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橙色莫桑比克罗非鱼微卫星遗传多样性分析及其与尼罗罗非鱼差异位点的筛选被引量：18: 2008年; 用33对在尼罗罗非鱼（Oreochromis niloticus）中能有效扩增的微卫星引物，对橙色莫桑比克罗非鱼（Oreochromis mossambicus）进行PCR扩增，结果有32对引物能获得稳定的特异性条带，占总数的97．0％，其中15个微卫星位点具多态性，表明大部分尼罗罗非鱼的微卫星位点存在于橙色莫桑比克罗非鱼中。用具多态性的15个微卫星位点，对橙色莫桑比克罗非鱼30尾个体进行扩增分析，结果共检测到44个等位基因，大小在113～232bp之间，平均多态信息含量（PIC）为0．4308，平均观测杂合度（鼠）为0．5489，平均期望杂合度（垃）为0．5248，个体间平均遗传距离为0.3132，表明所选橙色莫桑比克罗非鱼群体遗传多样性较丰富，种群结构比较合理。本研究还对尼罗罗非鱼和橙色莫桑比克罗非鱼间特异位点进行了分析，发现有7个位点（UNH899、UNH208、UNH853、UNH876、UNH222、UNH933、UNH773）可有效区分莫桑比克罗非鱼和尼罗罗非鱼，可作为罗非鱼种质鉴定的分子标记。[中国水产科学，2008，15（3）：400-406]; 宋红梅白俊杰叶星刘宇飞; 关键词：微卫星标记尼罗罗非鱼

利用18个微卫星座位对剑尾鱼RR-B系遗传质量的分析: 2009年; [目的]为进一步了解剑尾鱼RR-B系的遗传质量,探讨微卫星标记技术在水生实验动物遗传监测中应用的可行性。[方法]选择18个在野生剑尾鱼群体中有多态性的微卫星座位,通过PCR扩增对剑尾鱼RR-B系(红眼红体)遗传质量进行分析。[结果]18个座位在RR-B系30尾个体中均为单态,且都是纯合子,基因纯合率达100%。[结论]18个微卫星座位可作为剑尾鱼RR-B系遗传监测的分子标记;剑尾鱼RR-B系经20多代的近交培育已具有很高的遗传均一性。该研究为水生实验动物分子监测标准的制定提供了基础数据。; 刘宇飞白俊杰全迎春叶星黄志斌; 关键词：剑尾鱼近交系微卫星

罗非鱼微卫星DNA指纹的计算机化鉴定: 2008年; 在奥利亚、尼罗和橙色莫桑比克3种罗非鱼的微卫星DNA指纹数据库构建基础上,为进一步开展实际生产应用而将其鉴定功能计算机化。在数据库中每种鱼都有其特异的DNA指纹,根据等位基因的有或无,把每个个体的指纹转换成由数字1和0组成的指纹数据,变为计算机可识别的语言,在此基础上,利用Net语言开发了一套应用软件——鱼类种质鉴定软件1.0,根据微卫星标记的共显性遗传原理,采用Nei公式,计算查询个体与相关群体的遗传距离,追溯该个体的可能来源。在实际应用中,只需将测试样品的扩增结果转换成指纹数据,由计算机辅助进行种质鉴定。该软件具有普适性,任何物种的微卫星数据都可导入进行相关的鉴定。; 宋红梅白俊杰刘宇飞李胜杰; 关键词：罗非鱼种质鉴定微卫星

剑尾鱼RW-H近交系20个微卫星位点的遗传结构被引量：9: 2007年; 为了对水生实验动物剑尾鱼（Xiphophorus helleri）RW-H系近交15代的遗传结构进行研究，寻找该近交系的标志基因位点，选择20个在野生剑尾鱼群体具多态性的微卫星位点，对剑尾鱼RW-H系（红眼白体）30尾个体进行分析。结果表明，其中有17个位点为单态，有可能作为该近交系的标志基因位点；另外3个位点Msa012、Msa033和Msc036具有多态性，多态信息含量值分别为0．3047、0．3457和0．3648。通过Pop-gene3．2软件分析得知全部基因位点的纯合率达到了95．83％，个体间平均遗传距离为0．0482（0．0000～0．1625），遗传相似系数为0．9518（0．8500～1．0000），说明剑尾鱼RW-H系已经具有很高的近交程度。几个多态性位点的发现，可以指导近交选育，加快选育进度。本研究方法不仅检测出剑尾鱼RW-H系具较低的遗传多样性，而且可为中国建立分子水平的实验动物监测标准提供基础数据。[中国水产科学，2007，14（4）：602—607]; 刘宇飞白俊杰李凯彬黄志斌全迎春; 关键词：剑尾鱼近交系微卫星

利用微卫星多重PCR技术鉴定剑尾鱼RR-B系被引量：1: 2007年; 目的建立多重PCR技术鉴定选育剑尾鱼RR-B系的方法。方法根据可明显鉴定剑尾鱼RR-B系的6对特异性微卫星引物Msa012、Msa014、Msa033、Msb025、Msd003、Msd051,采用不同的组合方式对RR-B系剑尾鱼和红眼红体的非选育剑尾鱼进行多重PCR扩增。结果引物组合1(Msa014、Msb025、Msd003)和组合2(Msa012、Msa033、Msd051)两个三重PCR反应体系能清楚的扩增各个微卫星座位,且各目的片段之间无干扰,易于识别,引物组合1的排除概率为99.98%,引物组合2的排除概率为99.96%,能准确鉴定剑尾鱼RR-B系。结论本检测方法具有较高的稳定性,可快速准确鉴定剑尾鱼RR-B系。; 刘宇飞白俊杰叶星宋红梅; 关键词：剑尾鱼近交系微卫星标记多重PCR

水生实验动物剑尾鱼的DNA指纹图谱构建被引量：5: 2011年; 目的剑尾鱼是由原良种委员会审定并由农业部公布的水生实验动物,在遗传学研究、水环境污染监测、细菌性疾病研究方面显示出较好的应用前景。为了对剑尾鱼选育系进行种质资源监测、区分选育系与非选育以及鉴定近交系纯度,本研究采用微卫星DNA进行水生实验动物剑尾鱼的指纹图谱构建。方法根据相关报道设计合成了50对微卫星引物,对几个剑尾鱼品系的种质资源进行检测,筛选品系间差异性引物;确立剑尾鱼核心引物,用EXCEL散点图绘制DNA指纹图谱模式图;并将数字化指纹数据输入珠江水产研究所鱼类种质鉴定软件V1.0,形成剑尾鱼标准化指纹图谱鉴定数据库。结果共获得剑尾鱼品系间特异标记5个可用于剑尾鱼近交系鉴定,确立46个微卫星标记为核心引物,构建剑尾鱼选育系RR-B系、RW-H系和非选育的野生品种的DNA指纹图谱。结论本研究筛选出的微卫星标记与构建的指纹图谱,可用于剑尾鱼3个品种间的品种鉴定、纯度检测及遗传监测。; 全迎春刘宇飞白俊杰; 关键词：剑尾鱼 DNA指纹图谱微卫星种质鉴定

微卫星标记在RR-B系剑尾鱼遗传监测中的应用被引量：5: 2007年; 采用49对微卫星引物对RR-B系剑尾鱼和红眼红体的非选育系剑尾鱼进行PCR扩增,有46个微卫星座位能获得稳定的扩增产物,7个微卫星座位能区分RR-B系与非选育群体剑尾鱼。7个微卫星座位在选育系剑尾鱼为单态纯合,而在非选育群体具有多态性,座位Msa014鉴定RR-B系剑尾鱼排除概率最高,为98.75%,座位Msd003排除概率最低达到了87.50%,其余5个座位排除概率介于两者之间。为方便今后的遗传监测,对RR-B系剑尾鱼样品的7个微卫星座位进行了测序,确定了其大小和具体的微卫星结构。本实验建立了RR-B系剑尾鱼分子检测方法,为实验动物剑尾鱼的遗传监测奠定了基础。; 刘宇飞白俊杰李凯彬; 关键词：剑尾鱼近交系微卫星标记

利用18个微卫星座位对剑尾鱼RR-B系遗传质量的分析(英文)被引量：2: 2008年; [Objective] The study aimed to further understand the genetic quality of Xiphophorus helleri RR-B strain and estimate the feasibility of microsatellite markers in genetic monitoring of aquatic laboratory animals.[Method] Eighteen microsatellite loci which had polymorphism in wild X. helleri were used for genetic quality analysis of RR-B strain (red eyes and red body) by PCR. [Result] All these 18 microsatellite loci displayed single allelic gene band in 30 individuals of X. helleri RR-B strain and the average homozygote rate reached 100%. [Conclusion] These loci could be used as markers in genetic monitoring of X. helleri RR-B strain, which had obtained fairly high genetic homozygosity by inbreeding for more than 20 generations. This study provided basic data for establishing the molecular genetic monitoring standard of aquatic laboratory animals.; 刘宇飞白俊杰全迎春叶星黄志斌; 关键词：XIPHOPHORUS INBRED MICROSATELLITE GENETIC

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刘宇飞

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