闫梅英 作品数:93 被引量:472 H指数:13 供职机构: 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所 更多>> 发文基金: 国家科技重大专项 国家重点基础研究发展计划 中美新发和再发传染病合作项目 更多>> 相关领域: 医药卫生 农业科学 生物学 更多>>
利用实时荧光定量聚合酶链式反应快速检测人及动物粪便中的沙门菌 被引量:3 2020年 目的为了快速检测、鉴定沙门菌属细菌,提高食源性疾病暴发应对能力,本研究建立了针对沙门菌属的实时荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)检测方法,并对其特异性、敏感性和检测下限进行评价。方法筛选针对沙门菌的属特异基因,并建立该基因的qPCR检测体系,利用肠道不同种属细菌、不同亚种及血清型沙门菌属细菌、动物及人粪便样本评价该体系的特异度、灵敏度及检测下限。结果获得沙门菌的属特异基因ttrA,建立基于该基因的qPCR检测方法。发现该方法对纯DNA的最低检测下限为2拷贝/反应。对沙门菌属以外的肠道致病菌无扩增,对1 100株不同亚种及血清型的沙门菌的扩增结果均为阳性,对150份沙门菌致腹泻患者的粪便增菌液和210份动物带菌粪便增菌液均检测阳性。结论本研究建立的基于单一基因的沙门菌属快速分子检测方法具有特异度高、灵敏度高的特点,可用于快速筛查、鉴定沙门菌及由其引起的感染性腹泻。 陈丹妮 韩营营 李杰 闫梅英关键词:沙门菌属 分子检测 广州市2004年某野生动物市场动物携带SARS-CoV监测 被引量:8 2005年 目的 了解广州市某野生动物市场动物携带严重急性呼吸综合征冠状病毒 (SARS CoV)的动态变化 ,预测 2 0 0 4 - 2 0 0 5年冬季当地发生动物源性SARS的危险性。方法 在SARS发病相关月份采集广州市某野生动物市场动物的肛拭子和咽拭子标本 ,使用实时荧光聚合酶链反应 (PCR)初筛 ,使用RT PCR和序列分析方法核实。结果 在 2 0 0 4年 1月 5日广东省开始清除野生动物行动前采集的 31只动物 (5只赤狐、2 0只猫、6只黄毛鼠 )中 ,有 8只动物SARS CoV检测阳性 (2 5 .8% ) ,包括 3只赤狐、4只猫、1只黄毛鼠。在 2 0 0 4年 1月 2 0日采集的 119只动物 (6只兔、13只猫、4 6只原鸡、13只斑嘴鸭、10只灰雁、31只鹧鸪 )中 ,仅 1只灰雁的肛拭子检测阳性。 2 - 11月份采集的 10 2只动物 (14只灰雁、3只猫、5只兔、9只斑嘴鸭、2只鹧鸪、8只雉鸡、6只鸽、9只黄麂、19只山猪、16只黄毛鼠、5只犬、1只水貂、3只山羊、2只绿孔雀 )中 ,仅 4月份采集的 1只山猪的肛拭子标本阳性。 11- 12月份在广东省采集的 2 2只果子狸标本均为阴性。结论 和SARS流行或出现散发病例 2 0 0 3年 5月、2 0 0 4年 1月5日某野生动物市场动物的SARS CoV的RT PCR检测情况相比 ,2 0 0 4年 1月 2 0日至 12月广州市某野生动物市场的动物携带SARS CoV的比? 王鸣 景怀琦 徐慧芳 蒋秀高 阚飙 刘起勇 万康林 崔步云 郑翰 崔志刚 闫梅英 梁未丽 王洪霞 齐小保 李振军 李马超 陈凯 张恩民 张守印 海荣 俞东征 徐建国关键词:SARS-COV 阳性 阴性 黄毛鼠 赤狐 肥达试验及Tubex法在伤寒、甲型副伤寒诊断中的应用评估 被引量:1 2016年 目的评估肥达试验、Tubex法在伤寒、甲型副伤寒诊断中的应用价值。方法采集广西、新疆、云南等地区伤寒及甲型副伤寒暴发疫情中的确诊病例血清,运用肥达试验及Tubex-TF、Tubex-PA进行伤寒及甲型副伤寒血清抗体检测,分别计算这3种血清学检测结果的灵敏度、特异度、假阳性率、假阴性率、约登指数和Kappa值等指标,对诊断结果进行评估。结果以血培养为金标准,对23例血培养阳性的伤寒血清进行检测,Tubex-TF方法的灵敏度为82.61%,特异度为61.64%,阳性预测值为0.404,阴性预测值为0.918;Tubex-PA对伤寒病例的非特异性阳性检出率为91.30%。71例血培养阳性的甲型副伤寒检测结果显示,Tubex-PA方法的灵敏度为74.65%,特异度为16.00%,阳性预测值为0.716,阴性预测值为0.182;Tubex-TF对甲型副伤寒病例的非特异性检测阳性率为39.44%。Tubex-TF/PA联合对伤寒及甲型副伤寒病例的总检出率为80.21%。在不同病程中,血培养阳性的伤寒及甲型副伤寒病例血清进行肥达试验,阳性率均低于6.00%,明显低于Tubex法的检出率(χ^2=75.165,P=0.000)。结论疾病暴发流行时,除了肥达试验,Tubex-TF方法可用以辅助诊断伤寒,有利于该疾病早期发现、诊断及治疗,而对于甲型副伤寒的辅助诊断仍有待进一步研究。 曹阳 闫梅英关键词:伤寒 副伤寒 血清学实验 新型冠状病毒血清学抗体检测试剂盒现状分析 被引量:3 2021年 血清特异性抗体检测是诊断新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染的重要工具。然而在短时间内大量SARS-CoV-2血清学抗体检测试剂盒紧急上市,其准确性和有效性存在很大不确定性。本研究对国内外SARS-CoV-2血清学抗体检测试剂盒现状做简要综述,为医院和疾控人员的使用提供参考。 罗雪莲 闫梅英 吴媛 戴琰 程雁鹏 徐建国关键词:新型冠状病毒 血清学诊断 抗体检测 试剂盒 云南省伤寒副伤寒空间分布特征及其气候影响因素研究 被引量:19 2011年 目的分析云南省2001--2007年伤寒副伤寒发病的空间分布特征以及气象因素与伤寒副伤寒流行的关联性。方法收集2001--2007年云南省以县为单位的伤寒副伤寒发病数据,应用空间聚类、面板数据模型等方法分析伤寒副伤寒的分布特征,以及伤寒副伤寒流行与气温、降水、相对湿度等气象因素的关系。结果2001--2007年云南省伤寒副伤寒的年均发病率为23.11/10万,病例主要分布于夏秋季。空间聚类分析发现两个伤寒副伤寒的高发聚集区:玉溪地区(7年平均发病率207.45/10万)及该省与缅甸、老挝交界地区。多因素面板数据分析显示,云南省伤寒副伤寒发病增加与气温升高、降水量增多和湿度增加等气候因素相关:月平均气温升高10℃,IRR=1.30(95%Ch1.24~1.36);湿度增加10%,IRR=1.07(95%CI:1.05~1.09);月降水量增多100mm,IRR=1.02(95%CI:1.00—1.03);前1个月的气温升高10℃,IRR=1.73(95%CI:1.64~1.82);P〈0.05。结论云南省伤寒副伤寒发病存在聚集区,相对湿度等气候因素在流行中发挥了一定的作用。 王鲁茜 闫梅英 方立群 伏晓庆 王多春 孙军玲 曹务春 张静 阚飙关键词:伤寒副伤寒 面板数据分析 气象因素 基于基因组序列的3种沙门菌分子血清分型方法比较研究 被引量:9 2021年 目的比较3种沙门菌分子血清分型方法,获得一种准确度较高的方法用来替代传统的血清凝集技术用于沙门菌血清型判定。方法对覆盖50个血清型的509株沙门菌提取核酸进行全基因组测序,根据全基因组序列分别利用多位点序列分型(MLST)、SalmonSeroPredicition以及SISTR(Salmonella in silico typing resource)3种方法在线预测获得每株菌的血清型,然后与传统血清凝集获得的血清型进行一致性比较分析,评估每种方法血清型预测的准确度。结果SISTR、MLST以及SalmonSeroPredicition预测血清型的准确率分别为96.67%、93.52%、69.16%。常见沙门菌血清型印第安纳沙门菌和鼠伤寒沙门菌血清型预测正确率最高,为100%,德尔卑沙门菌、肠炎沙门菌血清型预测正确率分别为99.17%、95.74%。3种方法均预测错误的血清型有肠炎沙门菌、德尔卑沙门菌和沙门菌的萨拉姆亚种、亚利桑那亚种和双相亚利桑那亚种等;预测错误原因主要是基因序列丢失和鞭毛抗原基因未表达。结论基于基因组序列的SISTR血清型预测方法具有较高的血清型预测准确度,在传统血清凝集难以开展或沙门菌鞭毛基因不表达的情况下,可以替代血清凝集试验进行沙门菌血清型判定。 陈丹妮 韩营营 李杰 李臻鹏 闫梅英关键词:沙门菌 多位点序列分型 广西壮族自治区玉林市健康人携带单相鼠伤寒沙门菌耐药及分子遗传特征研究 被引量:3 2023年 目的了解广西壮族自治区玉林市健康人携带的单相鼠伤寒沙门菌的耐药情况及菌株间的同源性。方法对2021—2022年分离自健康饮食从业人群的147株单相鼠伤寒沙门菌进行血清学鉴定,采用微量肉汤稀释法进行16种药物的敏感性试验,应用脉冲场凝胶电泳(PFGE)进行分子分型及聚类分析,同时进行全基因组测序及多位点序列分型分析。结果单相鼠伤寒沙门菌普遍耐药,耐药菌株占98.64%,对链霉素的耐药率最高(96.60%),其次为氨苄西林和四环素(均为91.16%)。多重耐药率高达85.71%,主要耐药谱为氨苄西林–链霉素–四环素三重耐药。147株菌分为132种PFGE带型,研究发现成簇菌株存在,但菌株基因组遗传差异较大。核心基因组进化树分析提示存在3起聚集。多位点序列分型显示,序列型ST34占绝对优势(96.60%)。结论玉林市健康人携带单相鼠伤寒沙门菌耐药严重,菌株具有明显的遗传多样性,存在潜在暴发风险,提示应加强重点人群健康监测及暴露危险因素的调查,降低该耐药新血清型沙门菌扩散风险。 罗铭 王鲁彦 周昶宇 侯心娇 凌誌穗 温渝健 莫宗鑫 夏樱花 吴炎农 闫梅英关键词:健康人 耐药 分子遗传 云贵高原地区甲型副伤寒沙门菌优势克隆群的研究 2018年 目的分析2005-2012年我国云贵高原(广西壮族自治区、贵州省、云南省)临床甲型副伤寒沙门菌分离株分子分型和群体结构。方法收集2005-2012年我国三个伤寒副伤寒高发省份分离自临床的甲型副伤寒沙门菌分离株145株。采用两种酶切(XbaI和SpeI)进行脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electrophoresis,PFGE)分型分析。分析描述我国云贵高原近8年来的甲型副伤寒沙门菌优势克隆群及克隆群变迁。结果 145株甲型副伤寒沙门菌采用XbaI酶切可以得到38个PFGE型;采用SpeI酶切可以得到42个PFGE型;利用两种酶切结果联合分析,可以得到71个型别,其中2个型别所含菌数均超过10株。结论有些型别仅分布于某个省份某一年份,有些型别却可以在某一省份长期存在并逐年传播,成为优势型别。不同省份间优势型别有所不同,呈现一定的地域差异。 李臻鹏 杜小莉 刁保卫 闫梅英 阚飙 徐嘉良 卢昕关键词:甲型副伤寒沙门菌 云贵高原 脉冲场凝胶电泳 分子分型 泛病原体生物芯片技术快速检测不明原因腹泻患者病原体 被引量:3 2014年 泛微生物基因芯片能够同时检测多种病原体,具有全面、快速、无偏向性等优点,目前国际上已有Virochip[1]、Greenechip[2]、MDA[3]等泛病原体芯片,国内也开发了EOPM(Easy Operating Pathogen Microarray)芯片[4],本研究利用EOPM基因芯片检测不明病原体感染的成年人腹泻样本. 张学慧 李杰 高翔 靳淼 阚飙 张鑫磊 张华 张亮 闫梅英关键词:轮状病毒 酶促重组酶扩增-侧流层析快速检测沙门菌的方法研究 2023年 目的建立一种酶促重组酶扩增(ERA)和侧流层析技术(LF)相结合的沙门菌快速检测方法,为沙门菌现场检测提供技术支持。方法根据沙门菌属高度保守的鞭毛基因fimY设计特异性ERA引物,采用毛细管电泳筛选合适的引物,再设计探针,对扩增温度和时间进行优化,建立ERA-LF检测体系对菌株DNA进行扩增,采用侧向流试纸条检测产物。采用鼠伤寒沙门菌标准菌株检验方法的灵敏度,采用10种其他肠道感染标准菌株检验特异度,采用实际分离到的沙门菌验证对实际样本检测能力。结果经过毛细管电泳筛选获得沙门菌特异性引物,在扩增温度为37℃、反应时间为20 min的条件下,最低检测浓度为5 copies/μL。本方法对沙门菌核酸扩增结果为阳性,10株其他肠道感染菌核酸扩增结果均为阴性,特异度较好。对100株(包含10种血清型)沙门菌进行检测,结果均显示阳性。结论本研究建立的ERA-LF方法可用于沙门菌的现场即时检测。 聂艳妮 闫梅英 宋衍燕关键词:沙门菌