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张帅

作品数：1 被引量：0H指数：0
供职机构：上海海事大学信息工程学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇生物学

主题

  • 1篇调控网络
  • 1篇转录
  • 1篇转录调控
  • 1篇网络
  • 1篇网络构建
  • 1篇系统性红斑
  • 1篇系统性红斑狼...
  • 1篇狼疮
  • 1篇基因表达
  • 1篇基因表达数据
  • 1篇红斑
  • 1篇红斑狼疮

机构

  • 1篇上海海事大学
  • 1篇生物化学系

作者

  • 1篇孔薇
  • 1篇牟晓阳
  • 1篇张帅

传媒

  • 1篇河北师范大学...

年份

  • 1篇2016
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
基于矩阵分解技术的系统性红斑狼疮转录调控网络构建
2016年
利用双向聚类方法提高系统性红斑狼疮(systemic lupus erythematosus,SLE)基因表达数据特征基因提取的有效性;预测SLE患病过程中转录因子活性以及对靶基因的调控强度变化,构建和挖掘与SLE发病密切相关的转录调控网络及其生物过程.利用FastICA方法进行双向聚类筛选出800个SLE显著基因,结合转录调控信息选取其中表达显著的转录因子及其靶基因,利用NCA预测SLE发病过程中转录因子活性以及对靶基因调控强度的变化,并构建调控网络.构建了由9个转录因子和47个靶基因所组成的调控网络,结合分子生物学分析发现,转录因子在正常样本和患病样本中的活性有明显的变化趋势,其调控的靶基因的变化符合SLE的病理特征.利用矩阵分解技术进行SLE特征基因提取及转录调控网络构建能够发现多个与炎症反应及免疫系统等密切相关的生物过程,对研究SLE致病机理和相应的生物学实验提供了方法和依据.
孔薇张帅牟晓阳
关键词：系统性红斑狼疮基因表达数据调控网络
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