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刘董敏

作品数:2 被引量:3H指数:1
供职机构:华南农业大学信息学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金广东省科技计划工业攻关项目广东省大学生创新实验项目更多>>
相关领域:生物学更多>>

文献类型

  • 2篇中文期刊文章

领域

  • 2篇生物学

主题

  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇对接
  • 1篇构象
  • 1篇构象变化
  • 1篇白质
  • 1篇DNA
  • 1篇DOT
  • 1篇打分函数

机构

  • 2篇华南农业大学
  • 1篇乐山师范学院

作者

  • 2篇常珊
  • 2篇田绪红
  • 2篇刘董敏
  • 1篇胡建平
  • 1篇温志超

传媒

  • 1篇湖北农业科学
  • 1篇现代生物医学...

年份

  • 1篇2013
  • 1篇2012
2 条 记 录,以下是 1-2
排序方式:
基于DOT的蛋白质-DNA对接研究被引量:1
2013年
采用大分子对接程序DOT对20个具有代表性的蛋白质-DNA体系进行对接,对对接结果就各打分项与体系中的带电性问题和构象变化问题之间的具体关系进行分析。结果表明,采用DOT对大部分蛋白质-DNA体系都找到了精确度较高的对接结果;范德华能和静电能对DOT组合能的贡献反映了蛋白质-DNA体系的天然特性;对接面上允许的碰撞原子个数(NB参数)与蛋白质和DNA结合前后溶剂可达表面变化面积(ASA)呈正比关系。
刘董敏温志超常珊田绪红
关键词:DOT构象变化
蛋白质-核酸对接方法研究进展被引量:3
2012年
分子对接技术作为预测蛋白质-核酸复合物结构的有效方法,为研究在生物学过程中蛋白质-核酸的相互作用提供了重要的工具。本文首先分析了当前蛋白质-核酸对接研究中的主要困难,例如构象变化和核糖磷酸骨架的带电性问题。然后从构象搜索、打分函数、柔性策略三个方面比较和总结了蛋白质-核酸对接中主要的计算方法。最后回顾了蛋白质-核酸对接计算模型的应用,并对未来的工作进行了展望。
刘董敏常珊胡建平田绪红
关键词:打分函数
共1页<1>
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