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基于NMR的绒癌化疗耐药机制的代谢组学研究: 2019年; 绒癌是一种发生于育龄妇女的恶性滋养细胞肿瘤.经甲氨蝶呤、5-氟尿嘧啶等单药或多药联合化疗后,其治愈率通常高达90%.然而耐药仍是绒癌治疗失败的主要原因.目前绒癌耐药的机制尚不明确,前人多从蛋白和转录水平阐述,鲜有涉及代谢物层次的研究.本文采用基于核磁共振(NMR)的代谢组学方法,研究了甲氨蝶呤耐药株JEG3R与敏感株JEG3绒癌细胞及其培养基在代谢物水平上的差异.结果发现JEG3R耐药极可能与糖代谢异常相关,主要表现为耐药株细胞中山梨糖醇的累积,提示醛糖还原酶可能在耐药过程中起重要作用;其次,耐药株细胞中乳酸积累、丙氨酸流入三羧酸循环途径增强;此外,耐药株细胞相比敏感株细胞中氨基酸、核苷酸及磷酸胆碱等必需营养物质的显著性改变,且其变化与绒癌增殖速率正相关.本研究为绒癌的耐药机制研究补充了代谢层次的数据,为后续从分子生物学水平上揭示耐药机制提供了新思路.; 丁来丰张聪聪胡庆宇Olivier EPARDOMichael JSECKL王玉兰吴俊芳; 关键词：绒癌化疗耐药山梨糖醇代谢组学

L_1范数支持向量机在代谢组学中的应用: 2015年; 代谢组学是关于生物体内源性代谢物质的整体及其变化规律的科学,也是一个数据密集型的研究领域,由此使得模式识别在代谢数据处理中有重要作用.L1范数支持向量机(L1-Norm Support Vector Machines,L1-norm SVMs)作为在模式识别领域中准确、稳健的方法,在代谢组学中的应用较少.该文应用L1-norm SVM方法对小鼠感染血吸虫后的代谢数据进行了分析,分析结果显示L1-norm SVM在聚类与特征选择方面具有优势,并表明它在代谢组学领域的应用有着潜力和前景.; 丁国辉孙建强吴俊芳黄慎丁义明

不同性别C57BL/6小鼠肠道胆汁酸组成的差异性研究被引量：9: 2018年; 随着人们对宿主肠道菌群的日益关注,关于胆汁酸与肠道菌群之间复杂关系的研究也越来越多.因肠道组织结构的复杂性和肠道菌群分布差异性,不同肠段胆汁酸的分布、表达及其生物学功能仍有待进一步研究.本文采用基于超高效液相色谱-三重四极杆-质谱联用(UPLC-QqQ-MS)的靶向代谢组分析结合基于核磁共振(NMR)波谱的非靶向代谢组分析方法,通过比较不同性别C57BL/6小鼠肠道各区段胆汁酸及粪样代谢组的变化水平,发现雌、雄小鼠不同肠段中胆汁酸的分布各不相同.另外,肠道下段各胆汁酸的性别差异性更为明显,以盲肠的性别差异性最为显著,这可能与盲肠的菌群微生态更为丰富有关.该研究为不同性别模型小鼠胆汁酸的代谢表型及其与肠道菌群的相互作用提供了基础研究数据.; 张聪聪吴俊芳王玉兰; 关键词：代谢组学胆汁酸 C57BL/6小鼠

代谢组学在寄生虫病程及疾病诊断中的应用: <正>代谢组学(metabonomics)是继基因组学、转录组学和蛋白质组学之后发展起来的一种组学方法,是系统生物学的重要组成部分。核磁共振(Nuclear Magnetic Resonance,NMR)作为代谢组学中重...; 吴俊芳王玉兰唐惠儒; 关键词：核磁共振代谢组学寄生虫感染; 文献传递

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吴俊芳