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基于转录组测序的波纹巴非蛤微卫星标记研究被引量：2: 2015年; 应用MISA软件对波纹巴非蛤转录组测序数据进行分析,共获得7378个微卫星标记,从中选取95个位点设计引物,并在一个野生波纹巴非蛤群体中进行分析验证,结果显示：95个位点中能够扩增出清晰条带的位点有30个,其中15个位点表现为单态,15个位点呈现多态.使用15个多态位点进行波纹巴非蛤群体的遗传多样性分析,结果表明：这15个位点的等位基因数为2~9,平均等位基因数为4．733,平均有效等位基因数为2．438,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0．270、0．516,平均多态信息含量为0．457.; 孙宏李佳凯武祥伟刘坦刘贤德; 关键词：波纹巴非蛤转录组微卫星标记

高温胁迫对大黄鱼（Larimichthys crocea）幼鱼血清生化指标的影响: 研究了持续7 d和14 d 32℃高温胁迫对12月龄大黄鱼血清生化指标影响,结果表明:高温胁迫7 d后,碱性磷酸酶、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、肌酸激酶同工酶、谷酰转肽酶、乳酸脱氢酶的活性均有所升高,与对照组相比（25℃,不...; 李佳凯王志勇刘贤德王秋荣叶坤; 关键词：大黄鱼高温血清生化指标; 文献传递

高温对大黄鱼(Larimichthys crocea)幼鱼血清生化指标的影响被引量：12: 2015年; 研究了持续7 d和14 d 32℃高温对12月龄大黄鱼血清生化指标影响,结果表明:高温处理7 d后,碱性磷酸酶、谷丙转氨酶、谷草转氨酶、肌酸激酶同工酶、谷酰转肽酶、乳酸脱氢酶的活性均有所升高,除碱性磷酸酶,其余五种酶与对照组(25℃)差异均达到极显著水平(P<0.01);血清中Cl-、Na+和Ca2+的浓度与对照组差异不显著(P>0.05),而K+的浓度显著低于对照组(P<0.05);血清中总蛋白、胆固醇、甘油三酯、葡萄糖、尿素氮的含量均有所降低,其中尿素氮、胆固醇、甘油三酯、葡萄糖的含量与对照组差异达到显著(P<0.05)或极显著水平(P<0.01)。高温处理14 d后,除肌酸激酶同工酶、乳酸脱氢酶的活性显著高于对照组外(P<0.01),其它酶与对照相比差异不显著(P>0.05);血清中Ca2+、K+的浓度显著低于对照组(P<0.05),Cl-、Na+的浓度与对照组差异不显著(P>0.05);尿素氮、胆固醇的含量与对照组差异达到显著水平(P<0.05)。以上研究表明:高温处理7 d、14 d,肌酸激酶同工酶、乳酸脱氢酶、K+浓度、尿素氮和胆固醇5个指标与对照相比都存在显著的变化,可作为大黄鱼对高温的反应指标。; 李佳凯王志勇刘贤德王秋荣叶坤; 关键词：大黄鱼高温血清生化指标

大黄鱼高温适应的转录组学分析: 为了探究大黄鱼高温胁迫条件下基因表达水平的变化,本实验利用Illumina Hiseq2500的125pair-ended测序模式分别对大黄鱼高温处理组和常温对照组进行了转录组测序.对照组(3个生物学重复)和高温处理组(...; 邓素贞韩兆方陈小明李庆昌肖世俊李佳凯刘贤德; 关键词：大黄鱼转录组测序

大黄鱼微卫星多重PCR体系的建立及其应用被引量：13: 2014年; 利用本实验室开发的微卫星标记,通过优化退火温度、引物浓度、循环次数等条件,建立了3组大黄鱼微卫星多重PCR体系,每组包含3个微卫星位点,用3组微卫星多重PCR分析了一个大黄鱼选育群体JD-01的遗传多样性。结果显示,该群体的平均等位基因为12.111,平均有效等位基因为7.408,平均多态信息含量为0.846,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.825、0.868,香农多样性指数为2.165。运用Cervus 3.0软件,对已知系谱关系的9个大黄鱼家系及对应亲本进行了亲子鉴定分析,以验证3组微卫星多重PCR在亲子鉴定中的准确性。结果显示,使用该3组微卫星多重PCR体系进行亲子鉴定准确率为100%。大黄鱼微卫星多重PCR体系的建立为分析群体的遗传多样性、亲子鉴定和辅助家系管理提供了一种高效的技术手段。; 李佳凯王志勇韦信键蔡明夷刘洋刘贤德; 关键词：大黄鱼微卫星标记多重PCR 亲子鉴定

基于简化基因组测序的大黄鱼耐高温性状全基因组关联分析被引量：15: 2017年; 利用Illumina HiSeq^(TM) 2500测序平台,对通过高温胁迫实验筛选得到的20尾耐高温和20尾不耐高温的大黄鱼(Larimichthys crocea)进行了简化基因组测序(SLAF-seq),每个样本的平均测序深度达到10.26×,共获得419211个高质量的群体单核苷酸多态性(SNP)位点。利用TASSEL软件的混合线性模型(MLM)进行全基因组关联分析(GWAS),共筛选到38个与大黄鱼耐高温性状显著相关的SNP位点(P<2.39E–08)。利用BLAST程序定位每个SNP位点在大黄鱼基因组中的位置,并分析其周围的功能基因。结果在38个SNPs附近共找到26个已知的功能基因,这些基因主要与细胞转录、代谢、免疫等功能相关。研究结果可为下一步大黄鱼耐高温分子机制解析及耐高温品种的选育提供参考。; 陈小明李佳凯王志勇蔡明夷韩芳刘贤德; 关键词：大黄鱼高温胁迫单核苷酸多态性全基因组关联分析

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李佳凯