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曹福军: 作品数：14 被引量：34H指数：3; 供职机构：石河子大学农学院园艺系更多>>; 发文基金：国家自然科学基金国家教育部博士点基金国家科技攻关计划引导项目更多>>; 相关领域：农业科学更多>>

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‘库尔勒香梨’脱萼组与宿萼组样品差异表达基因的筛选被引量：15: 2015年; 【目的】系统研究‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组花器官的转录组表达情况,筛选2者之间的差异表达基因,为进一步阐明‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定基础。【方法】采用Illumina高通量测序技术对‘库尔勒香梨’脱萼组和宿萼组代表样品进行测序,利用生物信息学方法筛选2者的差异表达基因和进行功能基因预测。【结果】Trinity法拼接后得到48 894条unigenes序列,从中选取了2组样品中共表达和单独表达的SPL转录因子进行了功能探究,发现3条unigenes可能与萼片发育有关。筛选的差异表达基因获得了Gene Ontology和KEGG数据库的注释,涉及植物激素信号转导、光合代谢、苯丙氨酸代谢、芳香族化合物合成、细胞发育等与萼片发育相关过程。【结论】筛出了2组样品的差异表达基因,获得了与萼片发育相关的基因及其对应的功能注释,为今后进一步研究‘库尔勒香梨’萼片脱落与宿存分子机理奠定了良好基础。; 孙晓霞牛建新王博慧裴茂松李陈静曹福军; 关键词：萼片转录组测序差异表达分析

早实核桃雌花芽分化相关的miRNA鉴定: 核桃(Juglans regia L.)是世界著名的四大坚果之一,也是新疆自治区林果经济创收的主力树种.早实核桃一般3年以内能开花结实.早实性是新疆良种核桃主要的优良经济性状,具有较高的遗传能力.研究表明,microRN...; 周丽牛建新全绍文曹福军; 关键词：核桃早实

早实核桃雌花芽分化相关的miRNA鉴定: 核桃(Juglans regia L.)是世界著名的四大坚果之一,也是新疆自治区林果经济创收的主力树种。早实核桃一般3年以内能开花结实。早实性是新疆良种核桃主要的优良经济性状,具有较高的遗传能力。研究表明,microRN...; 周丽牛建新全绍文曹福军; 关键词：核桃早实; 文献传递

库尔勒香梨上苹果茎沟病毒全序列的鉴定与分析被引量：2: 2015年; 本研究以新疆库尔勒香梨园随机选取的三棵香梨树花朵为试验材料,采用Illumina Hi Seq/Mi Seq测序技术分离得到1个库尔勒香梨上的苹果茎沟病毒分离物ASGV-kfp的全长序列。序列分析结果显示:该分离物基因全长6 460 bp(ASGV-kfp,KR106996),包含3个完整的ORF,分别编码polyprotein、MP基因(Movement protein gene)、CP基因(Trichovirus coat protein gene)。ASGV-kfp的CP基因和MP基因与国内外已报道的该病毒的CP基因和MP基因序列同源性分别达到了93%~99%和97%~100%。进化树分析显示,ASGV的CP基因分子变异与寄主以及地理区域没有相关性;ASGV的MP基因分子变异与寄主有一定的相关性。研究结果可为进一步研究ASGV株系分化奠定良好基础。; 孙晓霞牛建新王博慧王博慧李陈静曹福军; 关键词：苹果茎沟病毒库尔勒香梨 CP基因

库尔勒香梨9个新miRNA克隆鉴定被引量：1: 2016年; 利用在小RNA高通量测序试验中筛选出的脱萼组与宿萼组差异表达新miRNA基因,采用Stem-loop法对总体表达量居前20位、在脱萼组和宿萼组中具有显著性差异表达、在子房和萼片组织中具有显著性差异表达的新miRNA进行成熟体的克隆鉴定、前体序列二级结构分析、qRT-PCR试验以及靶基因预测。结果显示,在不同的样本中有9个新miRNA(novel_miRNA)的成熟体序列以及4个novel_miRNA的表达量与高通量测序结果完全一致,并且预测得到大量具有生物学功能的靶基因。新发现的miRNA可能与‘库尔勒香梨’萼片脱落和宿存有密切关系。; 李陈静牛建新裴茂松曹福军全绍文; 关键词：克隆鉴定 QRT-PCR

库尔勒香梨kfpSPL基因的克隆及表达分析: SPL(squamosa promoter binging protein like)是植物所特有的一类转录因子,参与植物生殖生长与营养生长过程,可能与生长素、赤霉素和乙烯等多种植物生长调节物质的信号转导途径有关,其具体...; 孙晓霞牛建新王博慧裴茂松李陈静曹福军; 关键词：RACE 实时荧光定量PCR 基因表达; 文献传递

库尔勒香梨MYB基因启动子的克隆与序列分析: 启动子序列除含有基本元件TATA-box和CAAT-box外,还存在一些特异性的顺式作用元件,它们可以和转录因子等调节蛋白质协同作用。克隆启动子序列并对其中的转录因子结合位点进行分析是了解基因转录表达模式及其调控机制的关...; 王博慧牛建新孙晓霞裴茂松李陈静曹福军; 关键词：MYB基因启动子调控元件; 文献传递

新疆早实核桃和晚实核桃叶绿素荧光特征差异比较被引量：6: 2016年; 【目的】明确新疆2个核桃类群的需光特性，为其在高光热大田条件下的丰产栽培管理提供理论参考。【方法】应用调制荧光成像系统（Imaging—PAM），以新疆2个早实和2个晚实核桃品种为试材，从叶片荧光参数成像异质性、荧光参数日变化、光饱和点及光补偿点方面入手，比较了早实、晚实品种间的荧光特征差异。【结果】早实和晚实品种间的叶片荧光成像异质性差异明显，其中早实品种初始荧光参数波动（13．22％）明显高于晚实品种荧光波动参数（8．66％）（P〈0．05）。荧光参数日变化均值显示：早实品种的最大荧光参数Fm以及调节性耗散量子产额Y（NPQ）指标低于晚实品种（PFm〈0．01，PY（NPQ），〈0．05），而PSⅡ的实际光化学效率Y（Ⅱ）指标高于晚实品种（P〈0．05）。此外，早实品种的光饱和点（1179～1187μmol．m^-2．s^-1）高于晚实品种的光饱和点（1056～1076μmol·m^-2·s^-1）。【结论】早实品种和晚实品种的叶绿素荧光特征存在差异，早实品种较晚实品种有着更强烈的需光特性。; 全绍文曹福军牛建新; 关键词：核桃日变化早实晚实

库尔勒香梨萼片脱落与宿存相关基因筛选及表达分析: 库尔勒香梨果实香味浓郁，皮薄，肉细，多汁，品质优良，是新疆重要的出口创汇果树之一。受遗传因素的影响，库尔勒香梨存在严重的萼片宿存现象，影响了其品质和经济价值。由于缺乏库尔勒香梨转录组信息，其分子机制方面的研究较少，从分子...; 裴茂松牛建新李陈静曹福军全绍文; 关键词：库尔勒香梨转录组测序

早实核桃雌花芽分化相关的miRNA鉴定: 核桃(Juglans regia L.)是世界著名的四大坚果之一,也是新疆自治区林果经济创收的主力树种。早实核桃一般3年以内能开花结实。早实性是新疆良种核桃主要的优良经济性状,具有较高的遗传能力。研究表明,microRN...; 周丽牛建新全绍文曹福军; 关键词：核桃早实