刘志国
- 作品数:27 被引量:220H指数:9
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:内蒙古自治区自然科学基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:医药卫生农业科学更多>>
- 布氏菌分离株16SrDNA基因遗传进化分析被引量:4
- 2015年
- 目的检测内蒙古布氏菌临床分离株的16SrDNA基因序列,构建16SrDNA遗传进化树,确定该菌株的分类地位。方法用BCSP31-PCR对临床分离株检测,再进行16SrDNA双向测序;从GeneBank下载标准参考菌株和与布氏菌有共同抗原细菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0进行序列比对并构建遗传进化树。结果 BCSP31-PCR结果显示均有223bp扩增条带,16SrDNA测序得到单一基因序列;比对后发现有4处特异片段,经Blast比对,位于844-1224包括380bp的片段为布氏菌独有;进化树显示布氏菌临床分离株与标准菌株聚在1个末端分支上,遗传距离接近0,无法精细区分相互关系;与人苍白杆菌聚集在1个亚分支上,遗传距离0.019;与其它试验菌株如霍乱弧菌、小肠结肠炎耶尔菌遗传进化距离较远,遗传距离>0.02。结论从遗传进化角度对布氏菌分离株与标准菌株的亲缘关系进行分析,布氏菌所有种型遗传距离接近,提示布氏菌16SrDNA为高度保守序列,不宜做遗传进化分析的靶基因;布氏菌与人苍白杆菌有较近的亲缘关系;布氏菌属16SrDNA特有的380bp的基因片段可作为布氏菌快速鉴定的靶序列。
- 刘志国崔步云王妙刘日宏夏咸柱
- 关键词:布氏菌遗传进化
- 呼和浩特地区分离人源布鲁菌的分子流行病学特征分析被引量:4
- 2017年
- 目的了解呼和浩特地区分离人源布鲁菌的分子流行病学特征,为指导布鲁菌感染防治提供实验依据。方法对2013-2015年内蒙古医科大学附属医院分离的27株人源布鲁菌进行常规细菌学和分子鉴定;采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)-16方法,对其中9株菌进行分子分型及聚类分析;采用PCR方法对16个毒力基因在27株菌株中的分布情况进行检测和分析。结果27株菌常规细菌学方法和PCR方法均鉴定为羊种布鲁菌,其中有6株为羊种1型,21株为羊种3型。MLVA-16分型结果显示,9株菌在部分VNTR位点上存在重复数目差异。聚类分析显示,9株菌呈现7个基因型,提示为零星散发病例:同时有2株菌共享同一基因型,提示存在流行病学关联,可能来自同一感染来源。16个毒力基因在27株菌株中均能检测到。结论呼和浩特地区分离人源布鲁菌主要为羊种1型和3型,毒力基因分布特征相近;部分克隆株存在流行趋势,流行机制值得进一步探究。
- 王艳艳周鹿蕾刘志国韩艳秋崔步云王俊瑞
- 关键词:毒力基因分子分型
- 应用PCR方法快速检测布鲁氏菌核酸的研究进展被引量:7
- 2010年
- 本文主要就近年应用PCR方法快速诊断人畜布鲁氏菌病(布病)的进展情况进行阐述,包括用各种布鲁氏菌基因保守序列设计引物的常规PCR、不同类型检测样本的常规PCR方法对布病的快速诊断的评述;荧光定量PCR的原理、方法;各种荧光定量PCR方法在布病快速诊断中的应用及其未来应用前景的展望。
- 刘志国张利崔步云侯勇跃胡剑飞
- 关键词:聚合酶链式反应布鲁氏菌荧光定量PCR
- 布鲁氏菌基因组学研究进展被引量:3
- 2015年
- 布鲁氏菌是一类革兰氏阴性、胞内寄生菌,缺乏经典的毒力因子,致病性不仅依靠侵袭力和内毒素,还有赖于较强的环境适应能力。目前,布鲁氏菌入侵机体和在胞内持续存在的机制尚未明确。布鲁氏菌基因组学研究不仅可全面了解布鲁氏菌的基因组成、分子进化、毒力因子以及致病机制等特点,还可以对一些致病相关基因和重要的蛋白进行预测。该研究为开发研究疫苗和新型抗生素提供分子基础,从而为构建新的有效的布病治疗和防控策略提供理论依据。本文就布鲁氏菌的基因组组成、特征,全基因组测序分析、比较基因组研究进展予以概述。
- 刘志国王妙崔步云刘日宏夏咸柱
- 关键词:布鲁氏菌基因组比较基因组学进化基因组学
- 湖南省人间布鲁氏菌病流行特征及布鲁氏菌溯源调查被引量:15
- 2019年
- 目的分析2010-2018年湖南省人间布鲁氏菌病(布病)的流行特征,并追溯该地区布病的感染来源,为该地区人间布病防控提供参考。方法采用Excel 2016和ArcGIS 10.5等软件对湖南省2010-2018年人间布病监测数据进行流行病学分析,采用例数、构成比和率描述疫情特征。采用常规分型方法对临床分离的2株布鲁氏菌的种型进行鉴定,采用UTS-PCR复核种型鉴定结果,并对菌株的6个毒力基因进行检测。采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)方法对临床分离布鲁氏菌进行聚类分析。结果2010-2018年湖南省共报告人间布病728例,年均发病率为0.12/10万,郴州市和永州市发病率居前,发病率分别为2.50/10万和1.90/10万。发病县(市、区)从2010年的5个增加到2018年的69个。45~54岁年龄组病例最多(279例),占38.32%(279/728),农民占59.07%(430/728),男女性别比为2.75∶1。5-7月报告病例最多,占45.33%(330/728),发病呈明显的夏秋季高发特征,发病高峰在5月。常规鉴定表明临床分离的2株布鲁氏菌是羊种1型布鲁氏菌,UTS-PCR鉴定显示菌株为羊种布鲁氏菌。6个毒力基因均被检出,菌株为强毒株。MLVA分析表明2株菌与来自内蒙古自治区从绵羊和骆驼分离的菌株具有完全相同的基因型。结论湖南省人间布病趋于严峻,疫情向非疫区和普通人群蔓延。湖南省分离的2株羊种布鲁氏菌起源于内蒙古地区。应加强动物转运的检疫检测,防止布病暴发流行。
- 刘志国王妙湛志飞湛志飞崔步云
- 关键词:布病流行病学
- 内蒙古自治区通辽市2004-2018年人间布鲁氏菌病流行病学特征分析被引量:9
- 2020年
- 目的分析内蒙古自治区通辽市2004-2018年人间布鲁氏菌病(布病)流行特点和菌株的起源与进化特征,为制定布病防控策略提供依据。方法对中国疾病预防控制信息系统中的通辽市布病报告数据进行分析,采用构成比和率描述流行病学特征。用常规鉴定方法鉴定菌株的种型,用AMOS-PCR对菌株的种型进行复核,采用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)对布鲁氏菌进行聚类分析,探讨菌株间的亲缘关系。结果2004-2018年通辽市共报告布病16704例,年均发病率为35.41/10万。扎鲁特旗和库伦旗的发病率较高,分别为110.51/10万和67.84/10万。40~54岁年龄组病例最多,占48.75%(8143/16704);农民14873例,占89.04%。男女性别比为2.40∶1。3-5月为发病高峰期,占56.30%(9405/16704),发病高峰在4月。常规鉴定表明临床分离菌株全部为羊种布鲁氏菌,羊1型3株,羊3型3株。AMOS-PCR鉴定显示全部为羊种布鲁氏菌。6株布鲁氏菌分为2个MLVA-11基因型(111和116),属于东地中海血统。MLVA-16聚类分析表明通辽地区的菌株与吉林省和黑龙江省的菌株具有较近的亲缘关系。结论2004-2018年通辽市布病疫情极为严重,有向周边地区蔓延的风险。应加强检测防控,防止疫情扩散。
- 杜松楠王占军于高娃崔焱岭陈俊杰胡楠张天承孟颖胡玉红张慧超刘志国
- 关键词:人间布鲁氏菌病流行病学羊种布鲁氏菌
- 内蒙古布鲁氏菌临床分离株多位点序列分型研究被引量:7
- 2016年
- 目的探讨临床分离布鲁氏菌的种群结构和遗传进化特征。方法布鲁氏菌标准参考菌株羊种16M,牛种544A和猪种1 330S作为对照菌株,采用多位点序列分型(Multiple locus sequence typing,MLST)方法对内蒙古地区分离的116株羊种布鲁氏菌进行分析,确定待测菌株的序列型(STs),用软件BioNumerics(Version 5.0)构建菌株的最小生成树。结果116株羊种布鲁氏菌全部为ST8型,9个MLST位点的变异完全相同,分离株种群结构单一;羊种菌的生物型与ST型无明显关联,ST8型菌系该地区的主要流行菌种,并与内蒙古地区先前分离羊种布鲁氏菌进化程度相同,且有密切的亲缘关系。结论羊种布鲁氏菌的序列分型(ST)与常规生物分型存在差异,ST8型菌可能具有较强的环境适应性和致病性。MLST是一种较好的羊布鲁氏菌种群和进化关系研究方法,但更适合于具有较大时间跨度和地理分布菌株间的流行病学调查。
- 刘志国王妙刘日宏赵鸿雁朴东日崔步云夏咸柱
- 关键词:布鲁氏菌临床分离株MLST
- 内蒙古乌兰察布布氏菌分离株种型鉴定及流行病学特征分析被引量:12
- 2016年
- 目的鉴定临床分离布氏菌种型,并分析患者的流行病学特征。方法以牛种、羊种、猪种标准参考菌株为试验对照,采用经典方法和VITEK2.0进行初步鉴定,用AMOS-PCR进行确证,并分析患者的流行病学特征。结果经典鉴定115株均为羊种菌,羊3型93株,羊1型22株;115株菌ProA、TyrA、URE和GlyA全部阳性;91株ELLM阳性、14株APPA阳性,提示均为布氏菌,其中羊种菌91株,猪种菌14株。与经典实验的鉴定符合率比较鉴定布氏菌属100%,鉴定布氏菌种为79%(91/115);AMOS-PCR均获得了约731bp的特异性扩增条带,证实全部为羊种菌。初诊患者84例,构成比为73%;临床表现以疼痛、发热、乏力、多汗居多;88例患者就诊前无用药史,2例有布病治疗史。结论 VITEK2.0是一种高效的布氏菌鉴定方法,但不能替代经典方法;羊种3型菌为该地区的主要流行菌种,再感染可能是慢性患者或有布病治疗史患者分离到布氏菌的主要因素,初诊、未用抗生素且症状典型是分离布氏菌的重要指标。
- 刘志国王妙刘日宏赵鸿雁朴冬日崔步云夏咸柱
- 关键词:布氏菌流行病学
- 多重荧光定量PCR方法鉴定布鲁氏菌属及牛羊种布鲁氏菌研究被引量:28
- 2012年
- 目的利用多重实时荧光PCR技术,建立快速鉴定布鲁氏菌的方法。方法根据布鲁氏菌特异性基因BCSP31,AlkB/IS711和BMEI1162/IS711的部分片段作为靶基因,分别设计探针引物,将扩增产物连接到PUCm18-T载体上,制备标准品及标准曲线,确定此方法的灵敏度。利用布鲁氏菌的其他生物型菌株和同源性较近的致病菌(汉赛巴尔通体、霍乱弧菌、土拉弗朗西斯菌、大肠杆菌O157∶H7、大肠杆菌O∶16、小肠结肠炎耶尔森菌O∶9、沙门氏菌N群血清型、嗜麦芽假单胞菌)验证所建立方法的特异性。通过布鲁氏菌标准菌株建立方法,优化体系后扩增97株地方株进行验证。结果应用多重Taq-Man荧光PCR技术检测布鲁氏菌结果显示,布鲁氏菌属、牛种布鲁氏菌和羊种布鲁氏菌有各自的荧光信号,而与其同源性较高的致病菌均未见荧光信号;由标准曲线可知该方法的单重和多重荧光PCR最低检测下限均约为102copy/μL(13~24fg/μL),是常规PCR灵敏度的100倍。结论建立的方法有灵敏度高、快速易操作等优点,可用于布鲁氏菌快速鉴定,并同时确定是否为牛种或羊种布鲁氏菌。
- 刘志国刘志国罗成旺张利姜海赵鸿雁朴东日田国忠
- 关键词:布鲁氏菌荧光定量聚合酶链式反应
- 内蒙古乌兰察布地区布鲁氏菌体外药物敏感性及耐药机制分析被引量:4
- 2019年
- 目的调查内蒙古乌兰察布地区分离布鲁氏菌的抗生素药物敏感(耐受)性特征。方法采用E-test法测定了85株布鲁氏菌对13种临床常用药物的敏感性;同时,对利福平和阿奇霉素的耐药机制进行了初步探讨;并采用K-B法对来自全国的149株羊种布鲁氏菌对复方新诺明和利福平的敏感性进行了筛查。结果试验表明布鲁氏菌对阿奇霉素、复方新诺明和利福平耐药菌株数分别为100%(85/85),7.0%(6/85)和1.0%(1/85)。所有菌株对司帕沙星、米诺环素、多西环素、四环素、链霉素、庆大霉素、左氧氟沙星、环丙沙星、头孢吡肟及头孢哌酮舒巴坦均表现为敏感;司帕沙星、米诺环素的MIC_(90)值(0.032μg/mL)最低。所有阿奇霉素耐药菌株的23S rRNA基因的第2632位碱基表现为T→C单位点突变,布鲁氏菌23S rRNA转肽酶中心的T/C点突变可能是一种羊种布鲁氏菌对阿奇霉素耐药的分子机制。K-B法筛查结果表明所有菌株对利福平敏感,25.5%(38/149)的菌株对复方新诺明耐药,耐药菌株分布于18个省市区。结论乌兰察布地区羊种布鲁氏菌耐药较为严重,应定期进行药物敏感性监测。推荐司帕沙星和米诺环素作为一线布病治疗药物。
- 刘志国王妙李晓燕塔娜赵鸿雁赵鸿雁朴东日李振军
- 关键词:布鲁氏菌药物敏感性耐药机制