徐筠娉 作品数:81 被引量:86 H指数:5 供职机构: 深圳市血液中心 更多>> 发文基金: 深圳市科技计划项目 广东省科技计划工业攻关项目 广东省自然科学基金 更多>> 相关领域: 医药卫生 生物学 农业科学 化学工程 更多>>
人类白细胞抗原E基因全长序列测定及两个新等位基因的鉴定 2017年 背景:人类白细胞抗原E是非经典的人类白细胞抗原I类分子,目前的多态性分析研究主要针对其第3外显子人类白细胞抗原E~*01:01及人类白细胞抗原E*01:03进行区分,然而其全基因序列测定方法及新等位基因报道尚不多见。目的:利用中国深圳地区无偿献血正常个体建立人类白细胞抗原E基因全长序列测序分型方法,鉴定人类白细胞抗原E基因全长序列新的等位基因。方法:提取研究对象外周血DNA,根据IMGT/HLA数据库中公布的人类白细胞抗原E基因序列,在保守区设计全基因扩增及测序引物,利用高保真反应体系对人类白细胞抗原E全长序列进行扩增,随后测序、拼接、序列确认及基因定型。结果与结论:(1)成功建立了人类白细胞抗原E的全基因扩增及测序分型方法,发现了两个人类白细胞抗原E新等位基因——人类白细胞抗原E~*01:01:01:06与人类白细胞抗原E~*01:01:01:07,获得了WHO人类白细胞抗原命名因子委员会的命名;(2)人类白细胞抗原E~*01:01:01:06与其最接近的等位基因人类白细胞抗原E~*01:01:01:01相比,突变位点在5’-启动子区的NT-26(G->T),人类白细胞抗原E~*01:01:01:07与其最接近的等位基因人类白细胞抗原E~*01:01:01:01相比,突变位点在3’-非翻译区的NT3345位(T->C);(3)结果提示,中国人群中人类白细胞抗原E全基因序列多态性数据有待填补,试验建立的方法为该项研究提供了关键的技术。 何柳媚 王宋兴 徐筠娉关键词:PCR-SBT 多态性 新等位基因MICA*065的鉴定及其序列分析 2014年 目的 鉴定中国深圳地区人群中新发现的1个主要组织相容复合物Ⅰ类相关基因A位点(MICA)等位基因,并对该新MICA基因的突变情况进行分析.方法 选择2012年1~12月,于深圳市血液中心行组织配型的供、患者中,1例MICA基因分型异常的健康供者作为研究对象.采用自主建立的基于聚合酶链反应-碱基序列直接测序(PCR-SBT)法对本例供者MICA基因第2~5外显子进行测序分型,利用分子克隆和单倍体测序的方法,鉴定出该个体MICA等位基因的序列.利用序列比对方法,对该MICA等位基因的突变情况进行分析.结果 于本例供者血液样品中,检出了1个新变异的MICA等位基因,其序列与MICA* 010∶01最为相近,但存在基因组DNA nt 637位点的碱基由胞嘧啶(C)突变为胸腺嘧啶(T),MICA基因第4外显子中的第1 91位密码子由CGC变异为TGC,导致氨基酸由精氨酸变异为半胱氨酸,该序列提交国际GenBank数据库(序列号:JN043370)和国际免疫遗传学信息系统/人类白细胞抗原(IMGT/HLA)数据库(序列号:HWS10013775),已被命名为MICA* 065.结论 新等位基因MICA* 065的变异碱基T,是1个全新的随机突变位点,未在MICA其他等位基因中发现. 徐筠娉 王仙童 高素青 陶红中国人HLA-DQB1基因的单核苷酸多态性(SNPs)研究 本论文利用PCR及克隆方法对来自16个中国西南少数民族人群的HLA-DQB1基因的调控区、第一外显子、第四外显子、部分第一内含子、第三内含子及第四内含子的多态性分布进行了精细定位及群体遗传学分析。
在调控区及第一内... 徐筠娉关键词:HLA 单核苷酸多态性 群体遗传学 单倍型 文献传递 中国南方汉族人群KIR基因多态性的研究 2012年 目的探究中国南方汉族人群自然杀伤细胞免疫球蛋白样受体(KIR)基因的多态性及基因型和单体型特点,为KIR及KIR-HLA组合型多态性与疾病的关联研究提供基础数据资料。方法采用PCR-SSP方法对503名非亲缘关系的南方汉族个体进行KIR基因检测,依据Allele Frequency Net Database的国际标准对其进行基因型和单体型分析。根据第5外显子是否存在22bp碱基缺失,2DS4进一步分为2DS4-normal和2DS4-deleted等位基因。结果在检测的503份标本中,检出了目前已知的所有KIR框架基因, 甄建新 何柳媚 王大明 徐筠娉 邓志辉关键词:单体型 多态性 群体遗传学 亲缘关系 中国汉族群体HLA-Ⅰ类经典基因全长序列测定以及多态性研究 目的测定中国汉族造血干细胞捐献人群HLA-A,-B,-C基因全长序列并探讨基因各区域的多态性差异。方法每个基因分别设计两套全长序列PCR扩增引物,采用长距离PCR技术,利用Stratagene公司生产的高保真酶扩增研究群... 徐筠娉 邓志辉 高素青 王大明 邹红岩 杨宝成 曾健强广东汉族人群D22S1045、D1S1656、D2S441和D10S1248基因座的遗传多态性分析 2012年 目的调查广东汉族人群D22S1045、D1S1656、D2S441和D10S1248等4个短串联重复序列(STR)基因座的遗传多态性。方法采用德国Qiagen公司的Hexaplex ESS试剂盒复合扩增169个广东汉族个体的4个STR基因座。扩增产物经美国ABI公司的3100遗传分析仪电泳分析其基因型,在各基因座均符合Hardy-Weinberg平衡的基础上计算其遗传学参数:基因频率、杂合度(H)、多态信息含量(P1C)、个体识别能力(PD)和非父排除率(PE)。结果169名无关个体4个STR基因座中共检出40个等位基因,4个基因座的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05), 李桢 程良红 金士正 邹红岩 高素青 王大明 徐筠娉 何柳媚 邓志辉关键词:基因座 遗传多态性 短串联重复序列 基因频率 基因型分布 中国汉族个体外周血淋巴细胞表面HLA-E抗原的基因型特异性表达 目的利用中国汉族个体检测人外周血淋巴细胞表面HLA-E抗原表达,并分析基因型与表达的相关性。方法用淋巴细胞分离管sepmate分离人外周血淋巴细胞,然后用流式细胞术检测淋巴细胞表面HLA-E抗原的表达;同时提取研究对象的... 王宋兴 何柳媚 徐筠娉文献传递 运用单样本核酸扩增检测技术对提高深圳地区HIV检出率的效果分析 被引量:4 2018年 目的分析运用单样本核酸扩增检测技术(SS-NAT)对提高深圳地区HIV检出能力的效果,探讨SS-NAT对降低输血感染HIV残余风险的作用。方法采用Procleix Tigris单样本核酸检测系统和第三代、第四代两种酶联免疫吸附试验(ELISA)试剂对2015年1月至2017年8月采集的269 228份无偿献血者血液标本进行平行检测。对ELISA检测无反应性而SS-NAT有反应性的标本进行HIV鉴别试验,并对鉴别有反应性的献血者进行追踪检测。所有ELISA或SS-NAT HIV鉴别试验有反应性的样本均送到深圳市疾病预防控制中心(CDC)做免疫印迹法(WB)确证试验。结果 269 228份样本HIV第三代ELISA试剂检测有反应性188份,有反应性率为0.698‰(188/269 228),第四代ELISA试剂检测有反应性340份,有反应性率为1.263‰(340/269 228),两种ELISA试剂共检测有反应性422份,有反应性率为1.567‰(422/269 228),SS-NAT检测有反应性共103份,有反应性率为0.383‰(103/269 228),其中有4份ELISA无反应性而SS-NAT有反应性标本,对应献血者随访追踪血液标本ELISA和SS-NAT均呈有反应性。所有ELISA或SS-NAT HIV鉴别试验有反应性标本经CDC确认有103份标本呈阳性。ELISA检测后HIV窗口期检出率为1∶67 307(4/269 228)。结论 SS-NAT应用于血液筛查可提高HIV检出率,缩短HIV检测窗口期,降低输血感染HIV残余风险,从而有效提高输血安全性。 王宋兴 熊文 古醒辉 刘衡 徐筠娉 曾劲峰关键词:核酸检测 酶联免疫吸附试验 人类免疫缺陷病毒 窗口期 输血安全 汉族人群中一个少见等位基因HLA-DPA1*01:11的鉴定 目的:鉴定一个HLA-DPA1*01相关的新变异等位基因.
方法:在群体遗传学研究中,采用PCR产物直接测序分型方法,对HLA-DPA1基因第2外显子进行双向测序.对出现异常分型结果的样本,进行分子克隆和单倍体... 何柳媚 王大明 徐筠娉 邓志辉关键词:人类白细胞抗原 分子克隆 汉族人群 文献传递 抗原肽对人多发性骨髓瘤细胞HLA-E的表达调控及对NK细胞抗肿瘤活性的影响 目的 研究HLA-Ⅰ类基因抗原肽(B7)、巨细胞病毒(CMV)抗原肽对人多发性骨髓瘤细胞系U266表面HLA-E分子表达水平的调控及其表达水平的改变对NK细胞抗肿瘤活性的影响。方法 将体外合成的B7及CMV抗原肽与U26... 徐筠娉 王宋兴 何柳媚 高素青关键词:多发性骨髓瘤 抗原肽