牛群 作品数:30 被引量:71 H指数:5 供职机构: 广州市胸科医院 更多>> 发文基金: 广州市科技计划项目 广东省自然科学基金 广东省科技计划工业攻关项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 轻工技术与工程 更多>>
结核病传播链分子流行病学研究的病例选择方法初探 2017年 目的对以患者居住地为基础的结核病传播链分子流行病学研究的病例选择方法进行理论性评估。方法在本院建立的广州地区分枝杆菌菌株库中提取9234株结核分枝杆菌相应的患者信息资料,以患者居住地假定其间传播关系的有无,分析每条传播链中患者发病时间间隔及年龄组合情况。结果以县-乡镇-村-组等农村区划、市-区-社区-街道等城市区划为路线,发现387条假定结核病传播链,以2-5病例传播链为主,分别为210、100、35、23条,其它则包括6、7、8、11、12病例传播链,分别为6、7、4、1、1条。从传播链中患者居住地看,农村地区以同村为主,占农村区划传播链的89.39%(59/66),城市地区以同街道为主,占城市区划传播链的89.10%(286/321);传播链中患者发病时间间隔在半年、1年、1年半、2年、2年半、3年内及大于3年的传播条数分另为131、81、59、59、50、6和1;按少年(〈15岁)、青年(15-44岁)、中年(45-64岁)、老年(≥65岁)4个年龄段划分,不同性别跨1年龄段、同性别同年龄段、不同性别跨2年龄段、不同性别同年龄段、同性别跨1年龄段、同性别跨2年龄段、不同性别跨3年龄段的传播链条数分别为94、69、69、67、59、28、1条。结论以患者居住地为基础的传播链分析所获得的结核病传播链分子流行病学研究的病例比较符合现行结核病传播理论,在结核病传播链分子流行病学研究中切实可行。 吴玲 王楠 雷杰 竺澎波 孟繁荣 谢贝 杨瑜 牛群 谭守勇 邝浩斌 刘志辉关键词:结核病 传播链 分子流行病学 402例广州市耐多药结核病患者人口学特征分析 2017年 目的通过耐多药结核病患者人口特征分析,初步探索本市耐用多药结核病流行规律。方法依托本院广东地区结核病生物样本库信息资料系统,对2009—2015年来就诊且相关资料齐备的402例耐多药结核病患者进行回顾性分析,从患者性别构成、户籍类别、居住地域分布、年龄结构等方面探讨其人口学特点。结果在402例耐多药结核患者中,男、女性别比为2.12。其中:广州市户籍人口患者占56.96%(229/402)、广东省内流动人口患者占15.92%(64/402)、广东省外流动人口患者占27.11%(109/402);中心城区人口和城市郊区人口患者分别占56.72%(228/402)和43.28%(174/402);少年(<15岁)、青年(15~44岁)、中年(45~64岁)、老年(≥65岁)年龄别患者分别占0.25%(1/402)、57.96%(233/402)、30.85%(124/402)、10.95%(44/402)。结论广州市耐多药结核病流行具有以中青年为主、在人口稠密的城市中心区居住与流动人口所占例大等人口学特点,预示其控制难度大,必须高度关注并采取强力措施以遏制耐多药结核病的蔓延。 吴玲 刘志辉 雷杰 王楠 牛群 谭守勇 邝浩斌关键词:结核 耐多药 人口学特征 结核分枝杆菌和4种缓慢生长非结核分枝杆菌早期培养滤液蛋白分析 目的:了解结核分枝杆菌、鸟-胞内分枝杆菌复合群、堪萨斯分枝杆菌、戈登分枝杆菌、瘰疬分枝杆菌液体培养早期的蛋白质代谢与分泌活动,以进一步加深对它们致病性的理解,并初步分析由此途径寻找准确、快速鉴定这些菌种的新型标志物的可能... 曹翌明 刘志辉 孟繁荣 谢贝 蔡杏珊 黄业伦 牛群 雷杰 高俊文 谭耀驹关键词:结核分枝杆菌 文献传递 应用流式细胞术鉴定结核分枝杆菌利福平敏感性的研究 被引量:1 2019年 目的 探究流式细胞术(flow cytometry,FCM)检测结核分枝杆菌(Mycobacteriumtuberculosis,MTB)利福平(Rifampicin,RFP)药物敏感性的可行性。方法 对结核分枝杆菌临床分离全敏株与耐RFP株菌悬液用12.5μg/ml、25.0μg/ml、50.0μg/ml、100.0μg/ml的RFP液作用3 d、7 d或10 d后,经荧光素双醋酸酯(Fluorescein diacetae,FDA)染色;1.56μg/ml、6.25μg/ml、25.00μg/ml、100.00μg/ml的RFP液作用1 d、3 d、7 d后经碘化丙啶(Propidium iodide,PI)染色,采用FCM检测其平均荧光强度(Meanfluorescence intensity,MFI)值,并计算其敏感指数(实验管MFI/对照管MFI),依据受试者工作曲线(Receiveroperating characteristic curve,ROC)统计各药物浓度及处理时间下FCM FDA鉴定MTB RFP敏感性的诊断性能,选定基于FDA和PI的FCM法鉴别MTB RFP敏感性的最佳条件与区分MTB RFP敏感或耐药的敏感指数界值。分别对95株和78株MTB临床分离株进行基于FDA和PI的FCM药物敏感性测定并与比例法药敏实验进行比较。结果 基于FDA的FCM检测MTB RFP敏感性的最佳条件是12.5μg/ml的RFP处理7 d,敏感指数界值为0.75,检测结果准确度为88.4%,灵敏度为90.2%,特异度为87.0%,与比例法比较差异无统计学意义(χ^2=0.364,P=0.549)。基于PI的FCM检测,MTB RFP敏感性的最佳条件是1.56μg/ml的RFP处理1 d,敏感指数界值为1.12,检测结果准确度为84.6%,灵敏度为85.7%,特异度为83.7%,与比例法比较差异无统计学意义(χ^2=0.083,P=0.774 5)。结论 基于FDA或PI的FCM法均可应用于MTB临床分离株的RFP敏感性检测。 谢贝 孟繁荣 李华 刘志辉 王伟亮 王楠 邓丽 吴玲 雷杰 杨瑜 牛群 张言斌关键词:流式细胞术 结核分枝杆菌 利福平 碘化丙啶 痰液MPT64检测对分枝杆菌早期鉴别的应用探讨 2022年 本文就痰液MPT64检测对分枝杆菌早期鉴别的应用探讨,旨在为临床上利用MPT64检测试剂对分枝杆菌早期鉴别的应用提供依据;方法 收集2022年1月至2022年6月在广州市胸科医院收治的住院患者,选取痰涂片阳性标本100例作为研究对象,分成两组采用不同缓冲液作标本预处理后,分别行MPT64检测(金胶法)及痰液PCR荧光探针法。其中对照组标本中加入生理盐水5ml,离心后取上清液行MPT64检测。观察组标本中加入自行配制中性消化液(每50ml的PH 7.4的磷酸盐缓冲液加0.1g二硫苏糖醇)约5ml,痰液稀释后行MPT64检测。结果 对照组患者中MPT64检测结核分枝杆菌阳性者21例,阴性29例,阳性率为42.0%,对照组患者PCR检测结核分枝杆菌阳性者45例,阴性5例,阳性率为90.0%,两组患者之间比较有差异,差异有统计学意义(χ2=25.688,P=0.000),试验组患者中MPT64检测结核分枝杆菌阳性者31例,阴性19例,阳性率为62.0%,试验组患者PCR检测结核分枝杆菌阳性者46例,阴性4例,阳性率为90.0%,两组患者之间比较有差异,差异有统计学意义(χ2=12.705,P=0.000)。结论 痰液直接检测MPT64对早期鉴别肺结核与非结核有辅助意义,特异性高,但敏感性较低,不如PCR荧光法。MPT64检测操作过程中通过自配中性消化液预处理标本的方法检测可明显提高阳性率,且操作更为便捷。 梁小成 牛群关键词:痰液 分枝杆菌 中国氟喹诺酮耐药结核分枝杆菌gyr基因序列特征分析 被引量:4 2020年 目的明晰我国氟喹诺酮类药物耐药结核分枝杆菌株gyrA、gyrB基因突变的分子特征。方法以检索式"quinolones resistance AND Mycobacterium tuberculosis AND(China OR Hong Kong OR Tai Wan OR Macon)"和"结核AND喹诺酮耐药"分别在英文数据库(pubmed、Embase、SciFinder)和中文数据库(万方、中国知网、中国生物医学文献服务系统与维普期刊资源服务平台)中检索有关我国结核分枝杆菌喹诺酮类药物耐药基因突变的研究文献,对符合纳入标准的文献中氟喹诺酮耐药基因gyrA、gyrB进行突变位点和氨基酸变化类型等计数资料的信息提取和分析。结果 32篇外文和23篇中文文献纳入研究,3 641株氟喹诺酮类耐药结核分枝杆菌的gyrA基因得到分析,其中1 958株同时分析了gyrB基因。3 641株耐药菌中,2 830株检测到gyrA基因突变(突变率为77.73%),共47种突变类型,均为氨基酸错义突变,其中单位点、双位点突变的发生率分别为75.83%和1.92%,94、90、91位密码子突变率分别为49.33%(1 796/3 641)、19.14%(697/3 641)、5.80%(211/3 641),出现频率最高的突变类型依次为Asp94Gly、Ala90Val、Asp94Ala、Asp94Asn、Ser91Pro、Asp94Try;1 958株耐药菌中,175株发生gyrB基因突变(突变率为8.94%),其中56株的29个突变类型为gyrB单基因突变,其余119株36种突变类型与gyrA基因突变共同发生,占gyrB序列突变的68%。结论我国结核分枝杆菌氟喹诺酮耐药株gyrA基因突变以94、90、91位密码子单位点突变为主;gyrB基因突变位点较为分散,常与gyrA基因突变伴随发生。 孟繁荣 杨瑜 雷杰 王楠 李华 谢贝 邓丽 牛群 竺澎波 高俊文 刘志辉关键词:结核分枝杆菌 氟喹诺酮耐药 GYRA GYRB 异烟肼敏感与耐药结核杆菌临床分离株培养滤液蛋白比较分析 被引量:1 2014年 目的:寻找异烟肼耐药结核杆菌特异性分泌蛋白。方法应用弱阳离子交换蛋白质芯片( WCX2)捕获并应用表面增强激光解析-电离飞行时间质谱( SELDI-TOF-MS)技术对1株异烟肼单耐药结核杆菌和1株异烟肼敏感结核杆菌临床分离株7天及14天Middlebrook 7H9培养滤液蛋白进行比较,描述性分析其差异。结果在异烟肼敏感和异烟肼单耐药结核杆菌株7天及14天Middlebrook 7H9培养滤液中分别检测到164、175、133、147种蛋白质/多肽,其相对分子量(依质荷比m/z而得)范围分别为982~9328、997~9327、1050~8903、996~9369,表达丰度(通过质谱峰面积计算)分别为17~2100、21~1943、60~5355、41~3267;异烟肼单耐药结核杆菌株与异烟肼敏感结核杆菌株相比较,7和14天培养滤液分别存在47与58种差异蛋白质/多肽,这些差异蛋白质相对分子量在1083~8812、1012~9327之间,表达丰度在76~1811、25~3010之间。结论异烟肼敏感结核杆菌和耐药结核杆菌液体培养早中期滤液蛋白质存在差异,但是否为异烟肼耐药结核杆菌特异性分泌蛋白则有待进一步证实。 曹翌明 孟繁荣 谢贝 蔡杏珊 黄业伦 牛群 雷杰 高俊文 谭耀驹 刘志辉关键词:结核杆菌 异烟肼 以居住地域为基础的广州地区结核病传播链分子流行病学初探 被引量:1 2020年 目的探讨MIRU-VNTR基因分型技术用于分析广州地区结核病传播关系的可行性。方法以结核患者居住地所属乡镇村组或社区街道相同为前提,假定居住所属地相同结核患者间存在传播关系,拟定广州地区结核病传播链。培养结核分枝杆菌临床分离株并提取DNA,通过PCR扩增进行29位点MIRU-VNTR基因分型分析,并计算HGDI分辨力指数。以基因型成簇与否评价传播链内结核患者间传播关系的有无。结果拟定了178条广州地区结核病传播链,复苏得到456株结核分枝杆菌临床分离株,提取获得其基因组DNA并扩增了29个VNTR位点,其组合HGDI分辨力指数为0.986。基因成簇性分析显示,有2条传播链内患者结核分枝杆菌临床分离株基因成簇,成簇率为1.10%。基因成簇性的2条传播链患者分别居住于同街道,发病时间间隔在2年以内,分别为9和14个月。结论29位点MIRU-VNTR基因分型技术可用于广州地区结核分枝杆菌基因型分析,能否用于结核病传播关系需要进一步深入研究。 竺澎波 王楠 孟繁荣 杨瑜 雷杰 牛群 谢贝 吴玲 李华 刘志辉 刘文关键词:结核 结核分枝杆菌 传播链 稀释剂种类和冻融次数对质粒标准品实时荧光定量PCR检测的影响 被引量:2 2019年 目的探讨稀释剂种类和冻融次数这两种因素对实时荧光定量PCR检测中质粒标准品的影响。方法 分别采用ddH2O和TE缓冲液两种稀释剂将质粒标准品稀释为1×10^8、1×10^7、1×10^6、1×10^5、1×10^4拷贝/μl的5个浓度检测液各5份,在冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次之后进行实时荧光定量PCR检测,比较其Ct值。结果 ①浓度1×10^8、1×10^7、1×10^6、1×10^5、1×10^4拷贝/μl时,冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次之后,质粒标准品在ddH2O和TE缓冲液两种稀释剂中,实时荧光定量PCR检测Ct值中位数分别为17.46和17.32(P>0.05),23.52和23.61(P>0.05),26.77和26.37(P>0.05),32.73和30.88(P<0.05),33.08和31.51(P<0.05)。②冻融1次、5次、10次、15次、20次和25次,在ddH2O和TE缓冲液中,各浓度标准品Ct值中位数分别如下:1×108拷贝/μl:17.43、17.56、17.45、17.45、17.26、17.94(P>0.05)和17.38、17.36、17.47、17.31、17.30、17.62(P>0.05);1×10^7拷贝/μl:22.17、23.16、24.12、23.51、23.94、23.89(P<0.05)和22.40、24.09、24.07、23.54、23.68、24.05(P<0.05);1×10^6拷贝/μl:24.66、25.27、26.66、27.29、27.78、27.40(P<0.05)和24.92、26.22、26.31、26.59、26.93、26.53(P<0.05);1×10^5拷贝/μl:29.25、30.66、32.72、32.84、33.27、33.39(P<0.05)和29.21、30.10、30.97、30.87、31.72、32.44(P<0.05);1×10^4拷贝/μl:31.05、30.50、32.99、33.21、33.59、33.41(P<0.05)和31.22、31.28、31.49、31.52、32.37、32.31(P<0.05)。结论 相对于ddH2O,质粒标准品选择用TE缓冲液作为稀释剂更稳定。质粒标准品随着冻融次数增多,其稳定性越差,因此要避免反复冻融质粒标准品。 雷杰 牛群 王楠 杨瑜 谢贝 刘志辉 孟繁荣关键词:冻融 稀释剂 实时荧光定量PCR 一次性完成结核分枝杆菌鉴定与利福平耐药突变基因检测的新方法 被引量:2 2016年 目的建立一种可同时进行结核分枝杆菌鉴定并检测结核分枝杆菌利福平耐药突变基因的分子方法。方法以"TGTTCTTCAAGGAGAAGCG"、"TCGTCGGCGGTCAGGTA"为上下游引物对101株结核分枝杆菌复合群及52株非结核分枝杆菌临床分离株进行rpo B基因扩增及序列测定,并应用BLAST数据库和DNAMAN软件进行菌种与rpo B基因突变分析。结果在153例分枝杆菌临床分离株中,104例鉴定为结核分枝杆菌复合群,49例被鉴定为非结核分枝杆菌,与16Sr DNA基因序列鉴定方法符合率为96.73%,与传统分枝杆菌菌种鉴定方法符合率为83%;在104例鉴定为结核分枝杆菌复合群菌株中,54例被检测到rpo B基因突变,与比例法检测利福平耐药表型的符合率为96.15%。结论应用本引物进行rpo B基因序列分析可以一次性完成结核分枝杆菌鉴定与利福平耐药突变基因检测工作,有较大的临床应用价值。 孟繁荣 牛群 雷杰 刘炜雯 谭守勇 刘志辉关键词:菌种鉴定 利福平耐药