戴欣
- 作品数:39 被引量:245H指数:8
- 供职机构:中国科学院微生物研究所更多>>
- 发文基金:国家高技术研究发展计划国家自然科学基金中国科学院知识创新工程更多>>
- 相关领域:生物学环境科学与工程农业科学轻工技术与工程更多>>
- 腾冲热海一株栖热菌裂解性噬菌体的分离及其特征被引量:10
- 2010年
- 【目的】Thermus(栖热菌)属是嗜热细菌中比较古老的类群,本研究探索从腾冲热海热泉分离栖热菌噬菌体,并初步分析其特征。【方法】采用"双层平板法"从云南腾冲热海碱性热泉中分离纯化栖热菌噬菌体;对噬菌体及其宿主进行电镜形态观察,并进行噬菌体基因组限制性酶切片段多态性分析、噬菌体生理特征及蛋白组成分析。【结果】从腾冲热海热泉分离获得1株裂解性噬菌体,其宿主菌TC10通过16S rRNA基因序列分析鉴定为Thermus属菌株。此噬菌体为长尾型,头部直径67nm,尾管长837nm、宽10nm,最适感染温度为65℃-70℃,最适感染pH值为7.6,对氯仿不敏感,其形态与分离自俄罗斯勘察加半岛热泉的栖热菌噬菌体P23-45和P74-26有一定的差异,蛋白组成差异显著,为一株新的栖热菌噬菌体,命名为TTSP10(Tengchong Thermus Siphoviridae Bacteriophage)。
- 洪伟韩剑戴欣季秀玲魏云林林连兵
- 关键词:栖热菌THERMUSSIPHOVIRIDAE
- 青藏高原食草动物粪栖真菌的多样性被引量:6
- 2014年
- 分别利用真菌通用引物和厌氧真菌特异引物构建了西藏地区3种反刍动物和1种单胃动物共8份新鲜粪样的ITS克隆文库,以通过系统发育分析解析其中好氧真菌与厌氧真菌的多样性。通用引物ITS文库测得324条真菌序列,分别属于子囊菌门Ascomycota 3个目、担子菌门Basidiomycota 2个目、接合菌门Zygomycota的1个目和严格厌氧的新丽鞭毛菌门Neocallimastigomycota,共24个OTUs。其中,子囊菌门相对丰度最高,占80.6%;新丽鞭毛菌门相对丰度最低,仅占0.6%。大部分OTUs与已知真菌属、种关系较远。厌氧真菌特异引物文库测得661条序列,全部属于新丽鞭毛菌门,包括所有已知的厌氧霉属Anaeromyces、盲肠菌属Caecomyces、肠霉属Cyllamyces、新丽鞭毛属Neocallimastix、奥式霉属Orpinomyces、胃梨囊霉属Piromyces 6个属和3个未培养的属级类群(NG9、NG10、NG11),共29个OTUs。其中3个已知的单中心属存在于所有反刍动物样品中,并以Piromyces相对丰度最高(37.4%)。单胃动物马粪样中全部为NG9类群。NG9是本研究新发现的属级类群,研究中同时揭示有多个未培养种和潜在的新种。研究结果证明青藏高原反刍动物粪栖真菌多样性较高,并存在丰富的未培养种和潜在的新属及新种。
- 杨顼戴欣刘力王雪薇
- 关键词:真菌反刍动物单胃动物青藏高原
- 一种深海来源的马拉硫磷降解菌株及其应用
- 本发明公开了一种深海来源的马拉硫磷降解菌株及其应用。该菌株为霍米海角假海源菌(Pseudidiomarina homiensis)R2058‑FG2‑ML,其保藏号为CGMCC No.23946。该菌株可用于降解有机磷农...
- 董志扬马羚王丽戴欣
- 文献传递
- 瘤胃木质纤维素降解菌及降解酶基因的研究进展被引量:9
- 2010年
- 反刍动物瘤胃是公认的木质纤维素高效降解的天然反应器,对瘤胃微生物的研究已成为开发生物能源的热点领域之一。目前的研究手段已经从传统的依赖分离培养从瘤胃中获得木质纤维素降解菌,并对降解菌中的木质纤维素降解酶逐一分析,发展到通过基因组/元基因组学技术,直接从瘤胃中发现并获得大量新的木质纤维素降解酶基因/基因簇,进而探讨其降解的分子机理。已有的研究结果表明,瘤胃微生物降解木质纤维素的过程非常复杂,涉及大量不同种类的微生物及基因/基因簇,随着新分析技术的建立和完善,对这些微生物和基因的研究已取得了诸多进展。本论文综述了近期有关该方向的研究进展。
- 陈富荣朱雅新东秀珠刘丽华黄力戴欣
- 关键词:瘤胃
- 微生物单细胞基因组技术及其在环境微生物研究中的应用被引量:5
- 2016年
- 单细胞及单细胞基因组学研究是近年生命科学研究的热点之一,微生物单细胞基因组学研究是继微生物元基因组学(又称宏基因组学,Metagenomics)之后新发展起来的,可有效获取环境中大量无法培养的微生物遗传信息的技术。微生物单细胞基因组技术包括单细胞获取、全基因组扩增、全基因组测序以及数据分析等步骤,目前该技术在环境微生物研究中的应用主要集中于探索未被元基因组技术或其它常规技术探测到的新型功能基因,或是对环境中物种丰度极小的未培养微生物的发现,以及对微生物细胞生命进化过程的研究等。本文对微生物单细胞基因组技术中单细胞获取和全基因组扩增所涉及到的不同方法以及应用此技术对环境微生物取得的主要研究进展进行综述。
- 王铱徐鹏戴欣
- 关键词:微生物基因组多重置换扩增
- 微生物降解硝基芳烃化合物的物种多样性及其代谢途径
- 硝基取代芳烃是一类重要的化工产品和原材料,被广泛应用于制药、染料合成、除草剂和杀虫剂生产、橡胶加工等行业。我国年生产能力大于20万吨。多数硝基取代芳烃对人和动植物具有毒害作用,例如,氯代硝基苯抑制作物生长和引起人类肝脏、...
- 刘兴宇吴建峰戴欣王保军姜成英赵可新刘双江
- 关键词:硝基芳烃微生物降解DGGE
- 文献传递
- 云南腾冲热泉极端嗜酸热硫化叶菌多样性研究被引量:5
- 2010年
- 硫化叶菌(Sulfolobus)是极端嗜热古菌遗传机制研究的重要模式菌株,广泛分布于酸性热泉中.对分离自云南腾冲酸性热泉的11株极端嗜酸热菌株进行16S rRNA基因序列测定,并通过菌体形态观察、16S rRNA基因可变区序列比较、菌株16S rRNA基因相似性比较及系统发育分析,研究腾冲热泉硫化叶菌的多样性.结果表明,分离自腾冲热泉的11株硫化叶菌的16S rRNA基因序列与分离自世界上其它地区的8个硫化叶菌的标准菌株的相似性为85.8%~94.9%,与同样分离自腾冲热泉的S.tengchongensis标准菌株的相似性为96.6%~97.5%,在分类学上具有形成新种的可能.在16S rRNA基因高可变区序列上,与分离自世界上其它地区的8个硫化叶菌的标准菌株存在明显的差异.系统发育分析表明,分离自腾冲热泉的硫化叶菌在系统发育树上形成两个亲缘关系较为紧密的簇群,可见腾冲热泉硫化叶菌不仅具有一定的多样性,同时具有较明显的地域性特征.
- 韩剑陈波戴欣洪伟季秀玲魏云林林连兵
- 关键词:硫化叶菌系统进化分析多样性
- 云南洱源牛街热泉原核微生物多样性分析被引量:6
- 2010年
- 【目的】通过分析富含高分子有机物的云南洱源牛街热泉原核微生物16SrRNA基因克隆文库,丰富对高温热泉原核微生物多样性的认识,为进一步开发和利用该热泉微生物资源奠定基础。【方法】构建洱源牛街高温热泉原核微生物16SrRNA基因克隆文库,通过测序和序列相似性比对以及聚类分析研究该热泉原核微生物的多样性。【结果】该热泉原核微生物以细菌为主,包括变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)等在内的约10个细菌类群,其中变形菌门中的β-变形菌纲(β-Proteobacteria)为优势菌群,其次为拟杆菌门(Bacteroidetes)、绿菌门(Chlorobi);古菌的生物量和丰度较细菌少,分属广古菌(Euryarchaeota)和泉古菌(Crenarchaeota)两个类群,以广古菌为优势类群。
- 孙盼顾淳任菲戴欣董志扬
- 关键词:RRNA基因热泉
- 近海养虾场底泥中产芽孢细菌的生态特征被引量:16
- 2004年
- 通过对近海养虾场底泥中的细菌数量和类群的调查 ,发现有超过 5 0 %的细菌生物量是产芽孢细菌 ,因此对底泥中的产芽孢细菌进行了分离和纯化 ,通过对细胞形态、生理生化等特征的研究和对部分菌株的 16SrRNA基因的ARDRA分型、序列分析等 ,鉴定了 6 7株产芽孢细菌 ,其中 6 2株属于芽孢杆菌属 ,5株属于短芽孢杆菌属 .进一步对 6 2株芽孢杆菌属的细菌在底泥不同深度的分布进行研究 ,结果表明 ,巨大芽孢杆菌主要分布在底泥深度 0~ 6cm左右的区域 ,海洋芽孢杆菌、短小芽孢杆菌和蜡状芽孢杆菌主要分布于底泥 6cm以下的区域 ,与坚强芽孢杆菌性状相近的菌分布在底泥 2~ 8cm深度 ;与耐碱芽孢杆菌性状相近的芽孢菌广泛分布在 0~ 12cm区域 .讨论认为 ,应用这些产芽孢细菌资源在修复海洋环境和开发海水养殖微生态制剂方面具有一定可能性 .图 3表 3参
- 王亚南王保军戴欣焦念志彭志英刘双江
- 关键词:芽孢杆菌生态特征
- 一株深海细菌新菌株及其应用
- 本发明公开了一株深海细菌新菌株及其应用。本发明所公开的深海细菌新菌株是锰氧化黄氏菌(Huangia manganoxydans)8047CGMCC No.6697。锰氧化黄氏菌(Huangiamanganoxydans)...
- 黄力戴欣张山宋磊郗丽君任菲黄英董志扬
- 文献传递