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王全乐
作品数:
1
被引量:2
H指数:1
供职机构:
上海海洋大学水产与生命学院
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发文基金:
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项资金项目
公益性行业(农业)科研专项
国家高技术研究发展计划
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相关领域:
农业科学
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合作作者
冀培丰
中国水产科学研究院
孙效文
中国水产科学研究院
徐鹏
中国水产科学研究院
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上海海洋大学
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中国水产科学...
作者
1篇
徐鹏
1篇
孙效文
1篇
冀培丰
1篇
王全乐
传媒
1篇
中国水产科学
年份
1篇
2011
共
1
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鲤基因组中1个新Tc1类转座子的发现与鉴定
被引量:2
2011年
在鲤(Cyprinus carpio)基因组中鉴别出一个新的具有潜在转座活性的Tc1类转座子,并命名为CCTN转座子(Cyprinus carpio Transposon,CCTN)。CCTN转座子全长1 611 bp,由两端约214 bp的反向重复序列(Inverted Repeat,IR)和中间不间断的996 bp的转座酶开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)组成。CCTN转座子推测的转座酶序列中存在完整的DD(34)E结构域,此结构域是Tc1类转座酶作用的必需位点之一。采用实时荧光定量PCR评估CCTN转座子在鲤基因组中的拷贝数约为2.28×103,占全基因组的0.21%。分子系统学研究表明,CCTN转座子是一个新的鱼类Tc1类转座子,其与斑马鱼(Danio rerio)Tzf-28、大西洋鲑(Salmo salar)SALT1和鲽(Pleuronectes platessa)PPTN2等Tc1类转座子亲缘关系较近。
王全乐
冀培丰
徐鹏
孙效文
关键词:
转座子
拷贝数
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