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余甜甜

作品数:11 被引量:10H指数:1
供职机构:上海交通大学更多>>
发文基金:国家自然科学基金更多>>
相关领域:天文地球生物学农业科学文化科学更多>>

文献类型

  • 7篇会议论文
  • 2篇期刊文章
  • 1篇学位论文
  • 1篇专利

领域

  • 5篇天文地球
  • 4篇生物学
  • 2篇农业科学
  • 2篇文化科学
  • 1篇理学

主题

  • 9篇古菌
  • 4篇多样性
  • 4篇沉积物
  • 3篇南海沉积物
  • 3篇海洋沉积
  • 3篇海洋沉积物
  • 3篇丰度
  • 2篇碳循环
  • 2篇基因
  • 1篇代谢
  • 1篇代谢特征
  • 1篇氮循环
  • 1篇蛋白序列
  • 1篇厌氧
  • 1篇生理
  • 1篇生理特点
  • 1篇生态功能
  • 1篇生物地球
  • 1篇示踪
  • 1篇示踪技术

机构

  • 11篇上海交通大学
  • 1篇广州海洋地质...
  • 1篇中国科学院

作者

  • 11篇余甜甜
  • 6篇王风平
  • 1篇董良
  • 1篇何莹
  • 1篇梁前勇
  • 1篇贾仲君

传媒

  • 1篇微生物学通报
  • 1篇中国科学:地...
  • 1篇2015年“...

年份

  • 2篇2023
  • 2篇2017
  • 3篇2016
  • 3篇2015
  • 1篇2014
11 条 记 录,以下是 1-10
排序方式:
中国南海北部陆坡沉积物古菌多样性及丰度分析被引量:10
2017年
【目的】海洋沉积物中的古菌在全球生物地球化学循环中充当重要的角色,深入了解沉积物中古菌群落的结构及功能特征是探究海洋沉积物中古菌参与生物地球化学循环和生态学功能的基础。【方法】采用高通量测序技术,分别对南海北部陆坡不同海域(东部,西部和神狐海域的7个站位)沉积物中古菌16SrRNA基因进行Illumina Mi Seq测序。【结果】中国南海北部陆坡沉积物中古菌的主要门类是Bathyarchaeota、Thermoplasmata、Woesearchaeota(DHVEG-6)、Thaumarchaeota(Marine Group I)、Lokiarchaeota和Marine Hydrothermal Vent Group(MHVG),还存在少量的AK8、Marine Benthic Group A和Terrestrial Hot Spring Crenarchaeota Group(THSCG)等。在潜在水合物区沉积物中还发现了甲烷代谢相关古菌(Anaerobic methanotrophic archaea,ANME)类群,主要为ANME-1、ANME-2ab和ANME-2c等。甲烷代谢古菌的分布特征也从甲烷代谢保守功能基因mcr A(Methyl coenzyme-Mreductase A)的扩增中得到了验证。利用定量PCR对南海沉积物中的细菌、古菌的16SrRNA基因和mcrA基因进行了定量,发现细菌16SrRNA基因拷贝数为10~5-10~7 copies/g(湿重),古菌16SrRNA基因拷贝数为10~5-10~6 copies/g(湿重),潜在水合物区mcrA基因拷贝数为10~3-10~5 copies/g(湿重)。【结论】揭示了中国南海北部陆坡沉积物中具有丰富的微生物资源,其中古菌种类多样且丰度较高,同时发现冷泉特征古菌群落,为深入认识和理解南海沉积物中微生物丰度和古菌多样性,以及解析古菌地球化学功能奠定基础。
范习贝梁前勇牛明杨余甜甜王寅炤王风平
关键词:沉积物古菌多样性
南海沉积物中深古菌(Bathyarchaeota)的丰度,多样性及其参与碳循环功能的研究
余甜甜牛明杨王风平
解析深古菌(Bathyarchaeota)--来自海洋沉积物一个新的古菌门的生物地球化学功能
海洋沉积物主要是由上层海水中的颗粒物沉降到海底并不断堆积而形成,覆盖了近整个海底.沉积物中的微生物群落组成根据氧浓度、温度、营养元素的种类和含量以及沉积物的深度等物理化学参数的变化而各不相同.深海沉积物中的古菌含量丰富,...
王风平孟君余甜甜何莹
参与南海表层沉积物氮循环的微生物功能基因丰度和多样性研究
余甜甜牛明杨范习贝王风平
南海沉积物中Miscellaneous Crenarchaeotal Group的多样性及富集培养
MCG(Miscellaneous Crenarchaeotal Group) 最近被划分为古菌的一个新门(Phylum),命名为深古菌门"Bathyarchaeota"(Meng et al.,2013).深古菌广泛分...
余甜甜王风平
海洋沉积物中深古菌(Bathyarchaeota)的多样性、生理特点及生态功能的研究
海洋沉积物中蕴藏着丰富的微生物资源,其估算细胞的数目达到2.9×10个,与估计的海水中微生物丰度相当。但是由于缺少培养物,大部分微生物的生理特征和代谢方式以及生态功能未知。古菌是海洋沉积物中微生物群体的重要组成部分,深古...
余甜甜
关键词:海洋沉积物多样性碳固定
文献传递
探寻深古菌(Bathyarchaeota)在南海碳循环过程中的功能
深古菌(Bathyarchaeota,Miscellaneous Crenarchaeotal Group,MCG)广泛分布于陆地和海洋的各种环境,如海洋沉积物、热泉、土壤、火山泥等,并且它是海洋沉积物中古菌的主要类群,...
余甜甜牛明阳王风平
关键词:代谢特征海洋环境
文献传递
海洋沉积物中深古菌的固碳潜能——基于DNA的稳定性同位素示踪研究
2023年
深古菌分布广泛、生境多样,是地球丰度最高的微生物之一,被认为在全球碳循环中扮演着重要角色.由于分离培养困难,深古菌的生理代谢功能尚不清楚.前期研究表明,深古菌具有降解木质素的功能;宏基因组分析也表明深古菌包含完整的无机碳固定途径(Wood-Ljungdahl pathway,WL途径),但尚未有直接的功能验证报道.本研究利用木质素与NaH^(13)CO_(3)对海洋沉积物样品进行长期培养,探究深古菌固定无机碳的能力.结果表明:在添加了木质素的培养体系中深古菌持续增长,10个月后其丰度增幅高达15.3倍,并在古菌中占比由30%上升为80%.为查明培养体系内微生物的固碳功能,监测了总有机碳δ^(13)C随时间的变化,发现两种添加了NaH^(13)CO_(3)的体系的总有机碳在最初的一个月均有升高,随后在未添加木质素的体系中基本保持不变,而添加了木质素的体系中δ^(13)C缓慢而持续地增长.对培养过程中不同处理和不同阶段的样品进行DNA提取,并通过超高速密度梯度离心获得不同浮力密度DNA后,利用Q-PCR分析其中深古菌与细菌的16S rRNA基因丰度.发现4个月后添加了木质素和NaH^(13)CO_(3)的体系中深古菌16S rRNA基因相较于细菌更明显集中出现在密度更重的层位,说明深古菌通过利用木质素和固定NaH^(13)CO_(3)大量增殖并导致其DNA被^(13)C标记,深古菌具有固碳代谢的能力.
梁文悦余甜甜董良贾仲君王风平
关键词:固碳
南海沉积物中深古菌(Bathyarchaeota)的丰度,多样性及其参与碳循环功能的研究
余甜甜牛明杨王风平
一种深古菌转甲基酶Ι的基因、蛋白序列及其制备方法
本发明提出了一种深古菌转甲基酶Ι的基因、蛋白序列及其制备方法,属于基因工程技术领域,所述转甲基酶Ι来源于深古菌基因组,具有转甲基活性,以带甲氧基的芳香族化合物为底物,将其中的甲基转移至咕啉环蛋白上。将深古菌转甲基酶Ι克隆...
王风平余甜甜曾宪烘
共2页<12>
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