郭旸 作品数:7 被引量:37 H指数:4 供职机构: 张家港出入境检验检疫局 更多>> 相关领域: 医药卫生 轻工技术与工程 农业科学 生物学 更多>>
空肠弯曲菌中规律成簇间隔短回文重复序列(CRISPR)的检测与结构分析 被引量:2 2018年 规律成簇间隔短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)是近年在原核生物中发现的针对噬菌体等外源遗传物质的干扰而进化出的获得性和可遗传性生物免疫系统。因其序列的高度多态性及携带遗传信息的可追溯性,成为分子分型方法的理想位点。本研究对江苏地区分离的86株空肠弯曲菌基因组进行CRISPR结构的检测和分析。结果表明:36%的菌株基因组含有CRISPR结构,32株含有确定CRISPR结构的菌株均只含有1个CRISPR结构,CRISPR序列长度范围为92~366 bp;重复序列与数据库中出现频率最高的重复序列一致;识别到的间隔序列共111条,共分为17种类型,有10种类型的间隔序列与CRISPR DB数据库中公布的一致,有7种间隔序列为新报道的间隔序列,共55条,占总间隔序列的49.5%。通过同源性比对发现,间隔序列除与来自同属同种的质粒或噬菌体具有同源性外,有些还与其他致病菌的质粒或噬菌体具有同源性,这种现象说明空肠弯曲菌与其他致病菌可能存在基因的水平转移等信息交流方式。另外,通过CRISPR结构间隔序列的多样性,可以将38株空肠弯曲菌野生菌株分为5种不同的谱型。研究结果为空肠弯曲菌利用CRISPR结构进行分型和溯源提供数据基础。 吴瑜凡 申进玲 崔思宇 郭旸 吴福平 王翔 邵景东关键词:空肠弯曲菌 同源性 2012年张家港口岸进境冷冻猪肉制品中单核细胞增生李斯特氏菌污染调查 被引量:4 2014年 目的了解进境冷冻猪肉制品单增李斯特菌污染状况,建立流行病学监测网,以便制定良好的预防控制措施,更有效地预防和控制由该菌引起的食源性疾病和疫情的发生。方法 mini VIDAS快速筛选、显色平板分离、API Listeria鉴定结合国标法进行单增李斯特菌检测。结果 2012年共检测冷冻猪肉制品171批,检出单增李斯特菌14株,阳性率为8.19%(14/171)。结论单增李斯特菌污染较为严重,应加强对冷藏生畜、肉类食品的卫生管理。 吴福平 王毅谦 郭旸 邵景东关键词:冷冻猪肉 单核细胞增生李斯特氏菌 污染 139株空肠弯曲菌耐药性分析 被引量:10 2019年 空肠弯曲菌(Campylobacter jejuni)是最常见的食源性病原菌之一。本研究采用微量肉汤稀释法对分离得到的139株空肠弯曲菌(117株为禽源样本分离株,22株为人源样本分离株)进行耐药性检测。通过对最小抑菌浓度(MIC)的判定结果得出:120株(86. 33%)空肠弯曲菌分离株对6类9组临床常用的抗生素表现出不同程度的耐药,其中禽源空肠弯曲菌耐药率为83. 76%,22株人源空肠弯曲菌均表现出耐药性。对喹诺酮类抗生素表现出高度耐药(环丙沙星80. 58%,萘啶酸77. 70%);对四环素类表现为中等耐药(四环素53. 24%);对部分大环内酯类、氨基糖苷类、林可酰胺类表现为低耐药(庆大霉素7. 19%,阿奇霉素5. 76%,克林霉素6. 47%);对酰胺醇类、部分大环内酯类表现为敏感(氟苯尼考0%,红霉素0%、泰利霉素0%)。139株空肠弯曲菌共产生14种耐药谱型,以TET-CIP-NAL谱型最多,占比38. 13%,耐三重及以上抗生素的多重耐药菌株占比53. 24%。禽源菌株中多重耐药占比46. 15%,人源菌株中多重耐药占比90. 91%。研究结果显示空肠弯曲菌耐药现状不容乐观,尤其对喹诺酮类与四环素类抗生素耐药性较为突出,且过半数菌株为多重耐药。本研究为食源性空肠弯曲菌的防控及临床用药提供参考。 崔思宇 吴瑜凡 吴福平 郭旸 邵景东关键词:空肠弯曲菌 耐药性 多重耐药 Allglo探针与Taqman探针双重荧光RT-PCR法检测GI型和GII型诺如病毒的比较和应用 被引量:4 2013年 目的对Allglo探针和Taqman探针检测GI型和GII型诺如病毒的双重荧光RT-PCR方法进行比较,并应用于临床标本的检测。方法设计针对GI型和GII型诺如病毒的Allglo探针和Taqman探针,优化最佳反应条件,建立一步法荧光RT-PCR快速检测反应体系。对这两种方法的特异性、灵敏度进行比较评估,对56份临床粪便标本进行检测,并统计结果。结果这两种方法特异性强;最低检测限均为102copies/μL以下;但是Allglo探针在同一浓度下比Taqman探针CT值更低,扩增效率更高。对56份临床粪便标本进行检测,两种方法结果一致。结论 Allglo探针双重荧光RT-PCR方法较之Taqman探针检测GI型和GII型诺如病毒扩增效率更高,两者均可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速筛查。 王毅谦 郭旸 吴福平 李辉 邵景东关键词:TAQMAN探针 压电免疫传感技术快速筛检花生中过敏原 被引量:1 2014年 目的:采用压电免疫传感技术快速筛检花生过敏原。方法对花生主要过敏蛋白进行分离纯化,免疫新西兰大白兔获得花生抗体,对其的效价,半数抑制浓度等值进行测定。运用自组装的压电免疫传感器包被花生抗体,制作标准曲线,确定灵敏度,回收率及重现性。结果分离纯化花生过敏原蛋白纯度为90.7%,最适的花生包被抗原浓度为0.1μg/mL,自组装的压电传感器检测花生过敏原浓度在1~316μg/mL范围内具有较好的线性关系,灵敏度为0.1μg/mL,回收率介于92.3%~113.4%之间,重现性变异系数为6.04%。结论本项目建立的压电免疫传感技术检测花生过敏原与目前较多的光学分析相比灵敏度更高,实现了快速、在线检测,成本低,仪器简单,具有广阔的应用空间。 王毅谦 许琼 郭旸 沈伟健 吴福平 邵景东关键词:压电免疫传感器 花生过敏原 胶体金 GⅠ和GⅡ型诺如病毒双重荧光RT-PCR法检测 被引量:10 2013年 目的建立应用Allglo探针同时检测GⅠ和GⅡ型诺如病毒的双重荧光反转录-聚合酶链反应(RT-PCR)方法。方法设计针对GⅠ和GⅡ型诺如病毒开放阅读框架ORF1及ORF2为目的基因的引物和Allglo探针,优化最佳反应条件,建立一步法荧光RT-PCR快速检测反应体系;对该方法的特异性、抗干扰性、灵敏度进行评估,对96份临床粪便标本进行检测、测序分析。结果该方法特异性强,与轮状病毒、扎如病毒、星状病毒、腺病毒同时检测无交叉反应;同一体系下GⅠ或GⅡ型诺如病毒相互之间没有干扰;最低检测限均为10 copies/μL;对96份临床粪便标本进行检测,结果与单重荧光RT-PCR方法符合率100%,且测序结果显示目标序列正确。结论本研究建立的Allglo探针法检测GⅠ和GⅡ型诺如病毒技术特异性好,灵敏度高,可用于感染性腹泻暴发中诺如病毒的快速筛查。 王毅谦 石晶 吴福平 郭旸 李辉 邵景东关键词:诺如病毒 动物性食品中莱克多巴胺检测方法研究进展 被引量:6 2013年 莱克多巴胺作为激素类添加剂,对动物机体产生副作用,同时影响消费者的健康。近年我国进出境口岸屡次在进口动物性食品中检出莱克多巴胺。本文对近几年来动物性食品中莱克多巴胺的检测方法新进展和新兴技术做了大量调查和整理,旨在为出入境口岸动物性食品中莱克多巴胺的检测提供一定的参考,为进出口动物性食品的安全控制提供理论依据。 石晶 王毅谦 吴福平 郭旸关键词:动物性食品 莱克多巴胺