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我国生物试剂产业发展战略思考: 2008年; 现代生物技术已经成为一个新的经济增长点，其增长速度大致在25％～30％，是整个经济增长平均数的8～10倍，成为21世纪的主流经济——生物经济。在发达国家一个显著的特点就是：这些国家的生物科技支撑产业技术很发达并形成强大的规模产业。生物支撑技术产业应包括生物试剂、生物仪器、生物软件、模式实验动物及生物人才五个方面。下面主要就生物支撑技术产业之一——生物试剂作一论述。; 陈禹保张传山张旭晨姚乌兰; 关键词：经济增长点现代生物技术生物经济

禽流感病毒H5N1血凝素基因和神经氨酸酶基因在真核酵母菌中的表达被引量：2: 2011年; 目的克隆、表达和鉴定禽流感病毒H5N1血凝素基因(hemagglutinin,HA)和神经氨酸酶基因(neuramidinase,NA)序列,为制备抗体和基因工程疫苗打下基础。方法在成功克隆禽流感病毒H5N1全长HA、NA基因并测序的基础上,将部分基因序列克隆到表达载体pMET A上,构建了重组表达质粒pMET A/HA(49～1 587 bp)、pMET A/NA(121～1 200 bp),电转化真核酵母菌pMAD16,甲醇诱导表达,利用Ni2+亲和层析柱对重组蛋白进行纯化,并用Western Blotting和ELISA方法检测其抗原性。结果重组蛋白在酵母菌中可以高效表达,SDS-PAGE显示蛋白表达后形成了二聚体,蛋白纯度占总蛋白的95%以上,ELISA和Western Blotting实验证实,重组蛋白具有良好的抗原性。结论本研究成功克隆和表达了禽流感病毒H5N1 HA、NA基因序列,为禽流感病毒H5N1诊断试剂和疫苗的开发等进一步的研究提供了依据。; 邹淑梅于在江张烨辛丽陈永坤陈禹保陈清轩舒跃龙; 关键词：血凝素神经氨酸酶

基于高通量测序的全基因组关联研究策略被引量：11: 2014年; 全基因组关联研究(Genome-wide association study,GWAS)是人类复杂疾病研究的重要组成部分之一,在群体水平检测全基因组范围的遗传变异与可观测性状间的遗传关联。传统的GWAS是以芯片(Array)技术获得高密度的遗传变异,尽管硕果累累,但也存在不少问题。如:所谓的"缺失的遗传力",即利用关联分析检测达到全基因组水平显著的遗传变异位点只能解释小部分遗传力;在某些性状上不同研究的结果一致性较弱;显著关联的遗传变异位点的功能较难解释等。高通量测序技术,也称第二代测序(Next-generation sequencing,NGS)技术,可以快速、准确地产出高通量的变异位点数据,为解决以上问题提供了可行的方案。基于NGS技术的GWAS方法(NGS-GWAS)可在一定程度上弥补传统GWAS的不足。文章对NGS-GWAS策略和方法进行了系统性调研,提出了目前较为可行的NGS-GWAS的实施策略和方法,并对NGS-GWAS如何应用于个体化医疗(Personalized medicine,PM)进行了展望。; 周家蓬裴智勇陈禹保陈润生; 关键词：全基因组关联研究个体化医疗

基于高通量测序的2型糖尿病易感基因靶向测序panel设计及临床应用: 2019年; 目的利用高通量测序(NGS)和多重PCR技术设计基于扩增子的靶向测序panel,对T2DM易感基因进行测序,并评估其与T2DM患者临床特征的关系。方法通过Illumina测序平台,设计多重PCR扩增的靶向测序panel,对16个T2DM易感基因21个SNP位点进行测序。收集1043份确诊T2DM患者的外周血DNA样本进行检测。结果 PCR扩增子在不同样本之间的测序深度具有良好的可重复性,且不同扩增子测序数据分布具有高度一致性,除rs864745和rs712523外,测序深度达到1000×以上。18个SNP位点差异均有统计学意义(P<0. 05)。结论通过NGS技术,利用基于扩增子的靶向测序panel进行T2DM易感基因检测的可行性和实用性,验证了KCNQ1、CDKAL1、CDKN2B是T2DM发病的风险基因。; 李春瑞邢玉华裴智勇刘满姣陈禹保; 关键词：易感基因全基因组关联研究

miRDOA:集数据存储与在线分析于一体的综合型microRNA数据库: 2014年; miRNA(microRNA)是一类小的非编码RNA,普遍存在于动物、植物等多个物种中,研究表明在原生生物以及病毒中也有miRNA。miRNA在生物的成长、发育、细胞凋亡、神经紊乱、癌症等多个方面都起到至关重要的作用,miRNA还可作为Biomarker应用于癌症等疾病的诊断和治疗。miRDOA(miRNA Database and Online Analysis)数据库存储了二百多个物种的miRNA相关信息,提供了基本的浏览和搜索功能。用户可以通过物种来浏览miRNA相关数据,也可以通过miRNA、靶基因或者序列进行检索。除此之外,miRDOA还提供了在线分析模块,主要对高通量测序数据进行初步分析,在此基础上,添加了靶基因预测、表达谱数据差异分析,以及在线BLAST功能。miRDOA是一个完全免费的开源的数据库网站,并实时更新。; 李俊娥贾利鹃闫鹏程闫学青谢国云陈禹保

微生物组测序与分析专家共识被引量：4: 2020年; 在过去的十几年,微生物组相关研究和应用持续升温。微生物组逐渐成为生命科学、环境科学和医学等领域的研究焦点。与此同时,全球多个国家和组织也都积极发起各自的微生物组计划,进行多方面的布局,力争在这一具有广阔前景的领域获得战略地位。此外,无论是科研还是产业应用已经迎来了研究高潮和投融资热潮,微生物组相关产品和服务也不断出现。然而,行业在快速发展的同时,也存在一些不足。由于微生物组测序和分析相关技术和方法发展迅速,各国研究和应用尚未在技术、方案和数据等标准上达成统一,国内行业参与者对微生物组也存在认识不足,对微生物组相关新方法、新技术、新理论等还未能充分掌握和使用。除此之外,已有的一些标准和指南,内容过于简单,实操性也不足,这不仅给科研数据的整合造成了困难和资源浪费,还给相关企业进行不良竞争、以次充好提供了机会。更重要的是,我国尚缺乏微生物组相关的国家标准,国家微生物组计划仍处于筹备过程。在此背景下,中国生物工程学会、中国科学院微生物研究所于2019年6月至2020年3月,共同设立了“微生物组测序与分析专家共识”专项研究课题。中国生物工程学会组织了微生物组相关领域的27位专家以及来自行业内的30多位专业人员,通过分成4个项目小组、召开4轮研讨会后,最终形成了涵盖从微生物采集与保存、DNA提取与建库、高通量基因测序和数据分析以及质控标准品等全流程的“微生物组测序与分析专家共识”。本专家共识具有较强可参考性和可操作性,不仅能指导国内科研和产业机构规范进行微生物组相关产、学、研,还能为国家相关职能部门提供可参考的技术依据,保障规模型和规范化的企业利益,加强行业自律,避免不规范的企业扰乱市场,最终促进微生物组相关产业的良; 段云峰王升跃陈禹保杨瑞馥李后开朱怀球童贻刚杜文斌付钰胡松年王军辛玉华赵方庆鲍一明张雯李娟曾明牛海涛周欣李岩崔生辉袁静李俊桦王加义刘东来倪铭孙青邓晔朱宝利

Sanger测序反应优化剂及其制备方法和用途: 本发明公开了一种Sanger测序反应优化剂，该优化剂包括甜菜碱(Betaine)、二硫苏糖醇(DTT)、DMSO和BSA；其配比为：2.7～5mol/L Betaine、3～10mmol/LDTT、3％～8％DMSO、3...; 陈禹保黄捷勤; 文献传递

丙肝病毒RNA磁分离PCR检测被引量：1: 1995年; 丙肝病毒ＲＮＡ磁分离ＰＣＲ检测陈明哲，陈禹保（中国科学院北京科海医疗生物工程公司．１０００８０）丙肝病毒（ＨＣＶ）是输血后引起非甲非乙肝炎的主要病因。目前尽管已有ＨＣＶ病体检测试剂盒，但尚无ＨＣＶ抗原检测试剂盒。抗ＨＣＶ抗体的检测不能确诊ＩＩＣＶ的真...; 陈明哲陈禹保; 关键词：丙型肝炎病毒磁分离聚合酶链反应

用复合PCR检测淋球菌、沙眼衣原体和解脲支原体的感染研究被引量：4: 2000年; 在性传播疾病中,泌尿生殖道感染的主要病原体是淋球菌、沙眼衣原体和解脲支原体,目前临床上常有多种病原体混合感染[1],其临床症状相似或无明显症状,给确诊和治疗带来不便。因此我们应用多重引物ＰＣＲ(ｍｕｌｔｉｐｌｅｘＰＣＲ),一次实验能从临床标本中检测出三种病原体...; 陆应玉李京培陈禹保; 关键词：淋球菌沙眼衣原体解脲支原体复合PCR

乙型肝炎核心抗原酶联免疫定量测定HBV-DNA试剂盒: 本发明公开了一种乙型肝炎核心抗原酶联免疫定量测定HBV-DNA试剂盒及其制备方法，属于分子生物学与免疫学诊断试剂领域。该试剂盒包括：(1)荧光定量HBV-DNA血清标准品6支，(2)HBV表面抗体(HBsAb)多抗预包被...; 陈禹保; 文献传递

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陈禹保

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