赵康辰
- 作品数：47 被引量：118H指数：6
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- 相关领域：医药卫生农业科学生物学理学更多>>
- 一种大肠杆菌H血清型分型检测试剂盒及检测方法
- 本发明涉及一种大肠杆菌H血清型分型检测试剂盒，其包括扩增大肠杆菌H血清型H1～H12、H14～H21、H23～H49、H51～H56的PCR引物，引物序列见SEQ ID NO.1‑106，还包括H血清型分型标准物。本发明...
- 吴斌陈银朱小娟崔仑标吴涛葛以跃赵康辰朱凤才周明浩
- 重组酶介导的等温扩增技术结合CRISPR-Cas13a蛋白检测8种境外输入性病毒被引量：1
- 2022年
- 目的基于重组酶介导的扩增技术(recombinase aided amplification,RAA)和CRISPR(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)-Cas13a(CRISPR-associated protein 13a)检测,建立一种快速、灵敏且特异的重要境外输入性病毒检测方法。方法以流行性乙型脑炎病毒(Japanese encephalitis virus,JEV)、黄热病毒(Yellow fever virus,YEV)、西尼罗病毒(West Nile virus,WNV)、中东呼吸综合征冠状病毒(Middle East respiratory syndrome coronavirus,MERS-CoV)、埃博拉病毒(Ebola virus,EBOV)、登革病毒(Dengue virus,DENV)、裂谷热病毒(Rift Valley fever virus,RVFV)、寨卡病毒(Zika virus,ZIKV)为检测对象,设计特异性RAA扩增引物和CRISPR RNA(crRNA),建立RAA扩增结合CRISPR-Cas13a蛋白检测反应,评价方法的灵敏度和特异性,使用登革热疑似临床样本进行检测,并与荧光RT-PCR技术进行比较,同时检测其余7种病毒临床模拟样本。结果RAA扩增结合CRISPR-Cas13a蛋白检测方法能在39℃条件下,40~52 min内检测出8种输入性传染病病原体,灵敏度达到1~10拷贝/μl,并且这8种病原体之间无交叉反应,临床样本均可100%检测出。结论建立的RAA扩增结合CRISPR-Cas13a蛋白检测方法能够灵敏、特异且快速地检测出8种境外输入性传染病病原体。
- 郭悦安柏霖刘丹丹罗君红赵康辰朱小娟葛以跃吴宏斌崔仑标
- 关键词：输入性传染病病毒
- 基于逆转录-环介导等温扩增技术快速检测发热伴血小板减少综合征病毒方法的建立被引量：5
- 2014年
- 目的建立1种快速、特异、灵敏的发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)的检测方法。方法针对SFTSV M基因保守区域的核酸序列,设计逆转录-环介导等温扩增(RT-LAMP)特异性引物,优化反应体系和条件。用毛细管电泳法和横向流动试纸条(LFD)法检测扩增产物,建立RT-LAMP检测方法。进行敏感性、特异性检验,并与Real-time RT-PCR法进行比较。结果以LFD法和毛细管电泳法检测RT-LAMP扩增产物具有相同的敏感性和特异性;RT-LAMP-LFD检测SFTSV的敏感性为10copies RNA分子/反应,且与其他病毒无交叉反应。RT-LAMP-LFD和Real-time RT-PCR检测临床标本阳性率差异无统计学意义(P>0.05),2种方法一致性好(Kappa=0.918)。结论建立的RT-LAMP方法快速、简单、操作简单,具有较高的敏感性和特异性,适合应用于基层单位和现场SFTSV的快速检测。
- 葛以跃赵康辰崔仑标戚宇华郭喜玲陈银焦永军史智扬周明浩
- 关键词：发热伴血小板减少综合征布尼亚病毒
- 17例病毒性肺炎老年患者的临床特点及甲型H1N1流感病毒分子特征被引量：23
- 2018年
- 目的对17例老年甲型H1N1流感病毒性肺炎患者的临床和病原学检测结果进行分析,了解老年甲型H1N1流感病毒性肺炎的临床特点及病毒分子特征。方法收集2018年1~3月期间在南京市第一医院呼吸科住院的老年肺炎患者作为研究对象,通过呼吸道病毒核酸检查进行病例确诊。采集并分析病例的临床资料。扩增流感病毒全基因组后进行高通量测序,对测序结果进行生物信息学分析,研究病毒的抗原性、致病性和耐药性等生物学特征。结果入选的17例患者平均年龄为(73.8±10.8)岁,所有患者至少合并1种基础性疾病,7例存在合并感染。呼吸系统症状和发热是最为突出的临床表现,94.1%的患者伴有乳酸脱氢酶的增高,76.5%的患者影像学检查存在双肺病变,危重症患者双肺病变的比例高于重症患者。二代测序结果表明,病毒与疫苗株高度同源,HA基因同属于6B.1亚组,有3个抗原位点发生了变异(H138Y、S74R和S164T),1株病毒发生了NA的H275Y耐药变异。结论老年甲型H1N1流感病毒性肺炎患者多合并基础疾病,容易产生合并感染;应密切关注病毒的分子特征及关键氨基酸位点变异,为疫情防控和临床抗病毒治疗提供依据。
- 葛以跃谭焰陈晨吴涛朱小娟赵康辰王丽谷伟崔仑标
- 关键词：老年甲型H1N1流感肺炎分子特征
- 一种扩增甲型流感病毒全基因组试剂盒及制备方法和应用
- 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种扩增甲型流感病毒全基因组试剂盒及使用方法。本发明试剂盒包含反转录引物混合物、反转录缓冲液、反转录酶、PCR扩增缓冲液及DNA聚合酶。本发明根据甲型流感病毒设计一条反转录引物和一对通用型...
- 崔仑标葛以跃祁贤赵康辰郭喜玲朱小娟陈银焦永军史智扬周明浩
- 文献传递
- 重组酶聚合酶扩增结合横向流体试纸条快速检测人腺病毒被引量：4
- 2017年
- 目的 建立一种快速、敏感的人腺病毒等温核酸扩增检测方法.方法 针对人腺病毒hexon基因保守区序列设计特异性重组酶聚合酶扩增（RPA）引物及探针、优化反应时间和温度、用横向流体试纸条（LFD）和毛细管电泳检测扩增产物,建立人腺病毒RPA-LFD快速检测方法,评价该方法的敏感度和特异性并与Real-time PCR法比较.结果 RPA-LFD方法检测人腺病毒的最低检出限为2拷贝DNA分子/反应,且与其他呼吸道病原无交叉反应,临床样本检测结果与Real-time PCR法一致性为100％.结论 建立的RPA-LFD方法具有敏感性、特异性高、快速且不需要昂贵的仪器设备等优点,为人腺病毒快速检测提供了新工具.
- 赵康辰葛以跃崔仑标陈银史智扬朱凤才周明浩
- 关键词：腺病毒
- 甲型流感病毒高通量测序模板制备试剂盒及制备方法和应用
- 本发明属于生物技术领域，具体涉及一种甲型流感病毒高通量测序模板制备试剂盒及其制备方法和应用。本发明所述试剂盒包含反转录引物混合物、反转录缓冲液、反转录酶、RNase H、第二链合成缓冲液及第二链合成酶。本发明根据甲型流感...
- 崔仑标葛以跃祁贤赵康辰郭喜玲戚宇华焦永军史智扬周明浩
- 文献传递
- 一种核酸序列非依赖的全RNA扩增方法
- 本发明涉及一种核酸序列非依赖的全RNA扩增方法，首先在随机引物的5’端引入T7 RNA多聚酶启动子序列与固定序列用于合成RNA的互补cDNA，通过纯化去除多余引物后使用另一条5’端带有固定序列的随机引物合成第二链cDNA...
- 崔仑标葛以跃吴斌吴涛朱小娟赵康辰陈银朱凤才周明浩
- 文献传递
- 江苏省新型冠状病毒NSP1变异分析及其与临床分型的关系
- 2023年
- 目的探讨江苏省新型冠状病毒(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)非结构蛋白1(nonstructural protein 1,NSPl)变异情况及其与临床分型的关系。方法收集2020—2022年间江苏省SARS-CoV-2感染病例的样本及基本临床信息。对样本进行高通量测序,测序后的数据以Wuhan-Hu-1(GenBank:MN908947.3)为参考基因分析NSP1序列变异情况及其与临床分型的关系。使用DynaMut在线服务器分析突变氨基酸对蛋白质稳定性及分子柔韧性的影响。结果共收集病例样本1241例,NSP1基因同义突变61例,错义突变及缺失共487例,存在氨基酸变异的患者以无症状感染者(75.4%)为主,且病例临床分型严重程度更轻(Z=-24.8,P<0.01)。共发现NSP1蛋白出现11个非同义突变和1个缺失。N端中出现了8个稳定突变及1个失稳突变,2个突变增加了分子柔韧性;Linker区S135R的突变使蛋白质失稳但增加了柔韧性;C端R171C突变使蛋白质稳定但降低了柔韧性。NSP1蛋白稳定性降低的患者临床分型症状更轻。结论NSP1部分氨基酸的改变使蛋白结构发生变化,可能降低病毒的致病力,导致较轻的临床症状。
- 吴涛朱小娟乔乔迟莹赵康辰朱立国吴斌葛以跃崔仑标
- 关键词：稳定性临床分型
- 一种基于液相芯片检测微小核糖核酸的方法
- 本发明涉及一种检测核糖核酸的方法，尤其是一种检测微小核糖核酸(microRNA)的方法，属于生物技术领域。利用不对称PCR扩增结合液相芯片技术，先在生物样品中加入定量的外源性microRNA，将microRNA进行预扩增...
- 崔仑标葛以跃史智扬戚宇华赵康辰单云峰周明浩汪华
