徐彤
- 作品数：3 被引量：20H指数：3
- 供职机构：大理学院基础医学院更多>>
- 发文基金：博士科研启动基金云南省教育厅科学研究基金重点项目国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生更多>>
- 人MTERF4基因cDNA的克隆及编码蛋白质的生物信息学分析被引量：5
- 2015年
- [目的]克隆人线粒体转录终止因子4（mitochondrial transcription termination factor 4,MTERF4）基因cDNA编码区,预测和分析其编码蛋白质的结构与功能。[方法]采用RT-PCR技术扩增人MTERF4基因cDNA的编码序列,采用生物信息学方法对人MTERF4蛋白进行分析。[结果]人MTERF4基因cDNA编码序列为1 146bp,编码一个由381氨基酸组成的亲水性蛋白质,分子量为45.78 k D,理论等电点为9.49。该蛋白N端1-42个氨基酸为前导肽序列,定位于细胞线粒体。其二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲,包含4个MTERF基序。三级结构预测结果与二级结构相符。蛋白质多重序列比对和聚类分析显示,人MTERF4蛋白与大鼠、小鼠的MTERF4蛋白具有高度同源性,在系统发育树上聚为一类。[结论]人MTERF4基因cDNA的克隆及编码蛋白质的生物信息学分析为进一步研究其生物学功能奠定了理论依据。
- 熊伟杨勇琴张海洋徐彤张晓娟余敏
- 关键词：CDNA克隆生物信息学
- 人核呼吸因子2基因真核表达载体的构建与鉴定被引量：3
- 2014年
- 目的:构建人核呼吸因子2(NRF2-α和NRF2-β)的真核表达载体,并检测其在瞬时转染的人肝癌BEL-7402细胞株的表达水平。方法:根据NCBI数据库中NRF2-α和NRF2-β的基因序列设计引物,通过RT-PCR扩增目的基因并构建带FLAG标签的真核表达载体,瞬时转染BEL-7402细胞后,分别使用半定量RT-PCR技术和Western blot技术检测其mRNA和蛋白质表达水平。结果:通过酶切鉴定和DNA序列分析,证实已成功构建了人NRF2-α和NRF2-β的真核表达载体,并能在瞬时转染的人肝癌BEL-7402细胞中实现基因的过表达。结论:成功构建了人NRF2-α和NRF2-β的真核表达载体,为进一步研究其功能奠定了基础。
- 张海洋冯慕华徐彤徐优余敏孙宝迪熊伟
- 关键词：真核表达载体
- 人线粒体转录终止因子1(hMTERF1)蛋白的生物信息学分析被引量：13
- 2015年
- 为了预测和分析人线粒体转录终止因子1（human mitochondrial transcription termination factor 1,hMTERF1）蛋白的结构与功能。采用生物信息学的方法对hMTERF1进行系统的分析与研究,包括hMTERF1的理化性质、跨膜区和信号肽、亚细胞定位、二级结构功能域、蛋白质的功能分类预测、多重序列比对与系统发育树构建、三级结构建模。结果表明：hMTERF1蛋白分子量为45.78 kD,等电点为9.49,不具有信号肽和跨膜区。该蛋白定位于细胞线粒体,N端1-57个氨基酸为前导肽序列。其二级结构主要为α螺旋和无规则卷曲,包含6个MTERF基序,三级结构显示结果与二级结构预测结果相符。蛋白质多重序列比对和聚类分析显示,hMTERF1蛋白与黑猩猩、大鼠、小鼠等哺乳动物的MTERF1蛋白具有高度同源性,在系统发育树上聚为一簇。hMTERF1的生物信息学分析为进一步探索hMTERF1蛋白的功能提供参考资料和理论依据。
- 熊伟杨勇琴张海洋徐彤左绍远余敏
- 关键词：蛋白质生物信息学
