吴昕怡
- 作品数：4 被引量：28H指数：4
- 供职机构：云南中医学院中药学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金云南省科技计划项目云南省应用基础研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 滇龙胆香叶醇-10-羟化酶基因克隆、生物信息学分析和表达被引量：4
- 2017年
- 目的克隆滇龙胆Gentiana rigescens香叶醇-10-羟化酶(geraniol-10-hydroxylase,G10H)基因,对其进行定量表达以及生物信息学分析。方法采用PCR技术获得G10H的c DNA序列,对G10H蛋白进行理化性质、二级结构和三级结构等生物信息学分析,并利用实时荧光定量PCR方法检测G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中的表达情况。结果克隆得到滇龙胆G10H基因,全长为1 400 bp,ORF 1 248 bp,编码415个氨基酸。生物信息学预测该基因编码蛋白质分子式为C_(2131)H_(3390)N_(586)O_(615)S_(17),等电点为7.62,不稳定系数为44.20,疏水性系数GRAVY为-0.245。G10H基因在滇龙胆根、茎、叶中均有表达,其中在根中表达量最高,茎中最低。结论首次从滇龙胆中克隆得到了G10H基因,为进一步阐明该基因的羟基化功能在滇龙胆龙胆苦苷生物合成途径中的重要作用奠定基础。
- 周伟李媛吴昕怡刘小莉
- 关键词：基因克隆生物信息学基因表达
- 基于高通量测序的青叶胆转录组研究被引量：8
- 2018年
- 目的探讨青叶胆中獐牙菜苦苷生物合成的遗传基础。方法采用Illumina Hiseq 2500高通量测序技术,对青叶胆全草进行转录组测序。结果共获得68 643个unigene,平均长度901 bp,共有42 954条unigene注释到NR,Swiss Prot,COG,KOG,GO,Pfam数据库中,獐牙菜苦苷生物合成的3个阶段中,有43条unigene参与中间体的生成,3条unigene参与萜类骨架合成,25条unigene可能参与萜类最后的修饰。结论首次对青叶胆转录组进行测序分析,获得了可能参与獐牙菜苦苷生物合成的候选基因,为后续功能基因的挖掘奠定了基础。
- 吴昕怡严媛刘小莉
- 关键词：青叶胆转录组ILLUMINA獐牙菜苦苷
- 环烯醚萜类成分生物合成途径及关键酶基因研究进展被引量：16
- 2017年
- 环烯醚萜类化合物是广泛存在于双子叶植物中的一类化合物,具有广泛的生物活性,如神经保护、抗肿瘤、抗氧化、抗炎等作用。文章对药用植物环烯醚萜类化合物生物合成途径及三个可能的关键酶基因的研究进展进行综述,以期为进一步解析环烯醚萜生物合成途径以及挖掘功能基因奠定基础。
- 吴昕怡刘小莉
- 关键词：药用植物环烯醚萜类化合物生物合成途径关键酶基因
- 滇龙胆3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶基因克隆、表达及分析被引量：4
- 2018年
- 目的：从药用植物滇龙胆中克隆得到3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶（3-hydroxy-3-methylglutaryl CoA reductase,HMGR）基因的c DNA全长,构建原核表达载体使其在大肠埃希菌中表达,对其进行定量表达并进行生物信息学分析。方法：利用PCR扩增克隆得到滇龙胆HMGR基因c DNA全长。构建p EASY-E1-HMGR表达载体,IPTG诱导表达。利用生物信息学方法分析克隆到的c DNA序列并预测结构和功能。采用实时荧光定量聚合酶链式反应（Real-time PCR）分析滇龙胆根、茎、叶在4个不同发育时期的HMGR表达情况。结果：克隆出两组HMGR基因,其中一组HMGR c DNA全长1 747 bp,开放阅读框长1 697 bp,编码565个氨基酸,定名为GRHMGR-1;另一组HMGR c DNA全长1 731 bp,开放阅读框长1 572 bp,编码523个氨基酸,定名为GRHMGR-2。SDS-PAGE显示重组质粒成功表达目的蛋白。Blastp发现,GRHMGR-1,GRHMGR-2与同属植物黄龙胆、秦艽的亲缘关系最为相近。结构分析显示都含有2个HMG-CoA结合位点,2个NADPH结合位点,预测都定位于内质网上。HMGR在滇龙胆根、茎、叶这4个不同发育期均有表达,表达量最高的是叶。结论：首次从滇龙胆中克隆到可能编码HMGR酶的基因,可为深入探讨滇龙胆龙胆苦苷生物合成奠定基础。
- 周伟吴昕怡张琳刘小莉
- 关键词：基因克隆原核表达生物信息学分析
