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华阳

作品数:1 被引量:3H指数:1
供职机构:长春理工大学理学院更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:理学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇理学

主题

  • 1篇数学
  • 1篇数学建模
  • 1篇数学模型
  • 1篇DNA序列
  • 1篇HASH算法
  • 1篇INDEX
  • 1篇MER

机构

  • 1篇长春理工大学

作者

  • 1篇蔡志丹
  • 1篇郭方舟
  • 1篇华阳

传媒

  • 1篇长春理工大学...

年份

  • 1篇2015
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
基于Hash算法的DNA序列k-mer index问题的数学建模被引量:3
2015年
针对查找DNA序列的相似序列问题,给出了建立索引和查找索引的数学模型,基于Hash算法,建立了依赖于k值大小的顺序索引模型和散列索引模型,特别对较大k值选用了DJBHash函数,有效的避免了Hash冲突问题。最后在硬件平台CPU为2.6GHz、内存为8G、操作系统为64位Windows 7的条件下,对100万条长度为100的DNA序列进行了测试,给出了不同k值下建立和查询索引的用时和占用内存情况,有效的解决了DNA序列的k-mer index问题。
郭方舟华阳董修伟蔡志丹
关键词:HASH算法数学模型
共1页<1>
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