叶晟
- 作品数：5 被引量：12H指数：2
- 供职机构：大连海洋大学更多>>
- 发文基金：国家海洋局近岸海域生态环境重点实验室开放基金国家自然科学基金国家公益性行业科研专项更多>>
- 相关领域：农业科学生物学环境科学与工程更多>>
- 文蛤C型凝集素基因(Mm-Lec1)的克隆与表达分析被引量：4
- 2016年
- 文蛤（Meretrix meretrix）是我国重要的滩涂养殖贝类,病害严重影响文蛤增养殖业,研究文蛤的免疫机制有助于解决文蛤的病害问题。C型凝集素（C-type lectin）参与先天免疫,在识别病原相关分子模式和激活体液免疫因子等方面发挥重要作用。本研究检索已构建的文蛤全长cDNA文库,经过Blast比对得到了文蛤C型凝集素1（Mm-Lec1）基因的全长cDNA序列。Mm-Lec1序列全长586bp,5和3非翻译区（UTR）的长度分别为21bp和79bp,开放阅读框长度为486bp,编码161个氨基酸,分子量为18.65kD,理论等电点为4.98。预测的氨基酸序列中含有信号肽（Met1-Ser19）、糖识别结构域（CRD）和糖结合位点（QPN）。Mm-Lec1的三级结构是紧凑型,含有β片层结构。同源性分析结果表明,Mm-Lec1与其他物种C型凝集素相似度在20%~32%;邻接法（Neighbor-Joining,NJ）进化树分析结果表明,Mm-Lec1与紫贻贝CTL 6和栉孔扇贝CTL A聚为一支。实时荧光定量分析结果显示,Mm-Lec1在文蛤鳃、肝胰腺、闭壳肌、外套膜、性腺和血细胞中均表达,其中鳃表达量最高,血细胞次之,性腺中表达量最少;在鳗弧菌（Vibrio anguillarum）刺激实验中,6h时Mm-Lec1在血细胞中的表达量最低,48h表达量最高,暗示Mm-Lec1参与文蛤抵御细菌入侵的免疫过程。
- 张晶晶李宏俊秦艳杰刘敏叶晟
- 关键词：文蛤C型凝集素表达序列标签实时荧光定量PCR
- 辽河口邻近海域小型底栖生物的空间分布及季节变化被引量：4
- 2017年
- 本文研究了辽河口邻近海域2013年8月、10月和2014年5月3个航次小型底栖生物的种类及其空间分布,分析了小型底栖生物丰度和生物量的季节变化。结果表明,3个航次(夏季、秋季和春季)小型底栖生物的平均丰度分别为(264±83)ind/(10cm^2)、(216±85)ind/(10cm^2)和(227±67)ind/(10cm^2),平均生物量分别为(272±125)μg/(10cm^2)、(207±89)μg/(10cm^2)和(244±103)μg/(10cm^2)。与其他研究海域相比,辽河口小型底栖的丰度和生物量处于较低水平。共鉴定出了14个小型生物类群,按照丰度排序,线虫是最优势的类群,夏季、秋季和春季3个航次占总丰度的比例分别为94.0%、92.5%和90.8%;其他优势类群为多毛类、桡足类和双壳类。小型底栖生物量的优势类群则为多毛类(41.1%~44.0%),高于线虫(33.8%~36.5%),其次是双壳类(2.6%~6.7%)。水平分布的研究表明,调查海域近岸入海口小型底栖生物的丰度和生物量普遍低于近海海域,但是秋季时近岸分布与近海差距不大。垂直分布的研究表明,95.9%的小型底栖生物分布于0~5cm的表层沉积物中。小型底栖生物的丰度和生物量在夏季时都达到高峰值。与环境因子的相关分析表明,小型底栖生物的数量分布与盐度和水深呈极显著正相关(P<0.01),与叶绿素a呈显著正相关(P<0.05)。
- 叶晟孔飞李宏俊李宏俊刘敏邵魁双李洪波邵魁双
- 关键词：小型底栖生物群落结构丰度生物量环境变量
- 基于转录组学研究文蛤对Cd2+的响应机制
- 随着工农业的快速发展，我国近岸局部海域污染十分严重，严重威胁了海洋生态环境安全。在众多污染物中，重金属污染十分突出，它的污染持续时间长，进入海洋生物体内后不易降解，有研究表明，贝类对于重金属污染物十分敏感，很低水平的重金...
- 叶晟
- 关键词：文蛤生理响应转录组测序荧光定量PCR
- 文献传递
- 高通量测序技术及其在贝类转录组研究中的应用被引量：1
- 2017年
- 高通量测序是传统DNA测序的一次重大技术创新,它为贝类养殖物种的研究带来了新的机遇。着重对454、Solexa和SOLi D高通量测序平台的技术原理、数据分析及其在贝类转录组的研究应用进行综述,同时对高通量测序未来发展方向做了总结和展望。
- 刘敏叶晟杨凤吴立新
- 关键词：高通量测序转录组贝类
- 基于鳃的microRNA转录组研究中国蛤蜊对重金属镉的响应被引量：2
- 2016年
- 中国蛤蜊(Mactra chinensis)是一种重要的经济贝类,分布于我国的辽宁和山东。近年来,生境恶化和过度捕捞导致我国蛤蜊资源量减少。我们利用Illumina Hiseq-2500平台对中国蛤蜊鳃的microRNA转录组进行测序,运用差异表达寻找对镉刺激有响应的功能microRNA。结果显示对照组获得了14 415 256条clean reads,实验组获得了15 570 111条clean reads。在这些reads中一共存在14 584 077小RNA,包括1 898 035条unique小RNA,其中对照组和实验组共有187 859条unique小RNA。两个组的小RNA文库的片段长度分布是相似的,大部分小RNA长度分布在26~27nt。在对照组文库中最丰富的片段长度是27nt,其次是28nt、26nt和23nt。在实验组文库中,数量最丰富的片段长度是26nt,其次是27nt、28nt和23nt。经过对序列前体以及结构特征的分析,发现这两个组中一共有50个microRNA,其中已知的是38个,新发现的是12个。对照组和实验组microRNA含量最丰富的片段长度是23nt。通过差异表达分析,5个microRNA基因具有显著性差异且从对照组到实验组的表达量是上调的,其余45个没有显著性的差异。把这50个序列与中国蛤蜊转录组进行比对,一共找到了542个靶基因。5个具有表达差异的基因一共比对到11个靶基因。把这11个靶基因与NCBI数据库比对,4个靶基因在COG中得到注释,1个靶基因在GO中得到注释,6个靶基因在KEGG中得到注释,11个靶基因在nr数据库中得到注释,注释到的基因有泛素蛋白连接酶E3,Wnt信号通路,G蛋白信号调控等。
- 张晶晶李宏俊秦艳杰刘敏叶晟
- 关键词：中国蛤蜊镉MICRORNA功能基因
