李贡宇
- 作品数：24 被引量：225H指数：8
- 供职机构：北京中医药大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金北京市教育委员会共建项目北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生理学自动化与计算机技术政治法律更多>>
- 基于计算机辅助水解技术的芝麻寡肽体内转运性质预测被引量：2
- 2018年
- 目的基于计算机辅助技术预测芝麻寡肽的体内转运性质。方法收集芝麻中主要蛋白序列,以计算机辅助技术进行蛋白模拟消化水解,将水解获得的寡肽构建虚拟结构数据库。构建寡肽转运蛋白2(Pep T2)底物的支持向量机(SVM)模型后,通过数据处理和参数寻优方法挑选最优模型,预测芝麻Pep T2的底物成分。结果芝麻寡肽数据库共包括346条寡肽,利用筛选获得45个描述符,创建了Pep T2底物的SVM模型,模型的准确度、灵敏度和特异性均在85%以上。经受试者工作特征(ROC)分析,其曲线下面积(AUC)>0.9。利用Pep T2底物模型预测芝麻寡肽数据库,发现36%的芝麻寡肽具有通过Pep T2转运的潜在活性。结论利用计算机辅助水解技术构建了中药芝麻寡肽数据库,以Pep T2底物SVM模型预测芝麻寡肽的体内转运性质,模型准确、稳定、灵敏、特异性高,为开展寡肽类中药成分的性质研究提供了新的方法。
- 李贡宇乔连生陈茜陈艳昆刘思佳张燕玲
- 关键词：寡肽芝麻支持向量机
- 基于网络药理学与分子对接技术探讨藏族药佐木阿汤治疗高血压病的作用机制被引量：17
- 2020年
- 高血压病是由一系列因子和载体发生功能障碍而引起的一种慢性心血管系统疾病,属于藏族医"查隆病"的范畴,具有较高的致残率、致死率。佐木阿汤是藏族医中用于治疗"查隆病"的经典方药,然而其作用机制尚不清晰。因此该研究利用网络药理学与分子对接技术探讨佐木阿汤治疗高血压病多成分、多靶标、多通路的作用机制。首先,研究通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、中国知网以及万方数据库检索获得佐木阿汤的化学成分,利用BATMAN-TCM数据库筛选获取佐木阿汤的潜在作用靶点集,借助DisGeNET数据库收集高血压疾病靶点集,取2个靶点集交集获得佐木阿汤治疗高血压病的潜在作用靶点,并构建化学成分-靶点网络。其次将交集靶点导入STRING数据库中获得交集靶点互作关系并在Cytoscape中构建佐木阿汤治疗高血压病的蛋白互作网络。利用拓扑、GO、KEGG富集分析构建关键靶点-信号通路-生物过程网络图,共同探讨佐木阿汤治疗高血压病的作用机制。最后选取关键靶点构建药效辨识模型以验证佐木阿汤治疗高血压病的作用模式。研究结果显示佐木阿汤治疗高血压病的化合物-靶点网络中共包含61个化学成分与90个潜在作用靶点。对佐木阿汤治疗高血压病的蛋白互作网络分别进行拓扑、KEGG、GO富集分析,共获得21个佐木阿汤治疗高血压病的关键靶点,154条信号通路,382条生物学过程,对关键靶点、信号通路、生命过程进行综合分析,发现佐木阿汤通过调节肾素-血管紧张素-醛固酮系统、平衡细胞内钙和钠离子的浓度、调节血管收缩舒张功能发挥降压作用。以ACE,AGTR1和ADRB2为研究载体,对佐木阿汤化学成分进行分子对接研究,结果显示佐木阿汤化学成分与关键靶点具有较好的结合活性。该研究旨在为佐木阿汤治疗高血压病的深入研究提供思路,并为其临床合理应用提供�
- 贡巴加任越马婧更桑多杰仁青李贡宇尼玛次仁张燕玲
- 关键词：网络药理学分子对接高血压病ACE
- 基于PepT1-PPARα靶标组合的中药协同机制解析被引量：4
- 2017年
- 协同效应是中药发挥药效的主要作用机制,结合关键靶标组合探讨中药的协同效应是阐释中药协同机制的有效方法之一。寡肽转运蛋白(peptide transporter 1,PepT1)是药物吸收入血的关键靶标之一,约占总转运蛋白含量的50%。过氧化物酶体增殖物激活受体α(peroxisome proliferator-activated receprorα,PPARα)是贝特类降脂药物的作用靶点,其激动剂具有良好的降血脂药效。研究表明PPARα可反式激活PepT1的基因表达,PPARα激动剂可促进PepT1底物的吸收,从而共同发挥协同作用。因此,本研究拟基于PepT1和PPARα的靶标组合,发现中药活性成分中的PepT1底物和PPARα激动剂,并在一定程度上探讨中药活性成分吸收入血与降低血脂的协同机制。该研究基于前期实验室已构建的PPARα激动剂的融合药效团模型,筛选潜在的具有PPARα激动效应的中药活性成分,并追溯其来源中药。同时构建PepT1底物的支持向量机模型,预测中药中潜在的PepT1底物。通过分析2组筛选结果,发现三七-灵芝、三七-丹参组合可能通过PepT1和PPARα协同机制发挥降脂药效。该研究基于PepT1-PPARα的靶标组合,探索中药活性成分吸收与降脂药效的协同机制,为基于靶标组合探讨中药药代动力学参与的协同机制研究提供了一条新思路。
- 乔连生陈艳昆雒刚刚路芳刘思佳李贡宇张燕玲
- 关键词：PPARΑSVM分子对接
- 基于神经保护探讨补阳还五汤抗脑缺血损伤的多靶点作用机制被引量：25
- 2016年
- 目的利用分子对接技术阐释补阳还五汤在神经保护方面抗脑缺血损伤的多靶点作用机制。方法以补阳还五汤为研究载体,收集各味中药的成分及其代谢产物,选择通过保护神经元从而发挥抗脑缺血损伤的5个谷氨酸受体的7个活性位点为研究对象,利用分子对接技术筛选上述化学成分的潜在活性成分,并分析其作用机制。结果毛蕊异黄酮、刺芒柄花素、川芎哚和芍药新苷等大多数成分可同时作用于2个或2个以上的谷氨酸受体活性位点,体现补阳还五汤通过多成分作用于多靶点、多位点发挥保护神经元抗脑缺血损伤的作用;且大多数成分来源于君药黄芪,少数成分来源于臣药当归尾和佐药川芎、赤芍、红花,与补阳还五汤君臣佐使的配伍原则一致。结论初步揭示补阳还五汤通过多成分作用于多靶点、多位点发挥保护神经元治疗脑缺血损伤的作用机制,为补阳还五汤的临床应用以及实验研究提供了一定的方向,同时也为研究抗脑缺血损伤中药研发提供借鉴。
- 路芳蒋芦荻陈艳昆雒刚刚刘芳李贡宇张燕玲
- 关键词：补阳还五汤神经保护脑缺血损伤分子对接多靶点
- 试述党领导人民开展灾害救助的实践、经验和启示
- 2013年
- 中共十五大以来党的执政能力有了显著提高,逐渐形成了较为成熟的灾害救助思想,我国的灾害救助体制也逐渐得到改革和完善,并在实际救灾过程中发挥了重大作用,取得了显著成效,本文将以汶川抗震救灾为例,对中共十五大以来的灾害救助实践及经验启示进行总结,以期为以后的灾害救助工作提供可能的借鉴。
- 马玉飞李贡宇
- 关键词：十五大以来中国共产党灾害救助
- 基于网络药理学与分子对接探讨藏族药浴基础组方五味甘露治疗膝关节炎的作用机制被引量：8
- 2021年
- 五味甘露由麻黄、侧柏、具鳞水柏枝、青蒿、烈香杜鹃5味药组成,具有发汗、消炎、止痛、调整黄水、活血通络等药效,在此基础上衍生出多种藏族药浴配方,可用于五脏六腑、关节、皮肤、神经等病症的治疗。现代研究表明五味甘露对膝关节炎(knee osteoarthritis, KOA)具有良好的治疗效果,因此该研究基于网络药理学及分子对接技术对五味甘露治疗膝关节炎的作用机制进行了探讨。首先通过文献挖掘及数据库检索获得五味甘露的化学成分,基于BATMAN-TCM数据库预测成分潜在作用靶点。将五味甘露潜在作用靶点导入STRING数据库获取蛋白互作关系,采用MCODE进行网络功能模块分析,并对模块进行功能注释以解析五味甘露发挥疗效的潜在作用模式。其次,通过DisGeNET数据库收集膝关节炎相关靶点,合并获得五味甘露治疗膝关节炎的交集靶点,分析探讨五味甘露治疗膝关节炎的作用机制。最终选取关键靶点与五味甘露化学成分进行分子对接以验证分析两者的相互作用。研究获得550个五味甘露化学成分,1 365个潜在作用靶点,对五味甘露蛋白互作网络进行模块分析发现方剂可发挥氧化还原、炎症及骨吸收、骨矿化等作用。将五味甘露成分潜在作用靶点与KOA疾病靶点取交集,筛选出交集靶点19个,分析发现五味甘露主要通过作用于核转录因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)、白细胞介素1β(interleukin^(-1) beta, IL1β)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor, TNF)、白细胞介素6(interleukin-6,IL6)、白细胞介素1受体拮抗剂(interleukin^(-1) receptor antagonist protein, IL1RN)及前列腺素内过氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase-2,PTGS2)而发挥治疗KOA作用。以TNF、PTGS2为研究载体,对五味甘露化学成分进行分子对接研究,在五味甘露的550个化学成分中,TNF命中252个潜在活性成分,PTGS2命中163个潜在活性成分,结果显示�
- 更桑马婧任越贡巴加才让南加李贡宇顿珠张燕玲
- 关键词：五味甘露膝关节炎网络药理学分子对接
- 大豆总黄酮对实验性大鼠高脂血症的治疗作用
- 王继峰李峨李贡宇张秋菊
- 关键词：高血脂症
- 文献传递
- 基于PPARα激动剂的融合药效团模型的构建及评价被引量：3
- 2016年
- 药效团是最常用的虚拟筛选方法之一，主要包括配体药效团模型和受体药效团模型两大类．配体药效团通常具有阳性化合物命中率高的优势，但却具有准确率低的特点，受体药效团通常具有较强的特异性，但却具有漏筛率高的问题．因此，合理地利用两种类型的药效团的优势，有效地规避它们的缺点，是药效团研究与应用的重要方向．本研究拟基于PPARα激动剂探讨融合药效团模型构建的思路与方法．首先，分别构建PPARα激动剂的配体和受体药效团模型．通过比较两种药效团模型的药效特征的差异，确认主要及次要的药效特征．进一步以受体药效团模型为模板，调整其主要和次要药效特征的半径及权重，通过单因素实验及正交试验设计，获得半径及权重的最优值，从而构建最优的融合药效团模型．最优融合药效团被用于进一步的中药化学成分PPARα激动活性预测．随后，通过三个化合物数据库的筛选，评价融合药效团准确性、可靠性和适用性，并以筛选效率为指标，比较融合药效团与其他分子模拟模型及筛选方式的优劣．结果发现，针对PPARα激动剂，融合药效团模型具有比单一药效团模型更好的筛选效率．同时，融合药效团也具有与药效团联合筛选相近的筛选效率，且具有更好的化合物活性评价能力，能合理的规避配体药效团与受体药效团计算预测结果不一致的问题．研究结果显示，融合药效团模型具有独特的优势，可以进一步用于化合物生物活性的计算及药物设计研究．
- 乔连生贺昱甦霍晓乾蒋芦荻陈艳昆陈茜张燕玲李贡宇
- 关键词：PPARΑ激动剂分子对接
- 药物流行病学在药品不良反应监测与评价中的应用被引量：3
- 2012年
- 药物流行病学是临床药理学与流行病学两个学科相互交叉、渗透、延伸而发展起来的新的医学研究领域,是运用流行病学技术与方法研究人群中药物利用及作用规律的药学分支学科。药物流行病学常用研究方法包括病例对照研究、队列研究、系统综述评价和横断面研究等。其在药品不良反应监测和评价领域具有广泛而深入的使用空间。
- 吴嘉瑞张冰董玲王璞李贡宇盛晓光
- 关键词：药物流行病学
- 大豆提取物对去卵巢大鼠能量平衡的作用
- 本文观察大豆提取物及大豆异黄酮对去卵巢大鼠的能量代谢的作用,旨在探讨安全有效的防治更年期疾病的有效中药.
- 王继峰李华牛建昭张弛李贡宇屠衡箐
- 关键词：大豆提取物动物实验能量代谢
- 文献传递
