徐金玲
- 作品数：6 被引量：11H指数：2
- 供职机构：深圳大学更多>>
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- 相关领域：理学医药卫生生物学更多>>
- 一种AD生物标记物及其检测方法
- 本发明公开一种AD生物标记物及其检测方法，包括Protein‑glutamine gamma‑glutamyltransferase E、Protein S100‑A12、Alpha‑2‑macroglobulin‑li...
- 王勇徐金玲李水明倪嘉缵
- 文献传递
- 高分辨飞行时间质谱在蛋白质组学相对定量分析中的应用被引量：8
- 2016年
- 利用Triple TOF 5600高分辨质谱仪分析牛血清白蛋白等3种蛋白质标准品,研究了质谱离子强度与蛋白质样品相对含量的相关性。蛋白质标准品用胰酶酶切后,稀释成1~1024 fmol/7μL的系列溶液,考察在1~1024 fmol上样量情况下,肽段的前体离子计数（cps）、蛋白质全部肽段的离子计数之和以及被检出肽段数目与上样量的相关性,以及相同样品在3次平行实验之间这些数值的变化幅度。结果表明。被检出肽段数目与上样量正相关,当cps超过1000时,所有肽段离子强度之和与上样量呈线性关系,但是用最灵敏肽段的离子强度表示更为准确。3次测量同一肽段的最高离子强度通常不会超过最低强度的1.5倍,提示当不同样品中同一蛋白的离子强度相差3倍以上是判断不同样品中相同蛋白质的含量具有差异的可靠阈值。本研究提供了一种利用高分辨率和高扫描速度蛋白质组组学定性数据进行半定量分析的方法,简便、快速,可为相关生物学和医学研究提供参考。
- 洪晓愉王浩徐金玲李水明王勇
- 关键词：定量蛋白质组学信号强度
- 纳升液相色谱-高分辨串联质谱研究冻存条件对唾液多肽组的影响被引量：4
- 2016年
- 唾液多肽组学为疾病相关的生物标记物研究提供了新方法,但冻存条件对分析结果的影响并不清楚。本研究采用氧化石墨烯-磷酸镧纳米复合材料分离富集唾液多肽,利用纳升液相色谱-高分辨串联质谱技术,考察唾液样品分别置于-80℃与-20℃冻存6个月后对唾液多肽组的影响。结果表明,在-80℃冻存条件下的唾液样品中,共鉴定出归属于33种蛋白的429条肽段;在-20℃冻存条件下的唾液样品中,鉴定出595条肽段,对应31种蛋白。实验结果表明,相比于-80℃,唾液置于-20℃条件下的新增加肽段主要来源于已有肽段的降解,并且唾液中的蛋白质也发生了一定降解。本研究在肽段序列水平上考察了冻存条件对多肽的影响,结果表明,-20℃冻存条件不适合长期保存用于多肽组分析的唾液样品。本研究结果可为相关医学研究提供借鉴。
- 徐金玲洪晓愉李水明王勇
- 关键词：唾液肽段
- 人唾液蛋白质组的纳升液相色谱-高分辨串联质谱鉴定及高丰度蛋白质分析被引量：1
- 2016年
- 常规的定性分析质谱数据能否以及如何应用于蛋白质组学的相对定量分析是实际工作中经常遇到的问题。本研究采用一维纳升液相色谱-高分辨串联质谱(nano-HPLC-Triple TOF 5600)法鉴定人唾液蛋白质组,并分析其基本组成,以探讨质谱数据与唾液中高丰度蛋白质的相关性。本实验共鉴定了6 044条特异性酶切肽段,归属于α-淀粉酶1、碳酸酐酶6、血清白蛋白、粘蛋白、半胱氨酸蛋白酶抑制剂和免疫球蛋白等各种已知的高丰度蛋白质在内的521个蛋白,这为一维纳升液相色谱分离条件下的唾液蛋白质组的基本组成分析提供了参考。结果表明,仅用蛋白质排序指标Unused值表征蛋白质的相对含量具有局限性,而蛋白质排序、检出肽段数目和肽段平均强度等综合指标与蛋白质相对含量具有正相关性,即排名较后的蛋白质均只有1条肽段被检出,且肽段强度较低。这说明,当蛋白质相对含量差别较大时,肽段的化学性质和电离效率差异对质谱信号的影响已不占主要地位,即可以认为当肽段检出数目、鉴定覆盖率和肽段强度均较低时,蛋白质的相对含量也较低。该结果可为利用Triple TOF 5600质谱仪的定性鉴定数据进行初步半定量判断提供参考,也可为唾液蛋白质组生物标志物研究提供借鉴。
- 石锴孔祥怡杜建时徐金玲李水明王勇赵晴
- 关键词：唾液蛋白质组高分辨质谱
- 阿尔茨海默症患者唾液生物标志物的多肽组学研究
- 阿尔茨海默症（Alzheimer’s disease,AD）,俗称老年痴呆症,是一类神经退行性疾病,AD病理学上以神经炎性斑（Neuritic Plaques,NPs）又称老年斑（Senile Plaques,SPs）、...
- 徐金玲
- 关键词：阿尔茨海默症唾液生物标志物质谱
- 文献传递
- 一种AD生物标记物及其检测方法
- 本发明公开一种AD生物标记物及其检测方法，包括Protein‑glutamine gamma‑glutamyltransferase E、Protein S100‑A12、Alpha‑2‑macroglobulin‑li...
- 王勇徐金玲李水明倪嘉缵
- 文献传递
