张晓婧
- 作品数：3 被引量：2H指数：1
- 供职机构：新疆师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：新疆维吾尔自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域：自动化与计算机技术生物学更多>>
- 基于Bioperl实现远程自动获取抗逆基因序列被引量：1
- 2014年
- BioPerl对于现今大量的生物数据来说,具有很好的获取和处理能力,并且NCBI提供了可以直接访问它下属的Entrez数据库(包括PubMed)的编程接口,即E-Utilities。为了从NCBI中自动获取大量抗逆基因序列,使得生物抗逆基因二次数据库得以搭建,该文基于BioPerl设计了远程自动获取大量抗逆基因序列的程序。此程序灵巧、精悍,Perl语言强大的文本处理功能使程序能实现不同类型基因序列的远程获取。
- 张晓婧潘伟民曹兴芹
- 关键词：抗逆基因
- 基于BioPerl实现从NCBI中精确下载LEA基因序列被引量：1
- 2014年
- 近年来关于抗逆基因的研究,越来越受研究者们的关注,在新疆尤其重视抗干旱基因的研究。基于这些因素,本文根据LEA基因(late embriogenesis abundant gene, LEA)的保守结构域所在片段(下文简称保守结构片段)和相应的关键词,基于BioPerl设计了从NCBI中精确下载LEA基因序列的程序。此程序不仅解决了LEA基因的精确获取,同时也为不同类型序列的精确下载,提供了一种较好的解决办法。
- 张晓婧曹兴芹潘伟民
- 关键词：保守结构域关键词LEA基因
- 面向对象的分子生物学二次数据库平台建模分析
- 2015年
- 在生物信息学中,建立生物二次数据库可以针对特定物种进行深入研究。为方便研究人员对生物分子学数据进行存储、检索、查询,在分子生物学二次数据库基础上,通过基于UML的面向对象技术进行建模和开发,实现B/S方式的可视化平台。利用StarUML可视化建模工具,快速高效完成软件分析。
- 杜晶杨勇张晓婧赵彩霞
- 关键词：面向对象建模UML
