刘莹
- 作品数：5 被引量：36H指数：4
- 供职机构：上海交通大学医学院附属第九人民医院更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金国家重点基础研究发展计划上海市科学技术委员会科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 有窦型与无窦型根尖周炎微生物群落比较被引量：4
- 2016年
- 目的:分析有窦型与无窦型根尖周炎感染根管内菌群结构的差异。方法:采集17例原发性根尖周炎的根管样本,其中有窦型9例、无窦型8例。分别经DNA抽提和16S r RNA基因V3区PCR扩增后,利用变性梯度凝胶电泳(DGGE)检测两组样本的微生物群落结构;然后分别采用聚类分析、主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)对两组样本的菌群结构进行比较,并对两组间有显著差异的相关区别条带进行割胶测序。结果:聚类分析、PCA、PLS显示,有窦型与无窦型样本的菌群结构存在差异,共有5条区别条带的检出水平在两组间显著不同(P<0.05)。测序结果提示,Dialister invisus、Bacteroidetes clone_X083、Pseudoramibacter alactolyticus与有窦型根尖周炎相关,而嗜糖普雷沃菌和纤细弯曲菌则与无窦型根尖周炎相关。结论:有窦型和无窦型根尖周炎感染根管内的微生物群落结构存在差异,Dialister invisus、Bacteroidetes clone_X083、Pseudoramibacter alactolyticus可能与窦道形成有关。
- 漆正楠尹君唐子圣刘莹邹岩
- 关键词：根尖周炎微生物群落DGGE窦道
- 慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落分析被引量：9
- 2011年
- 目的:运用DGGE技术检测慢性牙周炎龈下菌斑和唾液微生物群落结构,分析其菌群之间的关系。方法:选取34名慢性牙周炎志愿者,分别采集龈下菌斑和唾液样本,采用PCR扩增细菌16Sr RNA V3区后,运用DGGE技术分析各组样本微生物群落结构。通过数字化软件Im age J将DGGE凝胶图谱转成数字信息,对所得矩阵进行主成分分析(Princ ipal ComponentAnalysis,PCA)、聚类分析(C luster Analysis)和偏最小二乘法(Partial Least Squares,PLS)分析。结果:DGGE图谱显示:龈下菌斑DGGE条带数目为11～28,,平均19;唾液DGGE条带数目为11～24,平均17;PCA结果显示:龈下菌斑与唾液比较有明显的差异;聚类分析显示:龈下菌斑、唾液形成5个明显聚类群,在同一聚类群中相似度高,在不同聚类群中相似度低,表示龈下菌斑与唾液菌群之间有显著差异;PLS结果显示:慢性牙周炎龈下菌斑与唾液菌群有显著差异。结论:DGGE是一种能直观显示微生物群落的指纹技术。通过该技术能检测牙周、唾液微生物群落的结构和组成,本结果显示,慢性牙周炎龈下菌斑与唾液微生物群落结构有明显差异。
- 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣
- 关键词：微生物群落龈下菌斑唾液DGGE慢性牙周炎
- 口腔龈上菌斑5种DNA提取方法的比较被引量：3
- 2011年
- 目的寻找方便、快捷、经济、获取细菌信息量最多的细菌基因组DNA抽提方法。方法采用洗涤+冻融+BeadBeater+酚氯仿抽提法(X法)、试剂盒法(Y法)、洗涤+冻融+试剂盒法(Z法)、直接煮沸法(U法)和加Chelex-100后煮沸法(V法)5种DNA抽提方法,分别提取3例慢性牙周炎患者龈上菌斑DNA,检测DNA片段大小和浓度;同时运用变性梯度凝胶电泳分析样本微生物多样性和相似度,从多个角度对5种DNA提取方法进行评价。结果 X法DNA片段集中于3 000～20 000bp处;Y法和Z法DNA片段均匀分布于500～20 000 bp处;U法无明显DNA片段出现;V法DNA片段主要分布于500～2 000 bp处。Y法、Z法与V法所提DNA浓度较高,X法与U法所提DNA浓度较低。X法、Y法、Z法和V法反应的龈上菌斑微生物多样性无显著差异。X法、Y法和Z法的相似度较高,而V法与X法、Y法、Z法的相似度较低。结论洗涤+冻融+Bead Beater+酚氯仿抽提法,试剂盒法,洗涤+冻融+试剂盒法,加Chelex-100后煮沸法的DNA提取效果无显著差异;直接煮沸法的DNA提取效果较差。
- 刘莹吴明桃陈慧庞小燕赵立平唐子圣
- 关键词：DNA提取
- 慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落分析被引量：17
- 2015年
- 目的:分析慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落结构。方法:30名慢性牙周炎患者,分别采集龈上菌斑和龈下菌斑,运用DGGE技术分析两组样本微生物群落结构,采用聚类分析(CA)、偏最小二乘法(PLS)找出两组间存在明显差异的条带,通过测序确定与区别条带最相近的微生物。结果:CA和PLS结果均显示慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落结构存在显著差异;测序结果显示,福赛斯坦纳菌、牙龈卟啉单胞菌、齿垢密螺旋体、龈沟产线菌、卡氏卟啉单胞菌、普氏菌属、简明弯曲菌是龈下菌斑的相关优势菌,而索氏密螺旋体和有害新月形单胞菌是龈上菌斑的相关优势菌。结论:慢性牙周炎患者龈下菌斑和龈上菌斑微生物群落存在生物多样性及差异。
- 吴明桃刘莹漆正楠邹岩尹君庞小燕唐子圣
- 关键词：DGGE龈下菌斑
- 牙周健康者龈上菌斑与唾液微生物群落分析被引量：4
- 2013年
- 目的:分析牙周健康者龈上菌斑与唾液微生物群落的结构。方法:选取30名牙周健康志愿者,分别采集龈上菌斑及唾液样本,经DNA抽提与PCR扩增细菌16Sr RNA V3区后,运用DGGE技术分析各组样本微生物群落结构;并采用主成分分析(PCA)、聚类分析(CA)及偏最小二乘法(PLS)分析两组间检出水平存在明显差异的条带,通过割胶测序确定与区别条带最相近的微生物。结果:PCA、CA、PLS结果均显示,牙周健康者龈上菌斑与唾液微生物组成存在一定差异(P<0.05);测序结果提示,黄褐二氧化碳噬纤维菌、长奈瑟球菌和微黄奈瑟球菌在龈上菌斑内为优势菌群,而澳大利亚链球菌、谭氏普氏菌和黏滑罗斯菌在唾液内为优势菌群。结论:牙周健康者龈上菌斑与唾液微生物群落存在生物多样性及差异。
- 王畅刘莹漆正楠陈慧唐子圣
- 关键词：DGGE牙周健康唾液
