陈细红
- 作品数：12 被引量：28H指数：3
- 供职机构：福建出入境检验检疫局更多>>
- 发文基金：质检公益性行业科研专项项目福建省自然科学基金福建出入境检验检疫局科技计划项目更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 福建省福清地区马铃薯病毒病病原的分子检测被引量：9
- 2019年
- 2017年调查福建福清地区马铃薯病毒病的发生情况,以明确该地区马铃薯主要病毒病原。共采集了46份疑似感染病毒的马铃薯植株,提取总RNA,利用RT-PCR技术进行分子检测,结果表明,福清地区危害马铃薯的病毒有马铃薯Y病毒Potato virus Y(PVY)、马铃薯卷叶病毒Potato leaf roll virus(PLRV)、马铃薯S病毒Potato virus S(PVS),检出率分别为56.52%、17.39%和10.87%,以PVY检出率最高,说明PVY是危害该地区马铃薯样品的主要病毒病原。通过病毒复合侵染进行分析,发现该地区存在病毒复合侵染马铃薯现象。研究结果可为福清地区马铃薯种薯的引进和病毒病害防治提供参考依据。
- 杨小龙陈细红蔡伟高芳銮沈建国吴祖建
- 关键词：马铃薯病毒RT-PCR
- 蚕豆染色病毒RNA2全序列测定被引量：1
- 2013年
- 采用RT-PCR扩增并测定蚕豆染色病毒(Broad bean stain virus,BBSV)RNA2的基因组序列。BBSV RNA2基因组全长3478 nt,5'非编码区和3'非编码区分别为268 nt和237 nt。RNA2编码的多聚蛋白经切割后产生辅助蛋白(CR)、移动蛋白(MP)、大外壳蛋白(CP-L)和小外壳蛋白(CP-S)。基于多聚蛋白P2氨基酸序列构建的系统树显示:侵染豆科作物的Comovirus病毒构成1个分支,表明Comovirus病毒之间的亲缘关系具有寄主相关性。
- 黄峰陈青谢毅璇陈细红陈红运林石明
- 关键词：RNA2
- 福建永安市辣椒丛枝病植原体的分子检测及鉴定被引量：5
- 2015年
- 永安地区发病辣椒植株表现小叶、黄化、丛枝、簇芽等症状。利用植原体16SrDNA基因的通用引物R16mF2/R16mR2和R16F2n/R16R2,对发病辣椒植株总DNA进行巢式PCR检测,获得约1.2kb的特异性DNA片段。经测序并在GenBank数据库进行比对分析,共获得4条植原体特定的16SrDNA基因序列(CHY-C4-1、CHYY1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1)。将测得的4条序列与已报道的植原体序列进行同源性比对,并构建系统进化树,结果显示获得的4条植原体序列均聚类到16SrI组,其中CHY-Y1-1、CHY-Y7-1、CHY-G1-1与16SrI-B亚组植原体聚类到同一支,而CHY-C4-1与已报道的16SrI组内的6个亚组均未聚类到一支,因此建议将CHY-C4-1命名为新的亚组。利用iPhyClassifier在线分析软件对获得的4条植原体序列进行虚拟RFLP分析,结果与进化树获得的结果一致。
- 刘建密纪翠红陈细红林积秀黄培枝严叔平陈文乐陈彩霞张宇翔牟海青
- 关键词：辣椒植原体系统进化分析
- 同时检测七种水仙RNA病毒的多重RT-PCR检测试剂盒及其检测方法
- 本发明公开了同时检测七种水仙RNA病毒的多重RT‑PCR检测试剂盒及其检测方法。本发明的试剂盒可专用于同时检测水仙黄条病毒、水仙退化病毒、水仙潜隐病毒、南芥菜花叶病毒、水仙普通潜隐病毒、水仙花叶病毒和尼润潜隐病毒，该试剂...
- 沈建国高芳銮陈细红廖富荣何逸鹏
- 马铃薯黄矮病毒的联合基因检测试剂盒及检测方法
- 本发明公开了马铃薯黄矮病毒联合基因检测试剂盒及检测方法。本发明的试剂盒包括针对马铃薯黄矮病毒RdRp基因的1套特异性引物和荧光探针、针对马铃薯黄矮病毒NP基因的1套特异性引物和荧光探针、RT Buffer、随机引物、RN...
- 沈建国高芳銮张永江陈细红廖富荣
- 美人蕉黄斑驳病毒巢式PCR检测方法的建立被引量：1
- 2019年
- 本文以我国台湾进境美人蕉病株为材料,根据已报道的美人蕉黄斑驳病毒Canna yellow mottle virus(CaYMV)基因序列设计2对特异性引物(外侧引物1对、内侧引物1对),建立了巢式PCR快速检测CaYMV的方法,并对进境的50份美人蕉样品进行了检测。结果显示,该方法特异性强,且灵敏度高于常规PCR,是常规PCR的1 000倍,表明该方法能够实现对CaYMV的快速、准确、灵敏检测,适用于口岸快速检测CaYMV。
- 陈细红杨小龙廖富荣高芳銮沈建国
- 关键词：巢式PCR
- 番红花种球中虎眼万年青花叶病毒的分子鉴定与序列分析
- 2017年
- 【目的】对一批荷兰进境番红花种球(Crocus sativus)进行病毒鉴定,以防止危险性病毒传入危害。【方法】根据已报道的马铃薯Y病毒科(Potyviridae)通用引物(Sprimer和M4T),采用RT-PCR方法对一批番红花种球样品进行检测,取其中一个RT-PCR产物进行克隆测序,利用Gen Bank上的基本局部比对搜索工具(Basic Local Alignment Search Tool,BLAST)和MEGA 6中的基于对数期望的多重序列比较(Multiple Sequence Comparison by Log-Expectation,MUSCLE)进行序列比对分析,并根据外壳蛋白基因(coat protein,CP)序列利用最大似然法(maximum likelihood method)进行系统发育分析。【结果】RT-PCR检测结果显示该批样品扩增到一条约1.7 kb的预期大小片段,说明该批番红花种球样品中存在Potyviridae科病毒。测序获得长度为1 666bp的序列(命名为2677-NL),含有部分核内含体b基因(nuclear inclusion b,NIb)、完整的CP和3′端非编码区(3′-UTR),其核苷酸序列与虎眼万年青花叶病毒(Ornithogalum mosaic virus,Or MV)的SW3.3分离物具有最高序列一致性(99.6%),与Or MV参考基因组序列(Reference genomic sequences,Ref Seq;NC_019409)的序列一致性为99.1%。该分离物的CP与6个Or MV印度分离物(JQ686722、JQ686720、JN692498、JN692497、JN692496、JF682235)的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为71.5%—77.3%和65.7%—79.7%,与其他32个Or MV分离物的核苷酸和氨基酸序列一致性分别为77.9%—99.5%和82.9%—99.2%。基于CP进行的系统发育分析表明,Or MV可分为两个类群,而2677-NL与5个澳大利亚分离物(JQ807995、JQ807996、NC_019409、AF185964、AF185965)相聚成簇,表明其在系统发育关系上与Or MV澳大利亚分离物的亲缘关系最近。【结论】根据国际病毒分类委员会(ICTV)关于Potyviridae科病毒种类的分类标准,2677-NL为Or MV的一个分离物,证实该批番红花种球受到Or MV的侵染。这是世界上首次在番红花中发现Or MV的报道。
- 廖富荣林武镇陈细红陈细红陈红运黄蓬英方志鹏吴媛沈建国沈建国
- 关键词：番红花RT-PCR新寄主
- 全国口岸首次在进境番红花种球中截获植物病毒——虎眼万年青花叶病毒
- 2014年
- 番红花（Crocus sativus L．），又名藏红花、西红花，为鸢尾科（Iridaceae）多年生珍贵药用草本植物或观赏植物。2014年1月，机场局在香港至厦门的KA618次航班旅客行李中截获一袋来自荷兰的番红花种球。经植检实验室鉴定，从该批番红花种球中检出南芥菜花叶病毒（Arabis mosaic virus，ArMV）和虎眼万年青花叶病毒（Ornithogalum mosaic virus，OrMV），这是全国口岸首次在进境番红花种球中截获植物病毒的记录。
- 廖富荣陈青陈红运陈细红
- 关键词：南芥菜花叶病毒植物病毒番红花种球截获进境
- 同时检测七种水仙RNA病毒的多重RT-PCR检测试剂盒及其检测方法
- 本发明公开了同时检测七种水仙RNA病毒的多重RT‑PCR检测试剂盒及其检测方法。本发明的试剂盒可专用于同时检测水仙黄条病毒、水仙退化病毒、水仙潜隐病毒、南芥菜花叶病毒、水仙普通潜隐病毒、水仙花叶病毒和尼润潜隐病毒，该试剂...
- 沈建国高芳銮陈细红廖富荣何逸鹏
- 文献传递
- 尼润潜隐病毒和水仙普通潜隐病毒的双重RT‑PCR检测试剂盒及其检测方法
- 本发明公开了尼润潜隐病毒和水仙普通潜隐病毒的双重RT‑PCR检测试剂盒及其检测方法。本发明的试剂盒包括NeLV‑正向引物、NeLV‑反向引物、NCLV‑正向引物和NCLV‑反向引物、随机引物、RT Buffer、RNA酶...
- 沈建国高芳銮陈细红蔡伟何逸鹏
