陈小明
- 作品数：5 被引量：31H指数：3
- 供职机构：集美大学水产学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 大黄鱼高温适应的转录组学分析
- 为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,本实验利用Illumina Hiseq2500的125pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序.对照组(3个生物学重复)和高温处理组(...
- 邓素贞韩兆方陈小明李庆昌肖世俊李佳凯刘贤德
- 关键词：大黄鱼转录组测序
- 织锦巴非蛤斧足颜色与总类胡萝卜素含量相关分析被引量：6
- 2016年
- 斧足是织锦巴非蛤重要的食用部位。本研究检测了94个织锦巴非蛤斧足的总类胡萝卜素含量(TCC)和3个颜色指标L*(明暗度)、a*(红绿值)、b*(黄蓝值),发现织锦巴非蛤斧足总类胡萝卜素含量和颜色指标在不同个体之间存在较大差异。相关性分析表明,织锦巴非蛤斧足的总类胡萝卜素含量与颜色指标L*、a*、b*之间相关极显著(P<0.01),相关系数分别为:–0.546、0.569、0.449。本研究表明,斧足颜色越深,其类胡萝卜素含量也越高可能是一个普遍规律,这对我们接下来选育高类胡萝卜素含量贝类提供了一种直观的参考指标。
- 李庆昌刘坦陈小明蔡明夷刘贤德曾志南
- 波纹巴非蛤斧足颜色与总类胡萝卜素含量的相关分析被引量：3
- 2017年
- 波纹巴非蛤(Paphia undulata)是经济价值较高的海产贝类之一,斧足是其重要的食用部位。本研究分别检测了91个波纹巴非蛤斧足的总类胡萝卜素含量(TCC)和3个颜色指标L*(明暗度)、a*(红绿值)、b*(黄蓝值),结果显示波纹巴非蛤斧足总类胡萝卜素含量和颜色指标在不同的个体中存在较大的差异,不同个体斧足总类胡萝卜素含量范围为1.78~15.72μg/g,颜色指标L*、a*、b*的波动范围分别为48.21~56.31、-0.32~10.46、16.56~30.29。统计分析表明,波纹巴非蛤斧足的总类胡萝卜素含量和颜色指标L*、a*、b*之间相关极显著(P<0.01),相关系数分别为-0.733、0.685、0.775。研究结果将为选育高含量类胡萝卜素的波纹巴非蛤提供重要的参考依据。
- 李庆昌刘坦陈小明蔡明夷曾志南刘贤德
- 关键词：波纹巴非蛤
- 基于简化基因组测序的大黄鱼耐高温性状全基因组关联分析被引量：15
- 2017年
- 利用Illumina HiSeq^(TM) 2500测序平台,对通过高温胁迫实验筛选得到的20尾耐高温和20尾不耐高温的大黄鱼(Larimichthys crocea)进行了简化基因组测序(SLAF-seq),每个样本的平均测序深度达到10.26×,共获得419211个高质量的群体单核苷酸多态性(SNP)位点。利用TASSEL软件的混合线性模型(MLM)进行全基因组关联分析(GWAS),共筛选到38个与大黄鱼耐高温性状显著相关的SNP位点(P<2.39E–08)。利用BLAST程序定位每个SNP位点在大黄鱼基因组中的位置,并分析其周围的功能基因。结果在38个SNPs附近共找到26个已知的功能基因,这些基因主要与细胞转录、代谢、免疫等功能相关。研究结果可为下一步大黄鱼耐高温分子机制解析及耐高温品种的选育提供参考。
- 陈小明李佳凯王志勇蔡明夷韩芳刘贤德
- 关键词：大黄鱼高温胁迫单核苷酸多态性全基因组关联分析
- 突变高温胁迫对大黄鱼血清生理指标的影响被引量：11
- 2016年
- 鱼类作为变温动物,在水温突变时体内会发生一系列生理变化。本研究分析了突变高温胁迫下大黄鱼幼鱼血清皮质醇(COR)、血糖(GLU)以及乳酸(BLA)含量的变化规律。实验选取8月龄平均体重为(118.8±6.05)g的大黄鱼作为实验对象,对照组设定温度为(23±0.3)℃,实验组设定温度为(33℃±0.3)℃,变温过程为突变,观察记录实验现象。结果表明:大黄鱼幼鱼在33℃高温胁迫下有强烈的应激反应,表现为呼吸加快、极度不安、游动剧烈。经33℃高温胁迫2 h后,实验组幼鱼血清中皮质醇、血糖、乳酸含量与对照组相比均有显著的升高(P<0.05或0.01),陆续出现死亡,最终全部死亡。研究认为,33℃高温胁迫对大黄鱼有致命的影响,在养殖生产过程中要将水温严格控制在33℃以下。
- 李庆昌陈小明刘贤德
- 关键词：高温胁迫大黄鱼皮质醇血糖乳酸
