呈倒U型,意向阶段(32.8%)和准备阶段(23.5%)的人数最多,意向前阶段(21.0%)和维持阶段(7.9%)的人数最少。4类高校大学生体育锻炼态度总量表及行为认知、情感体验、行为控制感3个维度上的得分差异均有统计学意义(F值分别为5.49,8.31,6.78,5.75,P值均<0.01),且财经类高校大学生体育锻炼态度最差。4类高校大学生体育锻炼变化程序除互助联系外,总得分及各维度得分差异均具有统计学意义(P值均<0.01),且财经类高校大学生的体育锻炼行为最差。结论在实施行为干预时,结合健康行为过程取向理论可有效改变大学生体育锻炼行为,但须考虑性别、专业等影响因素。
- 刘咏菊郑晓赵慧宁苏纯惠胡伟红曹红艳张持晨
- 关键词：健康教育身体锻炼
- 基于心力衰竭HMOX2诊断标志物的机器学习模型
- 2023年
- 目的基于生物信息学数据和机器学习技术探索心力衰竭(heart failure,HF)中免疫细胞浸润新型诊断生物标志物,并阐释其潜在作用机制,为HF诊治提供新思路。方法在基因表达综合(gene expression omnibus,GEO)数据库检索获取3个HF免疫细胞浸润组织基因表达数据集,其中GSE5406和GSE84796作为训练数据集,GSE21610作为验证数据集,使用R语言鉴定差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),并进行基因本体论(gene ontology,GO)富集、京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析、疾病本体论(disease ontology,DO)富集、基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、免疫细胞浸润分析。进一步利用最小绝对收缩和选择算子(the least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归、支持向量机递归特征消除(support vector machine recursive feature elimination,SVM-RFE)和随机森林(random forest,RF)三种高效机器学习算法筛选核心基因,同时进行外部验证和受试者操作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC曲线)分析。结果使用三种机器学习算法最终确定HMOX2为诊断HF的关键生物标志物,且具有良好的诊断与预测效能,训练组和验证组诊断的ROC曲线下面积分别为94.3%和83.3%。HF组和正常组的样本免疫测定结果显示幼稚B细胞、CD8T淋巴细胞、中性粒细胞与HF相关。结论HMOX2可能是HF发生、发展的潜在分子靶点,并与HF组织的免疫浸润密切相关。
- 武淑琴王远涵曹红艳曹红艳
- 关键词：心力衰竭生物信息学
- 传承、合作与发展——《中国卫生统计》杂志30年载文知识网络可视化分析被引量：3
- 2014年
- 目的运用文献计量学方法,对《中国卫生统计》杂志1984-2013年所载文献进行分析,分别研究作者、科研机构的合作与发展历程,为卫生统计学科今后的发展提供独特视角。方法利用信息可视化软件Cite SpaceⅢ,对刊登在《中国卫生统计》杂志的6021篇文献,分别绘制作者、科研机构的科学知识图谱,并进行相关分析。结果《中国卫生统计》杂志30年间,出现频次≥10的机构有63所,其中中国医科大学、复旦大学、第四军医大学、山西医科大学排名居前,出现频次均超过150次,且复旦大学、四川大学、第四军医大学等诸多机构形成了密切的合作网络;机构的合作密切程度随着年代的更迭不断增强;1984-2013年,发文量≥9篇的作者共有143人,且作者之间形成了紧密的合作网络。结论经过30年的发展,科研机构之间逐渐形成了复杂的合作网络,但仍需进一步推进跨机构、跨地域的合作。
- 李鹭曹红艳郭海强孙高张岩波
- 关键词：知识网络文献计量学
- 母亲孕早期患病对出生缺陷的随机效应Logistic模型分析被引量：11
- 2016年
- 目的通过调查山西省部分县(市)出生缺陷的现状,重点分析孕早期患病情况对出生缺陷的影响,为制定针对性的预防措施提供依据。方法以山西省6县(市)2006-2008年3年期间所有的出生儿母亲或其一级亲属为调查对象,采用随机效应Logistic模型分析不同地区间的异质性,进一步探讨妊娠妇女孕早期患有感冒、发热、先兆流产、生殖道感染、妊娠呕吐等对出生缺陷的影响。结果随机效应Logistic模型分析结果提示,不同地区间存在组间异质性即组内相关性,考虑了不同地区的差异,出生缺陷的发生与孕早期患发热、感冒、先兆流产密切相关,妊娠早期罹患发热(OR=1.855)、感冒(OR=1.924)、先兆流产(OR=3.361)是出生缺陷的危险因素。结论出生缺陷的发生与孕期患病情况密切相关,应提高妊娠妇女患病情况的重视程度,并尽早采取有效的预防和干预措施,提高生育质量。
- 武姣罗艳虹郭兴萍宋春英曹红艳张岩波
- 关键词：先天畸形妊娠LOGISTIC模型
