曾铮
- 作品数：1 被引量：1H指数：1
- 供职机构：天津师范大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家重点基础研究发展计划国家科技支撑计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 中国明对虾和中华绒螯蟹EST的Blast2GO注释及其在免疫基因分布研究中的应用被引量：1
- 2014年
- 以dbEST数据库中公布的中国明对虾和中华绒螯蟹的EST序列作为数据源,利用CAP3对其进行聚类拼接,采用Blast2GO软件进行功能注释,并通过查找免疫相关的GO注释和检索免疫关键词的方法寻找免疫相关基因,经与不同物种免疫基因的比较,推测可能的免疫基因序列,并进一步分析免疫基因在不同组织和细胞中的分布.结果表明,通过注释和关键词进行筛选这2种方法具有较好的互补性;预测了位于中国明对虾头胸部的60个可能的免疫基因以及位于中华绒螯蟹血细胞hemocyte、haemocyte、肝胰腺、性腺和精巢中的250个免疫基因,这些基因包括模式识别受体、抗氧化蛋白、抗菌肽、凝集素等,其中部分参与酚氧化酶原激活系统、Toll信号通路等重要免疫过程.中华绒螯蟹血细胞中具有种类丰富的免疫基因,与已有的甲壳动物免疫系统相符合.肝胰腺中发现了模式识别蛋白、蛋白酶以及数量众多的凝集素种类,提示肝胰腺在免疫过程中也发挥了一定作用.
- 曾铮张亦陈刘逸尘郝彤孙金生
- 关键词：中国明对虾中华绒螯蟹免疫基因EST
