陈文标
- 作品数：8 被引量：1H指数：1
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- 123 I-血管内皮生长因子结合位点在人类肿瘤细胞的表现特征
- 2014年
- 目的 探索肿瘤血管内皮生长因子（VEGF）受体（VEGFR）在人类肿瘤细胞的表现特征.方法 将123 I-VEGF165和123 I-VEGF121标记于人脐静脉内皮细胞（HUVEC）、人类肿瘤细胞株（HMC-1、A431、KU812、U937、HEP-1、HEP-G2、HEP-3B、Raji）、多种人体肿瘤及邻近的非瘤组织和外周血液细胞.统计特异性结合位点最大结合容量（Bmax）值、解离常数（Kd）以及放射性同位素的50％特异性结合所需浓度（IC50）数值.判断各种细胞与123I-VEGF165和123I-VEGF121结合亲和力、数量、特异性.结果 在HUVEC表面发现两种123I-VEGF165结合位点,而123I-VEGF121是单类结合位点.123I-VEGF121位于特定细胞株（HUVEC、HEP-1、HMC-1）和特殊的早期肿瘤（早期黑色素瘤、乳腺导管内癌、卵巢癌和脑膜瘤）中.与外周血液细胞和非瘤组织相比,肿瘤细胞的VEGFR数量明显较多.在123I-VEGF165标记的VEGFR中,早期黑色素瘤、乳腺导管内癌、肝细胞癌、乳头状甲状腺癌、卵巢癌、肾细胞癌的Bmax值分别为45±13、13±3、25 ±8、5±2、42±12、20 ±6.而在123I-VEGF121标志的VEGFR中,早期黑色素瘤、乳腺导管内癌、卵巢癌的Bmax值分别为30 ±8、8±3、20 ±6.123I-VEGF165和123I-VEGF121与诸多人体肿瘤细胞或组织具有特异性结合能力.与123I-VEGF121相比,123I-VEGF165可与更多不同种类的肿瘤细胞相结合,且容量大.结论 123I-VEGF165可能是肿瘤体内成像的一个潜在有效靶点,有望用于肿瘤的诊断与治疗.
- 陈文标李树人齐素文陈德珩戴勇
- 关键词：血管内皮生长因子类肿瘤放射性核素成像
- 构建Alport综合征患者iPSCs差异性表达microRNA，proteome，transcriptome的关联调控网络
- 目的：构建来源于Alport综合征（Alport syndrome，AS）的多能诱导干细胞（induced pluripotent stem cells，iPSCs）差异性表达的微小核糖核苷酸（microRNA），蛋白组...
- 陈文标
- 关键词：ALPORT综合征
- 文献传递
- 胃癌患者长链非编码RNA的差异表达
- 2015年
- 目的研究胃癌患者癌组织长链非编码RNA(lncRNA)的差异表达。方法提取8例胃癌患者癌组织与癌旁对照样本中的总RNA,应用lncRNA表达谱芯片检测技术对两者之间差异表达的lncRNA进行分析。在差异表达倍数≥10的lncRNA中选择4个lncRNA(uc010lhn、uc.341、AK096257及BC048127),利用荧光定量RT-PCR技术在细胞水平对微阵列检测结果进行验证。结果胃癌患者癌组织与癌旁对照样本间差异表达的lncRNA共2 621个,其中1 215个表达上调,1 406个表达下调,差异表达倍数≥10的lncRNA 22个。荧光定量RTPCR验证结果显示,与正常胃上皮细胞系GES-1相比,4种lncRNA(uc010lhn、uc.341、AK096257及BC048127)在胃癌细胞系中的表达具有显著差异,与芯片检测结果一致。结论多种lncRNA在胃癌患者肿瘤组织中呈异常表达,其中uc010lhn及uc.341等在胃癌发生、发展过程中可能起一定的作用。
- 朱莹林小聪林烈文陈德珩陈文标黄建溶戴勇潘凯涂植光
- 关键词：胃癌长链非编码RNA基因表达
- 基于诱导多能干细胞的Alport综合征差异性表达小核糖核酸的生物信息学分析
- 2014年
- 目的寻找Alport综合征患者(AS)与健康对照者(NC)差异性表达小核糖核酸(micro RNAs)。分析差异性表达micro RNAs的生物信息学特点。方法收集AS与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多能干细胞(i PSCs)。运用高通量测序找出2组之间差异性表达的micro RNAs,用于预测特异性靶基因。靶基因可进行gene ontology(GO)富集与Kyoto encyclopedia of genes and genomes(KEGG)通路信号分析。确定差异性表达的micro RNAs靶基因的主要富集位点与通路信号条目。结果在2组样本中发现30个micro RNAs具有差异性表达,包括19个上调与11个下调。差异性表达micro RNAs靶基因GO富集主要聚集在细胞分子、细胞组成与细胞生物学过程。嘌呤代谢通路与丝裂原激活的蛋白激酶是主要的KEGG信号传导通路。结论差异性表达micro RNAs靶基因的生物信息学可能在AS发病机制中起重要作用,可作为潜在靶点用于AS病因的深入研究。
- 陈文标黄建溶彭武建林小聪戴勇
- 关键词：ALPORT综合征
- Alport综合征iPSCs差异性表达新小核糖核苷酸的分析
- 2015年
- 目的构建Alport综合征(AS)与正常对照者(NC)诱导多能干细胞(i PSCs)新核糖核苷酸(novel microRNA)差异性表达谱,分析其靶基因功能。方法采用前期工作成功从尿肾状杆细胞诱导成的i PSCs,运用高通量测序平台获得AS与NC的差异性表达谱,使用靶基因预测软件Target Scan进行靶基因预测,靶基因与参考基因比较后,在候选靶基因找到显著富集的GO条目及KEGG通路。结果在AS与NC中发现49个有意义的差异性表达novel microRNAs,其中33个表达上调,16个表达下调。在GO靶基因富集分析中,靶基因主要富集于生物调节、生物新陈代谢、细胞组成、细胞信号传导、酶催化反应、分子转运等过程。在KEGG通路分析中,靶基因主要参与代谢通路、嘌呤代谢、癌症转录调节等过程。结论来源于AS与NC的i PSCs存在较大的差异性表达novel microRNA,其靶基因在分子功能、细胞组成、生物过程起着重要作用。这些差异性表达的novel mciroRNAs与靶基因可能是AS发病机制的潜在位点。
- 陈文标喻祥琪戴勇
- 关键词：ALPORT综合征诱导多能干细胞
- 构建SLE患者novel microRNA差异性表达谱及其靶基因的功能分析
- 2015年
- 目的构建系统性红斑狼疮(SLE)患者与健康对照者(NC)新小核糖核酸(novel microRNA)的差异性表达谱;对显著性差异表达的novel microRNA进行靶基因预测,对靶基因的GO(gene ontology)及KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)的功能进行分析,探讨SLE的发病机制。方法运用高通量测序技术(high-throughput sequencing)获得SLE与NC总的RNA,对总RNA进行长度分布、基因比对、RNA分类注释、RNA特有及公共序列统计后,运用Mireap软件预测novel microRNA。得到novel microRNA进行差异性表达分析,寻找两组之间具有显著性表达的novel microRNA。采用Targetscan软件对差异性表达的novel microRNA进行靶基因预测,并选取靶基因借用DAVID功能注释软件对其参与的生物学过程进行GO富集及KEGG通路分析。结果 61个novel microRNAs在SLE与NC组之间具有显著差异性表达,其中43个上调表达,18个下调表达。差异性表达novel microRNA的靶基因主要富集在细胞与小分子结合、细胞器官与细胞膜、细胞代谢中。靶基因KEGG通路主要体现在粘附复合体通路中。结论 SLE与NC的novel microRNA存在差异性表达。差异性表达novel microRNA的靶基因可能在SLE的发病机制与临床症状中起着重要作用,可能作为特异性靶点深入研究。
- 陈文标戴勇钟馨叶素惠何桂芳缪蕙丘衍博李朝辉
- 关键词：靶基因
- 基于诱导多潜能干细胞Alport综合征的蛋白质组学研究被引量：1
- 2015年
- 目的筛选并鉴定Alport综合征(AS)患者与健康对照者(NC)差异性表达蛋白质,寻找AS的生物标记物。方法收集AS组与NC组的尿液,从尿液中分离尿肾脏管细胞,将尿肾脏管细胞诱导分化成多潜能干细胞(i PSCs)。运用i TRAQ技术找出两组之间差异性表达蛋白质。采用Western blot检测差异蛋白质。结果共鉴定出12 600条特有肽段序列,对应3 470种非冗余蛋白质。在两组样本中发现383种蛋白质具有差异性表达,其中差异2倍以上的蛋白质有35种,包括18种上调蛋白质和17种下调蛋白质。Western blot检测KRT14、TUBA1A、PAPSS1、UTF1、SF3B14、MTHFD2等6种差异蛋白质在各组中的表达结果与i TRAQ检测结果一致。结论筛选得到与AS发病相关的差异蛋白质,可以作为AS早期诊断和治疗的生物标记物。
- 喻祥琪黄建溶林小聪陈文标戴勇
- 关键词：ALPORT综合征多潜能干细胞蛋白质组学
- 高通量测序筛查特发性膜性肾病患者外周血细胞microRNA的差异性表达
- 2014年
- 目的 :寻找特发性膜性肾病(idiopathic membranous nephropathy,IMN)患者外周血单个核细胞小核糖核苷酸(micro RNA)的差异性表达以及发生碱基突变的难易度。方法:运用高通量测序技术分别对IMN患者和健康对照者(NC)的micro RNA进行测序,构建IMN与NC组之间micro RNA差异性表达谱。并对两组的micro RNA进行碱基编辑分析,寻找发生了碱基突变的micro RNA,比较IMN与NC组micro RNA碱基突变的难易程度。结果:通过构建表达谱,找到了has-mi R-208b、has-mi R-195-3p、has-mi R-23b-5p、has-mi R-95、has-mi R-503、has-mi R-449a、has-mi R-486-3p与has-mi R-27 8个micro RNAs最具有差异性表达。2组共同表达的41个micro RNA中,IMN比NC更容易发生碱基编辑而引起碱基突变。结论:IMN患者与健康对照者的micro RNA存在着差异性表达,差异性表达的micro RNA特异性很高,可以作为深入研究IMN发病机制的靶点。IMN患者相比健康对照者更容易发生micro RNA碱基编辑引起碱基突变,这些发生碱基突变的micro RNA可能用于解释IMN的病因基础。
- 陈文标黄建溶喻祥琪彭武建林小聪戴勇
- 关键词：膜性肾病高通量测序
