骆迎峰
- 作品数:2 被引量:24H指数:2
- 供职机构:中国科学院北京基因组研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域:生物学更多>>
- 复杂基因组测序技术研究进展被引量:20
- 2018年
- 复杂基因组指的是无法使用常规测序和组装手段直接解析的一类基因组,通常指包含高比例重复序列、高杂合度、极端GC含量、存在难消除异源DNA污染的基因组。为了解决复杂基因组的测序和组装问题,需要分别从基因组测序实验方法、测序技术平台、组装算法与策略3个方面进行深入研究。本文详细介绍了复杂基因组测序组装相关的现有技术与方法,并结合复杂基因组经典实例介绍了复杂基因组测序的技术解决途径和发展历程,可为制订合适的复杂基因组测序策略提供参考。
- 高胜寒禹海英吴双阳王森耿佳宁骆迎峰胡松年
- 条斑紫菜低覆盖度基因组草图分析被引量:4
- 2011年
- 对条斑紫菜(Porphyra yezoensis)进行Solexa高通量测序,获得低覆盖度全基因组草图。该基因组草图大小约220 Mbp,GC质量分数53.08%;包含26 629个预测基因,其中16 409个基因具有内含子,平均每个基因含2.22个内含子;基因结构分析表明具有内含子的基因平均长度为2 214 bp,内含子平均大小319 bp;代谢通路分析表明嘌呤代谢是含有蛋白数量最多的代谢途径。本研究所得条斑紫菜低覆盖度全基因组草图快速获取了基因组大小和蛋白编码基因结构等基本信息,证明了使用Solexa高通量测序技术对条斑紫菜进行全基因组测序的可行性。
- 牛建峰高胜寒骆迎峰袁野王广策胡松年
- 关键词:代谢通路