刘潮
- 作品数:3 被引量:8H指数:2
- 供职机构:云南农业大学更多>>
- 发文基金:云南省自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 水稻类甜蛋白基因家族鉴定及表达的初步分析被引量:6
- 2017年
- 本研究鉴定水稻基因组中类甜蛋白(TLP)家族基因,并对部分基因的组织表达特异性进行研究,为开展水稻类甜蛋白基因功能及分子进化机制研究提供基础。基于水稻基因组数据库,通过生物信息学方法对候选的47个水稻类甜蛋白基因家族成员进行鉴定、聚类及结构功能分析,通过q RT-PCR技术,检测14个Os TLP基因在LTH及其近等系水稻幼苗的叶片、根、叶鞘和花穗中的时空表达水平。基因和蛋白结构分析表明,Os TLP基因有5种结构类型,蛋白保守氨基酸基序高度一致。聚类分析显示,水稻类甜蛋白基因归属10个进化组,分布于12条染色体上,其中成员最多的进化组Ⅴ中的基因主要来自3号和12号染色体。q RT-PCR结果显示,14个Os TLP在6个品种水稻根、叶鞘、叶片和花穗中相对表达水平不同,多个基因在根中有较高的基础表达。本研究为进一步研究TLP家族在水稻生长发育和对抗胁迫中的作用提供了理论基础。
- 刘潮刘潮王慧杨静刘林
- 关键词:水稻聚类分析生物信息学基因表达
- 稻瘟病菌效应蛋白MoSDT1转基因水稻表型分析及抗性鉴定
- 通过分析稻瘟病菌基因组,结合比较基因组学和BLAST序列分析等方法从稻瘟病菌基因组数据库中预测到了一个分泌蛋白基因MoSDT1.为了进一步研究稻瘟病菌效应蛋白MoSDT1在稻瘟病与水稻互作中的作用,通过根癌农杆菌介导法将...
- 王慧刘潮杨静杨亚琼梁美玲鄢进陆李成云
- 关键词:稻瘟病菌转基因水稻
- 水稻防御反应相关基因对稻瘟病菌的响应被引量:2
- 2017年
- 水稻与稻瘟病菌的互作已成为研究植物与病原真菌互作的模式系统。利用RT-PCR技术检测了6个水稻品种(分别含有抗病基因Pik-s、Pita、Pit、Pi1、Pi9的近等系及回交亲本丽江新团黑谷LTH)与稻瘟病菌互作过程中多个信号相关及PR基因的表达。结果表明带有稻瘟病抗性基因Pik-s、Pita、Pit的水稻品种和LTH对稻瘟病菌#626侵染表现为亲和互作,带Pi1和Pi9的水稻品种表现为非亲和互作;稻瘟病菌接种后,亲和互作中MAPK6和MAPK12表现为上调表达,带有抗性基因Pi9的水稻品种IRBL22中BIMK2表现为上调表达。总体来看,含有不同抗病基因的水稻近等系中的PR基因对稻瘟病菌的响应较为多样,非亲和互作中在早期或早中期表现为PR基因上调表达,而亲和互作中主要在晚期上调表达,说明这些PR基因表达的时间在植物与病原互作的不同时期发挥着不同的作用。
- 刘潮王慧刘林杨静李成云
- 关键词:稻瘟病水稻近等基因系