陈锦文
- 作品数：2 被引量：3H指数：1
- 供职机构：广西大学农学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目国家自然科学基金广西壮族自治区自然科学基金更多>>
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- 杧果MiCO基因的克隆与表达模式分析被引量：3
- 2017年
- 【目的】克隆杧果(Mangifera indica L.)MiCO基因并探讨其表达模式,为深入研究该基因的功能奠定基础。【方法】根据从杧果转录组测序数据中获得一个MiCO基因全长序列信息,设计基因全长引物,克隆具有不同开花习性的‘四季杧’和‘紫花杧’2个品种的MiCO基因全长序列,对其序列进行生物信息学分析,并利用荧光定量PCR技术对MiCO基因在杧果不同组织以及年周期的表达情况进行分析。【结果】序列分析显示,2个杧果品种的MiCO基因c DNA全长均为1 150 bp,都包含1个966 bp的开放阅读框,编码322个氨基酸,等电点为5.8,‘四季杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.30 ku,‘紫花杧’品种的MiCO蛋白分子质量为35.22 ku;MiCO基因编码的蛋白具有典型的CO同源蛋白结构,包括B-box1、B-box2和CCT结构域;系统进化树表明,杧果MiCO蛋白属于第一类CO蛋白,与拟南芥(Arabidopsis thaliana)At COL4相似性最高而聚类到一起。基因表达分析表明,MiCO基因在杧果不同组织中均表达,但不同组织的表达水平存在差异。年周期表达分析表明,MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,而且在来年的5—6月还存在一个小的表达高峰期,但2个品种不同组织中MiCO基因表达存在差异。【结论】克隆获得杧果MiCO基因全长序列,发现2个具有不同开花习性的杧果品种的MiCO基因核苷酸和氨基酸序列高度同源,只存在少许差异。MiCO基因在杧果成花转变期高度表达,说明MiCO基因与杧果成花关系密切。
- 徐趁罗聪余海霞陈锦文何新华王博方中斌
- 关键词：杧果克隆
- 芒果MiCOL1A和MiCOL1B基因克隆与表达模式分析
- CONSTANS（CO）是植物开花光周期途径的关键基因。在前期研究的基础上,我们从四季蜜芒转录组数据中挖掘获得了2个CO全长序列基因,命名为MiCOL1A和MiCOL1B。生物信息学分析显示,2个CO基因编码区序列长度分...
- 张秀娟罗聪徐趁余海霞陈锦文樊琰何新华
- 关键词：芒果生物信息学分析
- 文献传递
