高艳
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:中国疾病预防控制中心传染病预防控制所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学医药卫生更多>>
- 霍乱弧菌N16961超级整合子重复序列及基因盒分析
- 2010年
- 目的:确定O1群El Tor型霍乱弧菌N16961超级整合子(SI)中霍乱弧菌重复序列(VCR)的序列特点,以及VCR和基因盒的数量及位置。方法:用局部序列比对软件BLAST将VCR参考序列与霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体进行比对,用Artemis Comparison Tool查看比对结果获得比对区域的位置信息,并采用perl语言脚本获得霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体VCR相应区域的序列;用全局比对软件Clustal W将上一步获得的所有VCR序列进行多序列比对,采用perl语言脚本处理比对结果获得一致性序列;用MEGA4.0软件查看多序列比对结果,并采用perl语言脚本计算各位置变异频率,据此分析霍乱弧菌N16961的Ⅱ号染色体上VCR和基因盒的特点。结果:在N16961的超级整合子中有158个VCR,其核苷酸长度为117~124 bp;其一致性序列有126个核苷酸,其中37个为保守核苷酸位点,89个为可变核苷酸位点;139个VCR与相邻的VCR之间至少有1个基因,19个VCR相互之间没有任何基因;N16961的SI中共存在146个基因盒,基因盒大小为390~5924 bp不等,每个基因盒中整合的基因数目为1~9个不等。结论:建立了SI中VCR和基因盒的分析流程,分析了SI中VCR的保守及变异位点,明确了霍乱弧菌N16961的SI中VCR和基因盒的信息,为霍乱弧菌和其他细菌中SI的研究提供了分析基础。
- 高艳逄波杜鹏程王海印阚飙
- 关键词:霍乱弧菌基因盒
- 霍乱弧菌对肠道中胆盐胁迫作用的反应调节
- 2011年
- 作为肠道致病菌,霍乱弧菌必须耐受人体内的胃酸、胆盐、高渗和低氧等胁迫条件,才能在肠道定植、繁殖。胆盐由肝脏合成,在胆囊储存并分泌到肠道。其主要作用是帮助脂肪代谢,并有一定杀菌作用。本文综述了胆盐如何作用于霍乱弧菌,霍乱弧菌如何感受肠道内的胆盐刺激,并采用何种机制来耐受其杀菌作用。
- 高艳逄波阚飙
- 关键词:霍乱弧菌胆盐